header

Chemical Characterization and Antimicrobial Activity of Metabolites from Soil Bacteria and Endophytic Fungi Isolated from Certain Medicinal Plants Grown in Egypt / (Record no. 169068)

MARC details
000 -LEADER
fixed length control field 10506namaa22004331i 4500
003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER
control field OSt
005 - أخر تعامل مع التسجيلة
control field 20241204154423.0
008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION
fixed length control field 241126s2023 |||a|||fr|m|| 000 0 eng d
040 ## - CATALOGING SOURCE
Original cataloguing agency EG-GICUC
Language of cataloging eng
Transcribing agency EG-GICUC
Modifying agency EG-GICUC
Description conventions rda
041 0# - LANGUAGE CODE
Language code of text/sound track or separate title eng
Language code of summary or abstract eng
-- ara
043 ## - GEOGRAPHIC AREA CODE
Geographic area code f-ua---
049 ## - Acquisition Source
Acquisition Source Deposit
082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER
Classification number 581.634
092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC)
Classification number 581.634
Edition number 21
097 ## - Degree
Degree M.Sc
099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC)
Local Call Number Cai01.08.07.M.Sc.2023.Ah.C
100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME
Authority record control number or standard number Ahmed Adel Hamed Ahmed,
Preparation preparation.
245 10 - TITLE STATEMENT
Title Chemical Characterization and Antimicrobial Activity of Metabolites from Soil Bacteria and Endophytic Fungi Isolated from Certain Medicinal Plants Grown in Egypt /
Statement of responsibility, etc. by Ahmed Adel Hamed Ahmed ; Under the Supervision of Prof. Dr. Elsayed Ali Aboutabl, Prof. Dr. Fify Ibrahim Fathy, Prof. Dr. Ghada Ahmed Fawzy
246 15 - VARYING FORM OF TITLE
Title proper/short title التوصيف الكيميائى والنشاط المضاد للميكروبات للنواتج الأيضية لبكتريا التربة و الفطريات النباتية الداخلية المعزولة من بعض النباتات الطبية التى تنمو فى مصر /
264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE
Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice 2023.
300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION
Extent 100 pages ( Multiple numbering) :
Other physical details illustrations ;
Dimensions 25 cm. +
Accompanying material CD.
336 ## - CONTENT TYPE
Content type term text
Source rda content
337 ## - MEDIA TYPE
Media type term Unmediated
Source rdamedia
338 ## - CARRIER TYPE
Carrier type term volume
Source rdacarrier
502 ## - DISSERTATION NOTE
Dissertation note Thesis (M.Sc.)-Cairo University, 2023.
504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE
Bibliography, etc. note Bibliography: pages 23-29.
520 ## - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. Microbial metabolites have been identified as a reliable source of<br/>pharmaceuticals, including antibiotics and other categories. The prevalence<br/>of multidrug-resistant (MDR) pathogens has prompted us to search for<br/>potential natural antimicrobial agents. Actinomycetes are one of the most<br/>prolific sources of novel antibiotics, while endophytic fungi are one of the<br/>potential sources of biologically active natural products including<br/>antimicrobial and anti-Alzheimer agents.<br/>In-vitro antimicrobial screening of the isolated actinomycete from<br/>Egyptian soil revealed that Amycolatopsis keratiniphila DPA04 exerted a<br/>significant activity against Gram-positive bacteria. A. keratiniphila DPA04<br/>was subjected to cultivation on five different media, followed by chemical<br/>and antimicrobial evaluation of ethyl acetate extracts which revealed the<br/>activity of DPA04 strain when cultured on ISP-2 and M1 media against<br/>tested Gram-positive bacteria including Staphylococcus aureus, MRSA,<br/>Bacillus cereus and Listeria monocytogenes. Minimum inhibitory<br/>concentrations (MIC) values ranged from 19.5 to 39 μg/mL. Chemical<br/>analysis of the ethyl acetate extracts using ultra-high performance liquid<br/>chromatography-quadrupole time-of-flight mass spectrometry (UHPLC-<br/>QTOF) led to the identification of 45 metabolites of different chemical<br/>classes. In addition, ECO-0501, a structurally unique glycosidic polyketide<br/>antibiotic, was identified in the cultures with significant antimicrobial<br/>activity. Multidrug resistance in Staphylococcus aureus is reported to be<br/>related to the multidrug efflux pump (MATE). ECO-0501 and its related<br/>metabolites were subjected to molecular docking studies against the MATE<br/>receptor as a proposed mechanism of action. ECO-0501 and its derivatives<br/>(AK_1 and N-demethyl ECO-0501) displayed better binding scores than the<br/>co-crystallized 4HY inhibitor making them promising candidates as MATE<br/>inhibitors.<br/>In-vitro anticholinesterase investigation of the endophytic fungus<br/>Aspergillus niveus Fv-er401, isolated from Foeniculum vulgare (Apiaceae)<br/>roots, revealed that the ethyl acetate extract showed acetylcholinesterase<br/>(AChE) and butyrylcholinesterase (BuChE) inhibitory effects with IC50<br/>53.44 ± 1.57 and 48.46 ± 0.41 μg/mL, respectively. In addition, the chemical<br/>investigation using UHPLC-MS/MS analysis of the crude extract led to the<br/>identification of fifty-eight metabolites. Two known metabolites were<br/>isolated, terrequinone A and citrinin, showing moderate AChE and BuChE<br/>inhibitory activity using the Ellman’s method (IC50 = 11.10 ± 0.38 μg/mL<br/>and 5.06 ± 0.15 μg/mL, respectively for AChE, and IC50 15.63 ± 1.27 μg/mL<br/>and 8.02 ± 0.08 μg/mL, respectively for BuChE). As evidenced by molecular<br/>docking, the isolated compounds and other structurally related metabolites<br/>identified by molecular networking had the required structural features for<br/>AChE and BuChE inhibition. Varioxiranol G, penicitrinol B, dicitrinol A,<br/>and asterriquinone CT5, showed better binding scores as AChE and BuChE<br/>inhibitors than the co-crystallized inhibitor making them promising<br/>candidates for the development of new drugs to treat Alzheimer’s.<br/>In-vitro antimicrobial evaluation of the A.niveus Fv-er401 proved<br/>their significant activity against Gram-positive bacteria. The fungal isolate<br/>was cultured on five different media, which revealed the optimal activity of<br/>the fungal strain when cultured on Wickerham media against tested Gram-<br/>positive bacteria including Staphylococcus aureus, MRSA, Bacillus cereus<br/>and Listeria monocytogenes with MIC ranging from 39-156 μg/ml. This<br/>could be attributed to the presence of citrinin
520 ## - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. تعتبر النواتج الطبيعية الناتجة من الميكروبات من المصادر الموثوقة للأدوية ، بما في ذلك المضادات الحيوية. دفعنا انتشار البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية (MDR) إلى البحث عن نواتج طبيعية مضادة للميكروبات. تعد البكتريا الشعاعية أحد أكثر المصادر غزارة للمضادات الحيوية الجديدة. من ناحية أخرى ، تعد الفطريات النباتية الداخلية من أكثر المصادر الجديدة المحتملة للمنتجات الطبيعية الفعالة بيولوجيا بما في ذلك العوامل المضادة لمرض الزهايمر.<br/>أظهرالفحص المضادات للميكروبات لبعض البكتيريا الشعاعية المعزولة من التربة المصرية أن بكتيريا اميكولاتوبسيس كيراتينفيليا اظهرت فعالية ضد البكتيريا موجبة الجرام. كشف التنميط الزراعي للبكتيريا ، متبوعًا بالتقييم الكيميائي والمضاد للميكروبات ، عن نشاط البكتيريا المسبق ذكرها عند زراعتها على بيئتى ISP-2 و M1 ضد البكتيريا موجبة الجرام. تراوحت قيم التركيزات الدنيا المثبطة (MIC) من 19.5 إلى 39 ميكروغرام / مل. أدى التحليل الكيميائي لمستخلصات خلات الايثيل باستخدام الكروماتوغرافيا السائلة فائقة الأداء المقترن بمقياس الطيف الكتلي (UHPLC-QTOF) إلى التعرف على 45 مركبا من فئات كيميائية مختلفة. بالإضافة إلى ذلك ، تم التعرف على ECO-0501 في المستخلصات ذات النشاط الكبير المضاد للميكروبات. ترجع المقاومة للمضادات الحيوية في S. aureus الى مضخة تدفق الأدوية المتعددة (MATE). تم إخضاع ECO-0501 والمركبات القريبة له كيميائيا منه لدراسات الالتحام الجزيئي ضد مستقبل MATE كآلية مقترحة للفعالية. كان لـ ECO-0501 ومشتقاته (AK_1 و N-demethyl ECO-0501) درجات ربط أفضل من مثبط 4HY المتبلور المشترك مما يجعلها مرشحة واعدة كمثبطات MATE.<br/>أظهر فحص مضادات الكولينستراز للفطر النباتى الداخلى اسبيرجليس نيفيس، المعزول من جذور الشمر، أن مستخلص خلات الإيثيل أظهر تأثيرات تثبيط أسيتيل كولينستراز و بيوتيريل كولينستراز. بالإضافة إلى ذلك ، أدى الفحص الكيميائي باستخدام تحليل UHPLC-MS / MS للمستخلص الخام إلى التعرف على ثمانية وخمسين مركبا. تم فصل مركبين معروفين ، وهما Terrequinone A و Citrinin ، اظهر المركبان نشاطًا مثبطًا لـلاسيتيل و البيوتيريل كولينستراز. كما يتضح من الالتحام الجزيئي ، فإن المركبات المفصولة وغيرها من مشتقاتها التي تم تحديدها بواسطة الربط الشبكى الكيميائي ان لها السمات المطلوبة لتثبيط الاسيتيل و البيوتيريل كولينستراز. حيث أظهر Varioxiranol G و Penicitrinol B و Dicitrinol A و Asterriquinone CT5 درجات ربط أفضل كمثبطات الاسيتيل و البيوتيريل كولينستراز من مثبط التبلور المشترك مما يجعلهم مرشحين واعدين لتطوير أدوية جديدة لعلاج مرض الزهايمر.<br/>اظهر الفحص بمضادات الميكروبات لـفطر اسبيرجيلس نيفيس نشاطًا كبيرًا ضد البكتيريا موجبة الجرام. تمت زراعة الفطر على خمس أوساط مختلفة ، مما أظهر أن نشاط السلالة الفطرية كان الأفضل عند زراعتها على وسط Wickerham ضد البكتيريا موجبة الجرام المختبرة بما في ذلك Staphylococcus aureus و MRSA و Bacillus cereus و Listeria monocytogenes مع حد ادنى للتركيز المثبط تتراوح من 39-156 ميكروغرام / مل. ترجع الفعالية الكبيرة ضد البكتيريا موجبة الجرام إلى وجود مركب citrinin.<br/>
530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE
Issues CD Issued also as CD
546 ## - LANGUAGE NOTE
Text Language Text in English and abstract in Arabic & English.
650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element Medicinal plants ‪
Source of heading or term qrmak
653 #0 - INDEX TERM--UNCONTROLLED
Uncontrolled term actinomycetes
-- Amycolatopsis
-- antibiotics
-- Egyptian soil
-- molecular docking
-- ECO-0501
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Elsayed Ali Aboutabl
Relator term thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Fify Ibrahim Fathy
Relator term thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Ghada Ahmed Fawzy
Relator term thesis advisor.
900 ## - Thesis Information
Grant date 01-01-2023
Supervisory body Elsayed Ali Aboutabl
-- Fify Ibrahim Fathy
-- Ghada Ahmed Fawzy
Discussion body Hanaa Ahmed Hassan Kassem
-- Khaled Ahmed Saad Shams
Universities Cairo University
Faculties Faculty of Pharmacy
Department Department of Pharmacognosy
905 ## - Cataloger and Reviser Names
Cataloger Name Eman Ghareeb
Reviser Names Huda
942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA)
Source of classification or shelving scheme Dewey Decimal Classification
Koha item type Thesis
Edition 21
Suppress in OPAC No
Holdings
Source of classification or shelving scheme Home library Current library Date acquired Inventory number Full call number Barcode Date last seen Effective from Koha item type
Dewey Decimal Classification المكتبة المركزبة الجديدة - جامعة القاهرة قاعة الرسائل الجامعية - الدور الاول 26.11.2024 89095 Cai01.08.07.M.Sc.2023.Ah.C 01010110089095000 26.11.2024 26.11.2024 Thesis