MARC details
| 000 -LEADER |
|---|
| fixed length control field |
09517namaa22004331i 4500 |
| 003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER |
|---|
| control field |
OSt |
| 005 - أخر تعامل مع التسجيلة |
|---|
| control field |
20250223033407.0 |
| 008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION |
|---|
| fixed length control field |
250109s2024 |||a|||fr|m|| 000 0 eng d |
| 040 ## - CATALOGING SOURCE |
|---|
| Original cataloguing agency |
EG-GICUC |
| Language of cataloging |
eng |
| Transcribing agency |
EG-GICUC |
| Modifying agency |
EG-GICUC |
| Description conventions |
rda |
| 041 0# - LANGUAGE CODE |
|---|
| Language code of text/sound track or separate title |
eng |
| Language code of summary or abstract |
eng |
| -- |
ara |
| 049 ## - Acquisition Source |
|---|
| Acquisition Source |
Deposit |
| 082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER |
|---|
| Classification number |
615.19 |
| 092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC) |
|---|
| Classification number |
615.19 |
| Edition number |
21 |
| 097 ## - Degree |
|---|
| Degree |
Ph.D |
| 099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC) |
|---|
| Local Call Number |
Cai01.08.06.Ph.D.2024.No.E |
| 100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Authority record control number or standard number |
Noha Adel Ahmed, |
| Preparation |
preparation. |
| 245 10 - TITLE STATEMENT |
|---|
| Title |
Exploring human /environmental microbiota for novel oral probiotic bacterial candidate(s) / |
| Statement of responsibility, etc. |
by Noha Adel Ahmed ; Under the supervision of Prof. Dr. Yasser El-Mohammadi Ragab, Prof. Dr. Rania Abd El-Monem Khattab, Assoc. Prof. Dr. Mariam Hassan Haikal. |
| 246 15 - VARYING FORM OF TITLE |
|---|
| Title proper/short title |
استكشاف الميكروبيوتا البشرية البيئية من اجل الحصول على بكتيريا بروبيوتيك فموية جديدة / |
| 264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE |
|---|
| Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice |
2024. |
| 300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION |
|---|
| Extent |
105 pages : |
| Other physical details |
illustrations ; |
| Dimensions |
25 cm. + |
| Accompanying material |
CD. |
| 336 ## - CONTENT TYPE |
|---|
| Content type term |
text |
| Source |
rda content |
| 337 ## - MEDIA TYPE |
|---|
| Media type term |
Unmediated |
| Source |
rdamedia |
| 338 ## - CARRIER TYPE |
|---|
| Carrier type term |
volume |
| Source |
rdacarrier |
| 502 ## - DISSERTATION NOTE |
|---|
| Dissertation note |
Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2024. |
| 504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE |
|---|
| Bibliography, etc. note |
Bibliography: pages 85-105. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
The gut microbiota presents a promising reservoir of novel probiotics. This<br/>study evaluates the probiotic characteristics and safety profiles of two Enterococcus<br/>lactis strains and Enterococcus avium T54A, all isolated from the human gut<br/>microbiota, employing a combination of in vitro and in silico methodologies. All<br/>three isolated Enterococcus strains, namely 10NA, 50NA, and T54A, have exhibited<br/>robust survival in the face of bile concentrations up to 0.7% (w/v) for a duration of<br/>24 hours. Furthermore, these strains have demonstrated their ability to withstand<br/>acidic conditions, with survival rates exceeding 98% for up to 1.5 hours. The E. lactis<br/>strains have displayed notable antibacterial activity against Escherichia coli,<br/>Salmonella typhi, and Clostridioides difficile, whereas E. avium T54A selectively<br/>exhibits antibacterial activity against C. difficile. In comprehensive safety assays,<br/>none of the strains have demonstrated hemolysis on blood agar, and their impact on<br/>Caco-2 cell survival has proven to be statistically non-significant (p-value ≥ 0.05)<br/>when compared to control. These assessments of Caco-2 cell survival encompassed<br/>various concentrations of cell-free supernatants, including 100% (v/v), 50% (v/v),<br/>10% (v/v), and 5% (v/v). Additionally, regarding antibiotic susceptibility, all strains<br/>have displayed sensitivity to vancomycin, tetracycline, and chloramphenicol, with<br/>the unique feature of E. avium T54A being sensitive to gentamicin. The results of<br/>whole-genome analysis revealed no associations of virulence or antibiotic resistance<br/>genes with mobile genetic elements. Comparative genomic analysis of the E. lactis<br/>strains alongside closely related E. faecium species genomes underscores the<br/>genomic safety of the E. lactis species. Exploring E. avium T54A's genome through<br/>the KEGG database has unveiled complete pathways for the synthesis of eight<br/>essential amino acids and various vitamins. Comparative genomic analysis involving<br/>E. avium species, in conjunction with 132 bacterial species across five phyla,<br/>focusing on genes responsible for nutrient synthesis, has distinctively clustered<br/>E. avium species, as illuminated through principal component analysis (PCA).<br/>Moreover, the evaluation of genetic safety through mobile genetic element (MGE)<br/>analysis, involving E. avium strains, has confirmed the safety profile of our strain,<br/>which is one of only ten strains devoid of concerning antibiotic resistance, virulence,<br/>or any mobile genetic elements. Using the E. lactis 50NA strain, we investigated the<br/>effects of probiotic ingestion on microbiota composition during developmental<br/>stages using a murine model and microbiome analysis. This study has unveiled<br/>alterations in the relative abundance of specific taxa, dependent on the probiotic<br/>species. Importantly, some of these changes in relative abundance persisted even<br/>after the cessation of probiotics. These findings emphasize the prolonged and<br/>species-dependent impact of introducing probiotics during developmental stages on<br/>microbiota diversity. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
تمثل ميكروبيوتا الأمعاء خزانًا واعدًا للبروبيوتيك الجديدة. تقيم هذه الدراسة خصائص البروبيوتيك وملامح السلامة لسلالتين من Enterococcus lactis وEnterococcus aviumT54A، وجميعها معزولة من ميكروبيوتا الأمعاء البشرية، باستخدام مزيج من منهجيات المختبر والسيليكو. أظهرت جميع سلالات Enterococcus المعزولة الثلاثة، وهي 10NA و50NA وT54A، قدرة مرتفعة على البقاء على قيد الحياة في مواجهة تركيزات الصفراء التي تصل إلى 0.7٪ (وزن/حجم) لمدة 24 ساعة. علاوة على ذلك، أثبتت هذه السلالات قدرتها على تحمل الظروف الحمضية، حيث تجاوزت معدلات البقاء على قيد الحياة 98٪ لمدة تصل إلى ساعة ونصف. أظهرت سلالات E. lactis نشاطًا مضادًا للبكتيريا ملحوظًا ضدEscherichia coli وSalmonella typhi وClostridioides difficile، في حين أظهرت E. avium T54A نشاطًا مضادًا للبكتيريا بشكل انتقائي ضد .C. difficile أما فيما يخص فحوصات السلامة الشاملة، لم تظهر أي من السلالات انحلال الدم على أجار الدم، وقد ثبت أن تأثيرها على بقاء خلايا Caco-2 غير ذات دلالة إحصائية(p ≥ 0.05) عند مقارنتها بالحكم. وشملت تقييمات بقاء خلايا Caco-2 تركيزات مختلفة من طاف مستنبتات الخالية من الخلايا، بما في ذلك 100٪ (حجم/حجم) و 50٪ (حجم/حجم) و 10٪ (حجم/حجم) و 5٪ (حجم/حجم). أما فيما يتعلق بالحساسية تجاه المضادات الحيوية، أظهرت جميع السلالات حساسية تجاه الفانكومايسين والتتراسيكلين والكلورامفينيكول، مع الميزة الفريدة لـ E. avium T54A كونها حساسة للجنتاميسين. كشفت نتائج تحليل الجينوم الكامل عن عدم وجود ارتباطات بين الفوعة أو جينات مقاومة المضادات الحيوية والعناصر الوراثية المتنقلة. يؤكد التحليل الجينومي المقارن لسلالات E. lactis جنبًا إلى جنب مع جينومات نوعE. faecium ذي الصلة الوثيقة على السلامة الجينية لنوع .E. lactis كشف استكشاف جينومE. avium T54A من خلال قاعدة بيانات KEGG عن مسارات كاملة لتخليق ثمانية أحماض أمينية أساسية وفيتامينات مختلفة. التحليل الجينومي المقارن الذي يشمل نوع E. avium، بالاشتراك مع 132 نوعًا بكتيريًا عبر خمس شعب، مع التركيز على الجينات المسؤولة عن تخليق المغذيات، قام بتجميع نوع E. avium بشكل مميز، كما تم توضيحه من خلال تحليل المكونات الرئيسية .(PCA) علاوة على ذلك، فإن تقييم السلامة الوراثية من خلال تحليل العنصر الوراثي المتنقل (MGE)، الذي يشمل سلالاتE. avium ، قد أكد ملف السلامة لسلالتنا، والتي تعد واحدة من عشر سلالات فقط خالية من مقاومة المضادات الحيوية، أو الفوعة، أو أي جينات وراثية متنقلة. من خلال استخدام سلالة E. lactis 50NA، قمنا بدراسة آثار تناول البروبيوتيك على تكوين الميكروبيوتا خلال مراحل النمو باستخدام نموذج الفئران وتحليل الميكروبيوم. كشفت هذه الدراسة عن تغييرات في الوفرة النسبية لأصناف محددة، تعتمد على أنواع البروبيوتيك. والأهم من ذلك أن بعض هذه التغييرات في الوفرة النسبية استمرت حتى بعد توقف البروبيوتيك. تؤكد هذه النتائج على التأثير المطول والمعتمد على الأنواع لإدخال البروبيوتيك خلال مراحل النمو على تنوع الميكروبيوتا. |
| 530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE |
|---|
| Issues CD |
Issued also as CD |
| 546 ## - LANGUAGE NOTE |
|---|
| Text Language |
Text in English and abstract in Arabic & English. |
| 650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Topical term or geographic name entry element |
Pharmaceutical Chemistry |
| Source of heading or term |
qrmak |
| 653 #0 - INDEX TERM--UNCONTROLLED |
|---|
| Uncontrolled term |
Enterococcus faecium |
| -- |
Human stool |
| -- |
Whole genome sequencing |
| -- |
CRISPR-cas |
| -- |
Antibiotic resistance |
| -- |
Essential amino acids |
| -- |
Microbiome analysis |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Yasser El-Mohammadi Ragab |
| Relator term |
thesis advisor. |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Rania Abd El-Monem Khattab |
| Relator term |
thesis advisor. |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Mariam Hassan Haikal |
| Relator term |
thesis advisor. |
| 900 ## - Thesis Information |
|---|
| Grant date |
01-01-2024 |
| Supervisory body |
Yasser El-Mohammadi Ragab |
| -- |
Rania Abd El-Monem Khattab |
| -- |
Mariam Hassan Haikal |
| Universities |
Cairo University |
| Faculties |
Faculty of Pharmacy |
| Department |
Department of Microbiology & Immunology |
| 905 ## - Cataloger and Reviser Names |
|---|
| Cataloger Name |
Eman Ghareeb |
| Reviser Names |
Huda |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) |
|---|
| Source of classification or shelving scheme |
Dewey Decimal Classification |
| Koha item type |
Thesis |
| Edition |
21 |
| Suppress in OPAC |
No |
