TMPRSS2 gene Polymorphisms as Predictive Biomarkers for Severe Outcome in COVID-19 / By Heba Marei Zayed Abdel-Gaber; Under Supervision of Prof. Dr. Amal Mohamed Sayed Hassan, Prof. Dr. Howayda Ezz El Din Gomaa, Dr. Maha Ali Khalaf Ali, Dr. Riem Medhat El-Messiery.

Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.

Bibliography: pages 102-129.

TMPRSS2 is a host serine protease that mediates entry of the SARS-CoV-2 into host cells. Polymorphisms of TMPRSS2 gene may influence severity of Coronavirus disease 2019 (COVID-19).
Aim of the Work: We aimed to assess TMPRSS2 gene polymorphisms rs2070788 and rs383510 as risk factors affecting severity and outcome of COVID-19.
Patients and Methods: Our study was conducted at Kasr Alainy Hospitals ICU and outpatient clinics, Cairo University over one year. A total of 100 COVID-19 cases were included. TMPRSS2 polymorphisms rs2070788 and rs383510 genotyping was done by Real-Time PCR.
Results: There was no association between rs2070788 and rs383510 genotypes and COVID-19 severity. C allele of rs383510 is more prevalent in severe COVID-19 cases. Serum levels of ferritin, CRP and IL-6 had moderate diagnostic performance in predicting development of complications and COVID-19 associated mortality.
Conclusion: No association between TMPRSS2 gene polymorphisms rs2070788 and rs383510 genotypes and COVID-19 severity.

على عكس الفيروسات التاجية الأخرى (فيروسات كورونا)، كان لـ SARS-CoV-2 (المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة Coronavirus-2) انتشار عالمي أكبر بكثير وأثر على عدد أكبر من الأشخاص مقارنة بـ SARS-CoV وMERS-CoV (متلازمة الشرق الأوسط التنفسية التاجية).
تم تسجيل التباين بين الأفراد فيما يتعلق بوقوع وشدة ومعدل الوفيات الناجمة عن تفشي مرض فيروس كورونا 2019 (COVID-19). وبالتالي، مطلوب نهج مختلف لتحليل العدوى. قد يكون علم الوراثة البشري، حيث تعدد الأشكال الجينية المختلفة لجينات معينة، مسؤولاً عن القابلية العالية والنتائج غير المتوقعة لعدوى COVID-19 في مجموعات سكانية مختلفة. أما بالنسبة للحالات متعددة العوامل الأخرى، فقد يكون هذا التباين مرتبطًا بالاختلافات البيئية بين البلدان، مثل الوصول إلى الرعاية الطبية والهيكل العمري للسكان؛ ومع ذلك، قد يكون مرتبطًا أيضًا بالتنوع الجيني البشري. مع تقدم تفشي مرض فيروس كورونا 2019 (COVID-19)، فإن العلامات التنبؤية للتعرف المبكر على الأفراد المعرضين لمخاطر عالية هي حاجة طبية ملحة.
كانت جهود المجتمع العلمي للتحقيق في المؤشرات الحيوية للتنبؤ بمخاطر وشدة العدوى شاقة منذ ديسمبر 2019 حتى الآن. تم نشر قدر كبير من الأعمال في هذا الصدد، بما في ذلك المراجعات والمراجعات المنهجية. على الرغم من وجود بعض الإجماع على المؤشرات الحيوية التي يمكنها تتبع تطور المرض (بشكل رئيسي السيتوكينات المؤيدة للالتهابات، الفيريتين، إلخ)، لا يوجد مؤشر حيوي يمكنه التنبؤ بتطور المرض من خط الأساس.
قد يفسر تعدد الأشكال الجيني جزءًا من هذه القابلية للعدوى، مما أدى إلى عشرات المنشورات التي تقترح العديد من تعدد الأشكال والتغيرات الجينية الأخرى المرتبطة بالتعرض لعدوى COVID-19 وشدتها.
كشفت الدراسة البحثية الحالية أن التدخين وعامل السن كان مرتبط بشدة المرض، ولوحظ انخفاض في تشبع الأكسجين وأعراض أخرى مثل الإرهاق.
فيما يتعلق بالنتائج المعملية، لوحظ ارتفاع ferritin وCRP وIL-6 وخاصة بين الحالات الشديدة ويمكن الإعتماد عليها في توقع شدة المرض والتعرض للمضاعفات أو الوفاة.
وكانت متلازمة الضائقة التنفسية الحادة أكثر المضاعفات شيوعًا بين مرضى الدراسة بنسبة (18٪) وبلغ معدل الوفيات بين الحالات الشديدة 12٪.
فيما يتعلق ب TMPRSS2،كشفت نتائج دراستنا أنه لا يوجد ارتباط بين الأنماط الجينية rs383510 وrs2070788 وشدة COVID-19، إلا أن النمط الجيني rs2070788 AA كان مرتبطًا بأقل مستويات الهيموجلوبين في الحالات الشديدة وآلام البطن أكثر شيوعًا في الحالات الخفيفة. ولكن فيما يتعلق بالتردد الأليلي، كان أليل rs383510 C أكثر تواجدا بين الحالات الشديدة.

Issued also as CD

Text in English and abstract in Arabic & English.