Ectopic viral integration site 1(EVI1) gene expression and rearrangement in Egyptian acute myeloid leukaemia patients / by Hend Gamal Abd Elbasset ; supervision of Prof. Dr. Ragia Hussein Badawy , Prof. Dr. Naglaa Mostafa Hassan , Dr. Reem Nabil Mahmoud

Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.

Bibliography: pages 228-246.

Background: Acute leukemia is a common health problem in adults and children; however, its exact molecular etiology is still unclear.
Aim: to determine the expression of EVI-1 gene in acute myeloid leukemia, detect EVI-1 gene rearrangement, rule out the association between EVI-1 gene expression and EVI-1 gene rearrangement in AML, evaluate the relation between EVI-1 gene expression and other clinical and laboratory prognostic criteria and its effect on response to treatment in AML & to find out the value of EVI-1 over expression as prognostic marker and risk management of AML.

Methods: The expression of EVI-1 was assessed in the bone marrow of 101 de-novo acute myeloid leukemia patients, compared to 20 control subjects. EVI-1 gene aberrations were also assessed in 69 AML patients using Fluorescence in situ hybridization (FISH) technique.
Results: There was no significant difference between AML patients and control group [0.150 (0.0-641) vs 0.953 (0.179-1.68) in EVI-1 expression; respectively, P=0.082]. The sensitivity, specificity, AUC of EVI-1 in AML patients was (67.3%, 60%, 0.667; respectively P =0.082). Four patients showed EVI-1 amplification in hyper diploid karyotypes, of which one patient has EVI-1 overexpression by RT-PCR and three show low EVI-1 expression by RT-PCR. AML patients with EVI-1 low expression were positively associated with t (8;21) (q22; q22) RUNX1:RUNX1T1 fusion, favorable recurrent translocation, and low genetic risk (P=0.037, P=0.023, and P=0.013; respectively). There was a significant association between low EVI-1 expression and prolonged overall survival (OS) in AML patients, while there was no significant association with the disease-free survival (DFS) (P=0.048 and P=0.419).
Conclusion: EVI-1 expression could be a helpful prognostic, and predictive biomarker for acute leukemia especially in AML patients.
Abbreviations: EVI-1: Ectopic viral integration site, AML: Acute myeloid leukemia, FISH: Fluorescence insitu hybridization, RT-PCR: Real time Polymerase chain reaction, RUNX1: Runt- related transcription factor1, AUC: area under the curve, OS: overall survival, DFS: disease free survival, IRB: Institutional review board.
Preregistration: Ethical approval for this research was provided by the ethical committee of the National Cancer Institute, Cairo University, Institutional Review Board with approval number of (Ethical committee: 201617093.3, IRB00004025).

سرطان الدم الميلودى الحاد هو ورم دموي عدواني. هو مجموعة غير متجانسة من سرطانات الدم العدوانية التي تظهر تباينا واسعا في دوراتها السريرية واستجابة للعلاج.
بروتو-أونكوجين (EVI1) ، ويقع على كروموسوم 3q26و يمكن الكشف عنها في الأنسجة المكونة للدم كما ثبت أن التعبيرالجينى لجين EVI1 هو الأعلى في الخلايا التى لديها CD34+ + CD38 .
في تصنيف منظمة الصحة العالمية لعام 2008 ، تم دمج سرطان الدم الميلودى الحاد مع الجين (3) (q21;q26.2) أو t (3 ؛ 3) (q21 ؛ q26.2) ككيان منفصل في فئة سرطان الدم الميلودى الحاد مع تشوهات وراثية متكررة.
تم تضمين الانحرافات Inv (3) / t (3؛ 3) ، التي تحدد مجموعة فرعية من سرطان الدم الميلودى الحاد شديدة المقاومة للعلاج ، كعلامات تنبؤية ضعيفة في التجارب السريرية الرئيسية وهي جزء من إدارة المخاطر في علاج سرطان الدم الميلودى الحاد للبالغين. .
تم إجراء هذه الدراسة لتحديد التعبير الجيني EVI1 في ابيضاض الدم النخاعي الحاد ، واكتشاف إعادة ترتيب الجين EVI1 ، واستبعاد الارتباط بين التعبير الجيني EVI1 وإعادة ترتيب الجين EVI1 في سرطان الدم الميلودى الحاد ، وتقييم العلاقة بين التعبير الجيني EVI وغيرها من ا معايير الإنذار المعملية وتأثيرها على الاستجابة للعلاج في مكافحة واستبعاد قيمة تاثير EVI1 على التعبير كعلامة تنبؤية وإدارة مخاطر سرطان الدم الميلودى الحاد.
أجريت دراستنا على 101 مريضًا تم تشخيصهم حديثًا بمرض سرطان الدم الميلودى الحاد في عيادات أورام الدم للأطفال والبالغين في المعهد القومي للسرطان ، جامعة القاهرة ، والتي تم جمعها من مارس 2016 حتى نهاية ديسمبر 2017 ، حيث تم أخذ 20 من الأشخاص الأصحاء المتطابقين من العمر والجنس كمجموعة تحكم للإشارة إلى المستويات القياسية للتعبير الجيني EVI-1 في مرضى سرطان الدم الميلودى الحاد لدينا. تمت متابعة المرضى طوال فترة الدراسة (5 سنوات) بمتوسط متابعة يصل إلى 3.22 شهرًا.
أظهرت البيانات الحالية أنه تم الإفراط في التعبير عن EVI-1 في 32.7 ٪ من حالات سرطان الدم الميلودى الحاد.
لم يكن هناك ارتباط بين التعبير الجيني EVI-1 و FLT3-ITD ، FLT3-TKD ولا NPMا. لم تكن هناك علاقة ذات دلالة إحصائية بين التعبير الجيني EVI-1 في مجموعات الخطر المختلفة. ومع ذلك ، كان هناك ارتباط ذو دلالة إحصائية بين التعبير الجيني EVI-1 والتقسيم الطبقي للمخاطر الجينية لمرضى سرطان الدم الميلودى الحاد عندما استخدمنا متوسط قطع التعبير EVI-1 (0.15) حيث تم تصنيف المعبرين إيفي-1 عالية في الغالب بين المرضى ذوي المخاطر المتوسطة من المرضى ذوي المخاطر المنخفضة في P value=0.13)). كان لا يوجد ارتباط بين انخفاض مؤشرEVI-1 التعبير مع نقل المتكررة مواتية (Inv.16),(t(8;21))) مع قيمة (P-value =0.083). عندما طبقنا متوسط قطع (0.15) ، كان هناك ارتباط ذو دلالة إحصائية في نتائجنا التي أظهرت ارتفاع مؤشر EVI-1 حيث ارتبطت التعبيرات بشكل إيجابي مع +8 في (P value =0.007) ولم تكن موجودة في كثير من الأحيان في الأنماط من مجموعة منخفضة المخاطر كما هو الحال في المرضى الذين يعانون من التبادل الجزيئى Inv.16),(t(8;21)))). أيضا ، وجدنا علاقة ذات دلالة إحصائية بين مؤشر EVI-1 ذات التعبير المنخفض و t(8;21))). في) (P value=0.037.أيضا كان هناك ارتباط كبير بين EVI-1 ذات التعبير المنخفض و نقل الجزيئية من Inv.16),(t(8;21))). في (P value=0.023).أظهرت البيانات الحالية أنه لا يوجد ارتباط كبير بين مستو أظهرت البيانات الحالية أنه لا يوجد ارتباط كبير بين مستويات التعبير EVI-1 وتحقيق الشفاء التام في مرضى سرطان الدم الميلودى الحاد. كان هناك ارتباط كبير بين تعبير EVI-1 المنخفض ومعدل النجاة بشكل عام المطول في مرضى سرطان الدم الميلودى الحاد. بينما لم يكن هناك ارتباط كبير بين تعبير EVI-1 ومعدلات البقاء على قيد الحياة خالية من الامراض ، على الرغم من أن المرضى الذين يعانون من تعبير EVI-1 المنخفض كان لديهم معدل البقاء على قيد الحياة خالية من الامراض طويل الأمد.
في الختام ، أوضحت الدراسة الحالية أن تعبير EVI-1 يمكن أن يكون مؤشرًا بيولوجيًا تشخيصيًا وإنذاريًا وتنبئيًا مفيدًا لمرضى اللوكيميا الحادة خاصة المصابين سرطان الدم الميلودى الحاد. حيث يمكن استخدامه لتحديد مرضى سرطان الدم الميلودى الحاد الذين يعانون من t (8 ؛ 21) (q22 ؛ q22) RUNX1: اندماج RUNX1T1 ، والانتقال المتكرر ، وأولئك الذين يعانون من مخاطر وراثية منخفضة. أيضًا ، يعتبر علامة تنبؤية سلبية لمعدلات البقاء على قيد الحياة الإجمالية لمرضى سرطان الدم الميلودى الحاد. ومع ذلك ، قد تشير التحقيقات الإضافية التي أجريت على عدد أكبر من المرضى إلى كيف يمكن أن يؤثر تعبير EVI-1 على تشخيص ونتائج مرضى سرطان الدم الحاد ، إما بمفرده أو في سياق المعلمات الجزيئية والسريرية الأخرى.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.