Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2024.

Bibliography: pages 111-122.

Eimeria spp. is a common protozoan parasite that infects domestic pigeons (Columba livia domestica) globally. This study aimed to detect the incidence and morphometric identification of Eimeria species in domestic pigeons in the Giza governorate, Egypt. Also, the clinical symptoms, life cycle, histopathological changes in experimentally infected squabs and molecular identification of Eimeria spp. were studied. Eimeria spp. was detected in 27.43% (96/350) intestinal samples collected from domestic pigeons. Seasonal incidence revealed that winter had the highest rate of infection (30.68%), while summer had the lowest one (15.66%). Five species of Eimeria were identified morphologically as Eimeria labbeana (18.75× 16.5 µm), E.columbarum (19.5×18.5µm), E.columbae (16.25×14µm), E.columbinae (14.75×13.25µm) and E. chalcoptereae (22.5×21.5µm). The oocysts had different shapes including spherical, subspherical and ovoid. Molecular characterization was conducted to confirm morphological identification. Using two primers, the PCR products of Eimeria spp. revealed that the amplified products of the 18S rRNA region had ~ 400bp and 500 bp. Sequencing and phylogenetic analysis of the PCR results indicated that the species under investigation were E. labbeana, E.columbarum, E.columbae, E.columbinae and E. chalcoptereae under accession numbers OR420916, OR554388, OR562036, OR420908 and OR553660 respectively. This is the first record of E. columbinae and E. chalcoptereae in domestic pigeons morphologically in Egypt. In addition, it is the first molecular characterization and phylogenetic analysis of Eimeria spp. infecting domestic pigeons. The experimentally infected squabs showed ruffled feathers, greenish-watery mucoid diarrhea, weakness and decrease in body weight. The prepatent period was 6 days while the patent period was 18 days. Experimental infection of squabs with mixed Eimeria spp. revealed that trophozoites, schizonts, macro, microgametocytes and immature oocysts appeared at 12-36 hrs, 3-4 days, 4-5 days and 6 days post infection (PI) respectively. Histopathological changes of the small intestine's lining epithelium (duodenum, jejunum and ileum) of the experimentally infected squabs revealed severe diffuse enteritis with sloughing of lining epithelium, blood vessels congestion and severe leukocytic infiltration with different Eimeria developmental stages.
Regarding Cryptosporidium spp., this investigation was to determine the incidence, morphological characteristics and molecular identification of Cryptosporidium spp. infecting domestic pigeons in Giza governorate, Egypt as domestic pigeons could be reservoir hosts and/or carriers of Cryptosporidium spp. to other birds, animals and humans. In the examined intestinal and bursal samples, the incidence of Cryptosporidium spp. was found by modified Ziehl-Neelsen stain (M.Z.N) to be 12% and 14%, respectively. Seasonal incidence showed that the winter season had the highest incidence. (15.38% and 21.74%) while the lowest incidence of infection was in autumn (7.95% and 8.33%) in intestinal and bursal samples respectively. Two forms of Cryptosporidium species were detected. The smallest oocysts had average size (4.6±0.63×4.44±0.76µm) while the largest one had average size (5.64 ± 0.39 ×5.57±0.41 µm). Using two primers, the PCR products of Cryptosporidium spp. were analyzed, and the results showed that the amplified products of the 18S rRNA region had 830 bp and 760 bp. Sequencing and phylogenetic analysis of the PCR results indicated that the species under investigation were Cryptosporidium meleagridis and Cryptosporidium baileyi under accession numbers OR631411 and OR631417, respectively. This phylogenetic analysis is regarded as the first in Egypt for identification of Cryptosporidium species of domestic pigeons.

تهدف هذه الرسالة إلى إجراء بعض الدراسات على بعض أنواع الكوكيسيديا الأولية (طفيل الايميريا وطفيل الكريبتوسبورديم) التي تصيب الحمام المستأنس في مصر. بالنسبة لطفيل الايميريا أجريت الدراسة لمعرفة نسبة إصابة الحمام المستأنس في محافظة الجيزة بمصر. وكذلك دراسة الخصائص المورفولوجية والأعراض السريرية وكذلك دراسة دورة حياة الطفيل والتغيرات المرضية والهستوباثولوجية بالإضافة إلى التوصيف الجزيئي للطفيل. ، ولإتمام الدراسة تم تجميع عدد 350 عينة محتوى معوى. وبفحص العينات أظهرت النتائج أن نسبة الإصابة بطفيل الايميريا هى 27.43%.وكانت أعلى نسبة إصابة فى فصل الشتاء (30.68%) وأقلها فى فصل الصيف (15.66%).ووفقاً للفحص المجهري لأنواع الإيميريا المكتشفة في الدراسة تم التعرف على خمسة أنواع من الايميريا التي تصيب الحمام وهى كالتالى ايميريا لبيانا, ايميريا كولمبارم ، ايميريا كولمبي, ايميريا كولمبيني وايميريا شالكوبتري .وكان الشكل الخارجي للحويصلات الخاصة بهم هو كروي وشبه كروي وبيضاوي. وأشار التحليل التسلسلي والجيني لنتائج تفاعل البلمرة المتسلسل PCR إلى أن الأنواع التي تم عزلها في هذه الدراسة هي ايميريا لبيانا، ايميريا كولمبارم، ايميريا كولمبي، ايميريا كولمبيني و ايميريا شالكوبتري وحملت أرقام الانضمام في البنك الجيني OR420916 وOR554388 وOR562036 وOR420908 وOR553660 على التوالي. تشمل هذه الرسالة أول توصيف جزيئي لطفيل الايميريا الذي يصيب الحمام المستأنس في مصر. وأظهرت العدوى التجريبية في زغاليل الحمام بطفيل الايميريا أن الفترة ما قبل البائنة 6 أيام والفترة البائنة 18 يوما ،وأظهرت زغاليل الحمام المصابة تجريبيا انتفاش الريش واسهال ذات لون اخضر مصحوب بمخاط مع ضعف عام وانخفاض وزن الجسم .وكشفت التغيرات النسيجية المرضية في الأمعاء الدقيقة لدى الحمام المصابة تجريبيا عن وجود التهاب معوي منتشر حاد واحتقان الأوعية الدموية وارتشاح كريات الدم البيضاء الشديد مع ظهور الأطوار المختلفة لطفيل الأيميريا. بالنسبة للكريبتوسبورديم أجريت الدراسة لمعرفة مدى إصابة الحمام المستأنس في محافظة الجيزة بمصر، وكذلك وخصائصه المورفولوجية وتوصيفه الجزيئي. أظهرت النتائج أن نسبة حدوث إصابة بطفيل الكريبتوسبورديم باستخدام صبغة الزيل نيلسون المعدلة كانت 12% و14% في عينات المحتوى المعوي وغدة فبريسيا على التوالي. وفيما يتعلق بفصول السنة أظهرت الدراسة أن فصل الشتاء كان به أعلى معدلات الإصابة (15.38 % و21.74 %) في حين أن أدنى معدل كان في الخريف (7.95 % 8.33% في عينات المحتوى المعوي وغدة فبريسيا على التوالي. تم التعرف على شكلين وحجمين مختلفين من أنواع الكريبتوسبورديم من الناحية الشكلية: الحويصلات الأصغر في الحجم سجلت متوسط (4.6 ± 0.63 × 4.44 ± 0.76 ميكرومتر) في حين أن الأكبر كان متوسط حجمها (5.64 ± 0.39 × 5.57 ± 0.41 ميكرومتر). أشار التحليل التسلسلي والجيني لنتائج تفاعل البلمرة المتسلسل إلى أن الأنواع التي تم عزلها في هذه الدراسة هي الكريبتوسبورديم ملياجريدز و الكريبتوسبورديم بيلي وحملت أرقام الانضمام في البنك الجيني OR631411 وOR631417 على التوالي.و هذه أول دراسة تم فيها عمل الشجرة الوراثية الجينية الخاصة بطفيل الكريبتوسبورديم الذي يصيب الحمام المستأنس في مصر وتوصيفه جزيئيا.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.