Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.

Bibliography: pages 165-174.

A literature survey on marine soft coral Nephthea species was carried out. The ability of the n-hexane fraction of Nephthea sp. to inhibit dermatophytes was investigated, and to discover the mode of action the content of lipoidal matter was analyzed using the GC-MS technique. Additionally, the molecular networking analysis of the GC-MS findings was carried out using the Global Natural Products Social Molecular Networking (GNPS) platform. Moreover, an in-silico analysis of the most prevalent discovered fatty acids and hydrocarbons was conducted on the CYP51 enzyme. These findings were confirmed by in-vitro CYP51 inhibitory potential of the n-hexane fraction and evaluated against fluconazole, as the standard treatment.
Antimicrobial screening of. n-hexane, dichloromethane, ethyl acetate, and butanol sub-fractions was performed and revealed that the ethyl acetate fraction has a significant activity. Antibiofilm activity of the bio-active ethyl acetate fraction was evaluated. UPLC-Q/TOF-MS analysis, molecular docking and pharmacokinetics (ADME) studies of the major identified compounds, and in-vitro enzyme inhibition investigations were used to determine the mode of action as a natural anti-biofilm agent.
Antiviral evaluation of Nephthea sp. four fractions against Herpes simplex type I (HSV-1) and Coxsackie B4 (CoxB4) viruses was done. Secondary metabolites of the most active fraction (n-hexane) were analyzed via high-resolution UPLC-Q/TOF-MS. An in-silico study of identified metabolites and in-vitro enzyme inhibition assay was assessed to confirm the mechanism of action.
Pectin loaded Nephthea sp. extract nanoparticles were employed in preparation of in-situ gel. In-vivo wound healing activity of prepared formula was assessed compared with Mebo as reference drug. Histopathological study and inflammation biomarker analysis also accomplished. Metabolomic profile of Nephthea sp. extract was performed via UPLC-Q/TOF-MS analysis. Identified metabolites undergo in-silico, pharmacokinetics (ADME) studies. Finally, in-vitro enzyme inhibition assay of extract was achieved to decipher the mechanism of action of chronic wound healing potential ability.

قد تم عمل مسح مرجعي في الدوريات والكتب المرجعية حول الشُعب المرجانية الرخوة لأنواع النيفثيا. تم ايضا التعرف علي المحتوي الدهني من الاحماض الدهنية والمواد غير متصبنة باستعمال كروماتوجرافيا الغاز السائل المتصلة بمطياف الكتلة . بالاضافة الي ذلك تم استخدام منصة الشبكات الجزيئية الاجتماعية للمنتجات الطبيعية العالمية لإجراء أبحاث الشبكات الجزيئية لنتائج كروماتوجرافيا الغاز السائل المتصلة بمطياف الكتلة. بعد تحديد قدرة خلاصة الهكسان المشتقة من الشُعب المرجانية الرخوة لفصائل النيفثيا على تثبيط الفطريات الجلدية ، تم إجراء تحليل النمذجة الجزيئية للأحماض الدهنية والهيدروكربونات الاعلي تركيزا على إنزيم CYP51. وتم تأكيد هذه النتائج من خلال تقييم قدرة خلاصة الهكسان علي تثبيط انزيم CYP51 في المختبر وتم مقارنتها بالفلوكونازول الذي يعتبركعلاج قياسي مضاد للفطريات.
علاوة على ذلك ، كشفت الدراسة البيولوجية أن خلاصة خلات الإيثيل لها القدرة الاكبر كمضاد للميكروباتمقارنة بباقي الخلاصات. لذلك تم اختبار قدرتها علي منع تكوين الغشاء الحيوى للبكتريا الموجبة والسالبة وفطر اشريشيا كولاي . ولمعرفة بدقة الية الفاعلية للخلاصة كعامل طبيعي مضاد للغشاء الحيوي تم تحليل الخلاصة باستخدام كروماتوجرافيا السائل فائق الاداء المقترن بمطياف للكتلة لاكتشاف مركبات الايض الثانوية المتسببة في هذا النشاط القوى .تمت ايضا إجراء دراسة النمذجة الجزيئية لمركبات الايض الثانوية المتعرف عليها داخل الخلاصة وتعيين قدرتها علي تثبيط الإنزيمات المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوى للبكتريا والفطر. ايضا لدقة تحديد الية العمل تمت دراسة الحركة الدوائية لاكثر مركبات تثبيطا لانزيمات تكوين الغشاء الحيوى بناءا علي نتائج النمذجة الجزيئية. واخيرا تم في المختبر اختبار قدرة الخلاصة النشطة علي تثبيط الانزيمات المسؤولة عن تكوين الغشاء الحيوى .
تم إجراء مقارنة بيولوجية لمعرفة قدرة الخلاصات الفرعية (الهكسان والكلوروميثان وخلات الايثيل والبيوتانول) من الشُعب المرجانية الرخوة لفصائل النيفثيا ضد فيروسات الهربس البسيط من النوع الأول وكوكساكي ثم تم تعيين نتائج الايض الثانوية للخلاصة الأكثر نشاطا ضد الفيروسات وهي الهكسان عبراستخدام كروماتوجرافيا السائل فائق الاداء المقترن بمطياف للكتلة .بالاضافة الي إجراء دراسة داخل السيليكو لمركبات الايض الثانوية المتعرف عليها تحديد قدرة الخلاصة علي تثبيط الإنزيم في المختبر لتأكيد آلية العمل كمضاد للفيروسات.
تم تحضير وقياس الخواص الفيزيائية لجزيئات البكتين النانومترية المحمل عليها الخلاصة الكحولية لأنواع النيفثيا قيد الدراسة. وتم تحضير مستحضر الانسيتو چل الصيدلى للجزيئاات النانومترية واختبار قدرتها التحفيزية لالتئام الجروح المزمنة مقارنة بال خلاصة الكحولية ومرهم ميبو الموجود في السوق بالاضافة الي انة تم الفحص الهستولوجي لنسيج جلد الفئران بعد التئام الجروح وقياس دلالات الالتهاب ايضا في الدم للفئران. لمعرفة اسباب هذة القدرة التحفيزية تم تحليل الخلاصة باستخدام كروماتوجرافيا السائل فائق الاداء المقترن بمطياف للكتلة والتعرف علي مركبات الايض الثانوية المتسببة في هذا التحفيز .تمت ايضا إجراء دراسة النمذجة الجزيئية لمركبات الايض الثانوية المتعرف عليها داخل الخلاصة وتعيين قدرتها علي تحفيز الإنزيمات المسؤولة عن التئام الجروح. ايضا لدقة تحديد الية العمل تمت دراسة الحركة الدوائية لاكثر مركبات حفزت انزيمات التئام الجروح بناءا علي نتائج النمذجة الجزيئية. واخيرا تم اختبار قدرة الخلاصة في المختبر علي تثبيط الانزيمات المسؤولة عن التئام الجروح.
الكلمات الدالة: أنواع النيفثيا ، كروماتوجرافيا الغاز السائل المقترن بمطياف الكتلة ، الملف الدهني ، كروماتوجرافيا السائل فائق الاداء المقترن بمطياف للكتلة ، الايض الثانوية ، مضادات الفطريات الجلدية ، المضادة للفيروسات ، مضادات الميكروبات ، المضاد للغشاء الحيوي ، النمذجة الجزيئية ، تثبيط الإنزيمات في المختبر ، البكتين ، التئام الجروح ، جزيئات النانومترية

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.