Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.

Bibliography: pages 98-108.

This study was conducted for molecular detection of different
TBDS in Egyptian camels and associated hard ticks.
A total of 1596 ticks were collected and identified from 133
Camelus dromedaries at Cairo and Giza slaughterhouses. According to
cox1 gene sequencing, the most common tick species were Hyalomma
dromedarii; it accounted for 880 (59.4%), followed by Hyalomma
marginatum with 297 (20.1%), Amblyomma hebraeum with 165
(11.1%), H. excavatum with 115 (7.2%), H. anatolicum with 66
(4.4%), and Rhipicephalus annulatus with 23 (1.6%). A few Am.
testudinarium 12 (0.8%), Am. lepidum 11 (0.7%), Am. variegatum 10
(0.7%), R. pulchellus 8 (0.5%), Am. cohaerens 6 (0.4%), and Am.
gemma 3 (0.2%) were found.
The camel blood samples and ticks were screened for the
presence of Borrelia spp. using nested PCRs with the IGS gene and
showed that the prevalence of Borrelia spp. in adult ticks was 1.3%
(21/1596), whereas it was 8.3% (11/133) in the camel blood samples.
Sequencing of the amplicons revealed three Borrelia species
including B. afzelii, B. burgdorferi, and B. miyamotoi were identified
in the examined ticks. Borrelia afzelii was discovered in two tick
species. Borrelia burgdorferi, B. miyamotoi, and B. crocidurae were
all identified in camel blood samples, whereas B. crocidurae was
found in a single blood sample.
96
By applying 16S rRNA to confirm Borrelia burgdorferi, it was
shown that 9.1% (1/11) of blood samples and 14.3% (3/21) of ticks
were positive.
A second nested PCR on positive blood and tick samples
targeting the glpQ gene to detect B. miyamotoi revealed that B.
miyamotoi had the highest prevalence in adult ticks [76.2% (16/21)]
and camel blood [81.8% (9/11)].
Following the nested PCR and the amplicon sequencing of the
IGS gene, Borrelia spp. were detected in H. dromedarii (11/880,
1.3%), R. annulatus (2/23, 8.7%), Am. lepidum (2/11, 18.1%), H.
marginatum (1/297, 0.3%), Am. testudinarium (1/12, 8.3%), Am.
hebraeum (1/165, 0.6%), Am. variegatum (2/10, 20%), and Am.
cohaerens (1/6, 16.6%). Additionally, B. afzelii was found in H.
dromedarii and H. marginatum.
By targeting the glpQ gene, B. miyamotoi was detected in H.
dromedarii (8/880, 0.9%), Am. hebraeum (1/165, 0.6%), Am. Lepidum
(2/11, 18.1%), Am. cohaerens (1/6, 16.6%), Am. variegatum (2/10,
20%), and R. annulatus (2/23, 8.7%). By targeting the 16S rRNA, B.
burgdorferi was found in H. dromedarii (2/880, 0.2%) and Am.
testudinarium (1/12, 8.3).
Using nested PCRs targeting the htpAB-IS1111 gene, camel
blood samples and infected ticks were screened for the presence of C.
burnetii. The results showed that the prevalence of C. burnetii in blood
samples was 15.8% (21/133). The overall prevalence of this species
was 1.3% (16/1260) in adult ticks, it was detected in H. dromedarii
97
(12/880, 1.4%), H. marginatum (1/297, 0.3), H. anatolicum (1/66,
1.5%), Am. lepidum (1/11, 9.1%) and Am. cohaerens (1/6, 16.7%)
Out of 16 ticks that tested positive for C. burentii, two had
double infections (2/16, 12.5%) with Borrelia species and C. burnetii
in H. dromedarii and Am. lipidium ticks, and one tick (1/16, 6.3)
showed triple co-infections with C. burnetii, Borrelia spp., and
Babesia microti. Additionally, it was discovered that C. burnetii and
Borrelia spp. were present in two camel blood samples (2/21, 9.5%).
Using the 18S rRNA gene, Babesia spp. was detected in tick
samples and camel blood. Babesia spp. was detected in 2.3% (3/133)
of blood samples from apparently healthy camels. Following the use of
nested PCR with an emphasis on the β-tubulin gene, B. microti was
detected in 6.8% (9/133( of blood samples and 0.2% (3/1596) ticks.
There were two Rhipicephalus annulatus and one Amblyomma
cohaerens among the positive ticks

أجريت هذه الدراسة الوبائية الجزيئية لأنواع مختلفة منالمسببات المرضية المنقولة بالقرادفي الإبل المصرية وكذلك القراد المتطفل عليها.
لذا تم جمع وتصنيف 1596 من حشرات القراد المتطفلة على 133 إبل(Camelus dromedaries)من مجازر القاهرة والجيزة. وبإجراء التسلسل الجيني للجين cox1، وجد أن أكثر أنواع القراد شيوعًا هو Hyalommadromedarii؛ حيث بلغ عدده 880 (59.4٪)،يليهHyalommamarginatum 297 (20.1٪)،Amblyommahebraeum 165 (11.1٪)،H. excavatum 115 (7.2٪)،H. anatolicum 66 (4.4٪)،وRhipicephalusannulatus23 (1.6٪). تم العثور على عدد قليل من12 (0.8%)Am. testudinarium، Am. lepidum 11 (0.7%) Am. variegatum 10 (0.7%)،R. pulchellus8 (0.5%)،Am. cohaerens6 (0.4%)،وAm. gemma3 (0.2%)
وللكشف عن تواجد بكتريا Borrelia spp تم استخدامتفاعل البلمرة المتسلسل nested PCRs واستهدافالجينIGSوبلغت نسبة الاصابة ببكترياBorrelia spp8.3٪ (11/133) في دماء الإبل التى تم فحصها. ولتصنيف تلك الميكروبات تم اجراء التسلسل الجيني للعينات الايجابية المصابة ببكتريا Borrelia sppوقد تم الكشف عن تواجد الأنواع B. burgdorfei،B. miyamotoi و B. crocidurae في العينات المفحوصة، كما أن النوعB. crocidurae وجد في عينة واحدة للجمال المفحوصة.
وقد تم الكشف عن تواجد ميكروب البوريليا من النوع Borrelia burgdorferiباستخدام16 SrRNA، وبنسبة بلغت 9.1٪ (1/11) في الجمال.فى حين أن الكشف عن تواجد الميكروب من النوع عنB. miyamotoi تم باستخدامتفاعل البلمرة المتسلسل (Nested PCR) واستهداف الجين glpQ,فكانت نسبة تواجد الميكروب من هذاالنوع 81.8٪ (9/11).
وعلى الجانب الأخر بلغت نسبة الاصابة الكلية ببكترياBorrelia sppفي القراد البالغ 1.3٪ (21/1596) وذلك باستخدامتفاعل البلمرة المتسلسل nested PCRs معجينIGS. وقد تم الكشف عن تواجد هذا الميكروب في أنواع القراد المختلفة كالآتى: H. dromedarii(11/880, 1.3%)،R. annulatus(2/23, 8.7%)، Am. lepidum(2/11, 18.1%)،H. marginatum (1/297, 0.3%)،Am. testudinarium(1/12, 8.3%)،Am. hebraeum(1/165, 0.6%)،Am. variegatum (2/10, 20%)،Am. cohaerens(1/6, 16.6%)
وتم اجراء التسلسل الجيني لعينات القراد الايجابية المصابة ببكتريا Borrelia sppوذلك لتصنيفها، وتبين وجود ثلاثة أنواع من هذاالميكروب وهي B. afzelii و B. burgdorferi و B. miyamotoi. حيث تم الكشف عن تواجد الميكروب من النوع B. afzeliiفى أنواع القراد H. dromedariiو H. marginatum
وقد تم الكشف عن تواجد ميكروب البوريليا من الأنواع Borrelia burgdorferi و B. miyamotoiفي القراد باستخدام الجينات16 SrRNAوglpQ على التوالي وتفاعل البلمرة المتسلسل (Nested PCR) وقد بلغت نسبة تواجد Borrelia burgdorferi 14.3٪ (3/21) في حين أن نسبة تواجد الميكروب من النوعB. miyamotoi كانت 76.2٪ (16/21) في عينات القراد. وكانت نسبة تواجد B. miyamotoi في أنواع القراد المختلفة كالآتي: H.dromedarii(8/880, 0.9%)،Am. hebraeum(1/165, 0.6%)،Am. Lepidum(2/11, 18.2%)،Am. cohaerens(1/6, 16.7%)،Am. variegatum (2/10, 20%)، and R. annulatus(2/23, 8.7%) بينما باستهداف s RNA16 , تم العثور على B. burgdorferiفيH. dromedarii (2 /880) 0.2% Am.testudinarium(1 /12,8.3 %).
كما اهتمت الدراسة بالكشف عن تواجد ميكروب C. burnetii فيدماء الإبل والقراد وذلك باستخدامتفاعل البلمرة المتسلسل (Nested PCR) مع جينtpAB-IS1111، حيث بلغت نسبة تواجد هذا الميكروب 15.8% (21 /133) و1.3% (16 /1260) في عينات الجمال والقراد على التوالي. وكانت نسبة تواجد C.burnetiiفي أنواع القراد المختلفة على النحو التالى: H.dromedarii (12/880) 1.4% فىH. marginatum (1/297, 0.3)، H. anatolicum(1/66, 1.5%)، Am.lepidum(1/11, 9.1%) وAm. cohaerens(1/6, 16.7%)
ومما هو جدير بالذكرأن من بين 16 عينة قراد إيجابية لميكروب C.burentii، كان هناك عدوى ثنائية بأنواعBorreliaوC. burnetiiفي القراد من النوع H. dromedariiو(2/16, 12.5%) Am. lipidiumوقد أظهرت عينة واحدة فقط للقراد من النوع Am. cohaerensعدوى ثلاثية بميكروباتC. burnetiiوBorreliasppو (1/16, 6.3) Babesia microti, هذابالإضافة إلى أنه تم العثور على عينتي دم من الإبل (2/21, 9.5%) تحملان عدوى ثنائية بميكروبىC.burnetiiو. Borreliaspp
وللكشف عن تواجد طفيل Babesiasppفي عينات الإبل والقراد تم استخدام جين 18 sRNA، ووجد أن نسبة الاصابة بهذا الطفيل بلغت2.3% (3 /133) في عينات الإبل. ولتصنيف هذا الطفيل تم استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل (Nested PCR) واستهداف جينβ-tubulin، وقد تم الكشف عن تواجد هذا الطفيل من النوع B.microti بنسبة بلغت 6,8% (9 /133) في عينات الجمال و 0.2%(3/1596)في عينات القراد و كانت أنواع القراد المصابة بهذا الطفيل هي(2)Rhipicephalus annulatusو (1)Amblyommacohaerens.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.