Thesis (M.Sc.)-Cairo University, 2024.

Bibliography: pages 122-154.

This study aimed mainly to investigate the mechanisms of linezolid resistance in Staphylococcus spp., focusing on 30 samples isolated from El Kasr El-Eini Hospital. Linezolid, a crucial antibiotic in treating infections caused by Gram-positive bacteria, including Staphylococcus spp., has faced emerging challenges due to the development of resistance. Through a comprehensive analysis of the isolated samples, this study aimed to elucidate the genetic and molecular determinants driving linezolid resistance in Staphylococcus spp. The research employs advanced molecular biology techniques to explore genetic mutations, other potential genetic elements, and factors contributing to this resistance phenotype. Blood and pus specimens were collected from patients who were on long-term (>three months) antibiotics therapy, showing reduced susceptibility to Linezolid. The Domain V of the 23S rRNA gene was found to harbor multiple nucleotide substitutions. Moreover, ribo-proteins (L3 and L4) contained several amino-acid modifications. Furthermore, the existence of the cfr gene which encode a RNA methyl-transferase rendering multiple resistance to five different classes of antibiotics that bind at overlapping non-identical sites at the PTC was confirmed in the selected isolates.

هدفت هذه الدراسة بشكل أساسي إلى معرفة آليات مقاومة اللينيزوليد في انواع المكورات العنقودية، مع التركيز على 30 عينة معزولة من مستشفى القصر العيني. اللينيزوليد، وهو مضاد حيوي مهم في علاج الالتهابات التي تسببها البكتيريا إيجابية الجرام، بما في ذلك المكورات العنقودية، واجه اللينيزوليد تحديات ناشئة بسبب تطور المقاومة. من خلال التحليل الشامل للعينات المعزولة، هدفت هذه الدراسة إلى توضيح المحددات الجينية والجزيئية المسببة لمقاومة اللينيزوليد في المكورات العنقودية. يستخدم البحث تقنيات البيولوجيا الجزيئية المتقدمة لاستكشاف الطفرات الجينية والعناصر الوراثية المحتملة الأخرى والعوامل التي تساهم في هذا النمط الظاهري للمقاومة. تم جمع عينات الدم والقيح من المرضى الذين كانوا يخضعون للعلاج بالمضادات الحيوية على المدى الطويل (> ثلاثة أشهر)، مما يدل على انخفاض الحساسية للينيزوليد. تم اكتشاف العديد من طفرات النيوكليوتيدات في المجال V لجين الرنا الريباسي 23S. علاوة على ذلك، تم اكتشاف تغيرات في الأحماض الأمينية في بروتينات الريبوسوم L3 وL4. علاوة على ذلك، تم تأكيد وجود جين cfr الذي يشفر RNA methyltransferase والذي يمنح مقاومة مشتركة لخمس فئات مختلفة من المضادات الحيوية التي ترتبط في مواقع متداخلة غير متطابقة في PTC في العزلات المختارة.

Issued also as CD

Text in English and abstract in English.