000			05616namaa22004451i 4500
003			OSt
005			20250223033315.0
008			241019s2023 |||a|||f m||| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _bara
049			_aDeposite
082			_a660.62
092			_a660.62 _221
097			_aPh.D
099			_aCai01.12.05.Ph.D.2023.He.N
100	0		_aHend Yousuf Mohammad Yousuf, _epreparation.
245	1	0	_a Next generation sequencing data analysis to unlock functional genomics of Dunaliella salina / _cby Hend Yousuf Mohammad Yousuf ; Supervisors: Prof. Dr.Zeinab Khalil Ibraheem , Prof. Dr.Fatma El-Zahraa Tawfeek , Dr.El-Adl Galal El-deen , Dr.Tamer Ahmed Mansour.
246	1	5	_a / الجيل التالي من تحليل البيانات التسلسلية للكشف الوظيفي للجينوم في الدوناليلا سالينا
264		0	_c2023.
300			_a113 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.
504			_aBibliography: pages 200-250.
520			_a Introduction: the growth of Dunaliella salina SA20 (Dunal) Teodoresco Egyptian isolate (from El-Bardawil Lake, Sinai, Egypt) in wastewater such as mozzarella cheese whey (MCW) is a more cost-effective cultivation method and growing D. salina SA20 in such waste could be used safely in biotechnological applications. Methodology: the use of 20% v/v MCW/Loeblich nutrient medium as growth supplement allowed mixotrophic nutrition, while growth in 100% Loeblich allowed for autotrophic nutrition. Mixotrophy and autotrophy were compared utilizing the next- generation sequencing technique, transcriptome assembly, and differential gene expression analysis using RNA-Seq. Results: the optimum growth performance of D. salina SA20 cells was observed in pH 7.5 and was indicated by measured values of chlorophyll a (10.51 mg/L), dry weight (405 mg/L), cell count (6.92 x 106 cell/ml), and optical density (1.12). Additionally, a growth curve experiment comparing the mix- and autotrophic conditions presented higher values of the relative mean and maximum growth rates in mixotrophic conditions than in the autotrophic conditions. The pathway enrichment analysis under mixotrophic conditions found down-expression in important genes for nitrogen metabolism, carbon metabolism, purine and pyrimidine biosynthesis, and up-expression in genes encoding for enzymes involved in photosynthesis, carbon fixation, glucogenesis, and ribosome production pathways. Conclusion: the results might suggest a connection between the induced growth strategy used in mixotrophy and improved photosynthesis coupled with enhanced glucogenesis.
520			_aتم استخدام شرش الموتزريلا والناتج بكميات كبيرة من صناعة الألبان كوسط غذائي لنموطحلب دوناليلا سالينا بطريقة آمنة في تطبيقات التكنولوجيا الحيوية وذلك بإضافته إلى الوسطالغذائي الغير عضوي )لوبلش( بتركيزات مختلفة) 20 و 50 و 75% شرش/لوبلش( كمثالللتغذية المختلطة بينما يعتبر النمو ف ي الوسط الغير عضوي )١٠٠% لوبلش( هو مثال للتغذيةالذاتية وقد دلت النتائج على ان التغذية المختلطة بتركيز ٢٠% قد سجلت أعلى النتائج )كلوروفيلأ 10.51 مجم/لتر والوزن الجاف 405 مجم/لتر وعدد الخلايا 6.92× 610 خلية/مل(، والكثافةالبصرية) 1.12(. كما تم استخدام قيم مختلفة للاس الهيدروجين ي لدراسة تأثير تلك القيم المختلفة حيث وجد انpH 7 هو القيمة المثلى للنمو. بالإضافة إلى ذلك، قدمت تجربة منحنى النمو التي تقارن بين ظروف التغذية المختلطة والتغذية الذاتية قيمًا أعلى للمتوسط النسبي ومعدلات النمو القصوى في ظروف التغذية المختلطة) 0.19, 0.21 /يوم، على التوالي( مقارنة بظروف التغذيةالذاتية) 0.16، 0.18/ يوم، على التوال ي(. كشف تحليل الترنسكربتوم عن إفراط في التعبير في الجينات المشاركة في التمثيل الضوئي، وتثبيت الكربون، وتكوين الجلوكوز، ومسارات تخليق الريبوسوم ،وتثبيط في مسارات النيتروجين، وأيض الكربون، والتخليق الحيوي للبيورينوالبيريميدين.
530			_aIssues also as CD.
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		7	_aMicrobiology _2qrmak
653		0	_adifferential gene expression analysis _aDunaliella salina _agrowth supplements _amixotrophy _awhey
700	0		_aZeinab Khalil Ibraheem _ethesis advisor.
700	0		_aFatma El-Zahraa Tawfeek _ethesis advisor.
700	0		_aEl-Adl Galal El-deen _ethesis advisor.
700	0		_aTamer Ahmed Mansour _ethesis advisor.
900			_b01-01-2023 _c Zeinab Khalil Ibraheem _cFatma El-Zahraa Tawfeek _cEl-Adl Galal El-deen _cTamer Ahmed Mansour _UCairo University _FFaculty of Science _DDepartment of Botany and Microbiology
905			_aShimaa _eHuda
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c168464