000			08528namaa22004331i 4500
003			OSt
005			20250223033325.0
008			241116s2023 |||a|||f m||| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _bara
049			_aDeposite
082	0	4	_a616.01
092			_a616.01 _221
097			_aPh.D
099			_aCai01.11.19.Ph.D.2023.Ne.A
100	0		_aNermin Zaky Mostafa, _epreparation.
245	1	0	_aAntigen detection and pcr versus conventional culture for diagnosis of campylobacter infections in pediatric gastroenteritis / _cNermin Zaky Mostafa ; Supervision of Prof. Dr. Azza Essam Eldin Badr , Prof. Yasmin Samy ElKholy , Prof. Noha Mahmoud Abdel-Rahim Gohar , Dr. Sara Tarek Galal Habib.
246	1	5	_a / الكشف عن المستضد وتفاعل سلسلة البلمرة مقارنة بطرق الزراعة التقليدية لتشخيص النزلات المعوية المسببة ببكتريا الكمبيلوبكتر عند الأطفال
264		0	_c2023.
300			_a110 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.
504			_aBibliography: pages 94-110.
520			_aCampylobacter is one of the leading pathogens which causes bacterial gastroenteritis among children worldwide especially in developing countries. Several laboratory methods have been used to diagnose campylobacteriosis including culture, ELISA, and PCR. The aim of this study was to compare PCR and antigen detection by ELISA with culture for detection of Campylobacter. The present study was conducted on 160 stool samples which were collected from pediatric patients complaining of acute gastroenteritis. All samples were cultured on mCCDA medium and any growth obtained on mCCDA medium was subjected to Gram- stained smears and oxidase test. Detection of Campylobacter antigen (PEB1) in specimens was done by ELISA. Molecular detection of virulence genes: cadF, hipO and asp in specimens was done by multiplex PCR. The results showed that culture on mCCDA medium could isolate 35 (21.9%) Campylobacter. Campylobacter antigen was detected in 50 samples by ELISA. Campylobacter genus was detected in 47 samples by PCR, 39 of them were positive for C. jejuni. Culture is the gold standard method for Campylobacter detection, however, culture-independent tests have a role in diagnostic testing. Nucleic acid-based methods can determine the presence of infection, and identify Campylobacter at the species level.
520			_aيعد مرض الإسهال لدى الأطفال في البلدان النامية مدمرًا، حيث تساهم نوبات الإسهال المتكررة في سوء التغذية، مما يعرض هؤلاء الأطفال لخطر متزايد للإصابة بالإسهال المعدي ويرتبط بالتقزم وضعف النمو المعرفي. بكتريا الكمبيلوبكتر هي أحد الأسباب الرئيسية للإسهال البكتيري في جميع أنحاء العالم. يمكن تقليل الأعراض بفضل العلاج بالمضاد الحيوي المناسب الذي يتم إعطاؤه في أقرب وقت ممكن، خلاف ذلك، فإن الفائدة من العلاج تكون محدودة. تكمن المشكلة في أن الكمبيلوبكتر يتم اكتشافها تقليديًا عن طريق زراعة البراز مع توفر النتائج عادة بعد 48 إلى 72 ساعة، مما لا يسمح بالعلاج المبكر. لذلك، تقلل المزرعة من اكتشاف بعض الحالات، خاصة عندما لا يتم استيفاء متطلبات المزرعة بالكامل. تم تطوير تقنيات أخرى، على سبيل المثال، الطرق الجزيئية ومقايسات الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) التي لها حساسية أفضل من المزرعة التقليدية. أجريت الدراسة الحالية على 160 مريضاً من الأطفال تتراوح أعمارهم بين 2 الى 10 سنوات يشكون من التهاب المعدة والأمعاء الحاد. تم أخذ عينة براز من كل مريض. تم تشخيص الكمبيلوبكتر عن طريق زراعة عينات البراز على مستنبت mCCDA، وهي الطريقة الأساسية لتشخيص عدوى الكمبيلوبكتر وطرق الكشف السريع التي تشمل الكشف المباشر عن الكمبيلوبكتر انتيجين (PEB1) في العينات باستخدام ELISA والكشف الجزيئي للجينات في العينات: cadF، hipO، asp بواسطة تفاعل البلمرة التسلسلي المتعدد. لوحظ نمو الكمبيلوبكتر في 35 عينة (21.9٪)، بينما 125 عينة (78.1٪) لم تسفر عن نمو الكمبيلوبكتر بواسطة المزرعة. وقد لوحظ وجود الكمبيلوبكتر انتيجين (PEB1) باستخدام ELISA في 50 عينة (31.3٪) من إجمالي 160 عينة. من بين هذه العينات الإيجابية، كانت 35 عينة إيجابية أيضًا بالمزرعة، بينما كانت 15 عينة سلبية من خلال المزرعة. كانت الحساسية والنوعية والقيمة التنبؤية الإيجابية (PPV) والقيمة التنبؤية السلبية (NPV) لـ ELISA 100٪، 88٪ ،70 ٪، 100٪ على التوالي. بالنسبة للكشف الجزيئي للجينات cadF، hipO، asp بواسطة تفاعل البلمرة التسلسلي المتعدد، فقد أظهرت النتائج وجود جين cadF في 47 عينة (29.4٪) مما يدل على أنها إيجابية لجنس الكمبيلوبكتر Campylobacter genus))، بينما وجد جين hipO في 39 عينة (24.4٪) من هذه العينات الـ 47 الإيجابية مما يدل على أنها من نوع جوجناى ((C. jejuni، بينما لم يتم ايجاد جين asp في أي عينة، ولهذا فقد اعتبرت 8 عينات إيجابية لأنواع كمبيلوبكتر أخرى غير جوجناى وكولاي C.jejuni, C. coli. كانت الحساسية والنوعية والقيمة التنبؤية الإيجابية (PPV) والقيمة التنبؤية السلبية لتفاعل البلمرة التسلسلي المتعدد 100٪، 90.4٪، 74.4٪، 100٪ على التوالي. هناك توافق معتدل ذو دلالة إحصائية بين المزرعة (الطريقة الأساسية) ونتائج ELISA بينما هناك اتفاق جوهري بين المزرعة ونتائج تفاعل البلمرة التسلسلي المتعدد. من المشاكل الخطيرة لتشخيص داء الكمبيلوبكتر الاعتماد المستمر على طرق الاستزراع للكشف عن الكمبيلوبكتر في البراز. لكن نمو الكمبيلوبكتر بطيء وينطوي على متطلبات خاصة للنمو لاحتياجها نسبة ضئيلة من الاكسجين. ومع ذلك، لا تزال المزرعة مطلوبة من أجل اختبار مقاومة المضادات الحيوية والدراسات الوبائية. لهذا يجب أن يكون للاختبارات الأخرى المستقلة عن المزرعة دور في تشخيص عدوى الكمبيلوبكتر. ويعد هذا مهم من الناحية الاكلينيكية لأن الاعتماد المستمر على المزرعة قد يعيق اعتماد فحوصات جديدة أكثر دقة.
530			_aIssues also as CD.
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		7	_aMedical Microbiology _2qrmak
653		0	_aCampylobacter _aPediatric Gastroenteritis _aDiagnosis _aConventional Culture _aAntigen Detection _aPCR
700	0		_aAzza Essam Eldin Badr _ethesis advisor.
700	0		_aYasmin Samy ElKholy _ethesis advisor.
700	0		_aNoha Mahmoud Abdel-Rahim Gohar _ethesis advisor.
900			_b01-01-2023 _cAzza Essam Eldin Badr _cYasmin Samy ElKholy _cNoha Mahmoud Abdel-Rahim Gohar _UCairo University _FFaculty of Medicine _DDepartment of Medical Microbiology and Immunology
905			_aShimaa _eHuda
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c168868