000			06726namaa22004211i 4500
003			OSt
005			20250522125555.0
008			250511s2024 ua a|||fr|m|| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _bara
049			_aDeposit
082	0	4	_a616.07
092			_a616.07 _221
097			_aPh.D
099			_aCai01.11.07.Ph.D.2024.Ma.E.
100	0		_aMaryam Mostafa Ashmawy, _epreparation.
245	1	0	_aEvaluation of a Rapid and Accurate Diagnostic Method for Identification of Micro-Organisms Directly from Positive Blood Culture Bottles Using MALDI-TOF Mass Spectrometry / _cBy Maryam Mostafa Ashmawy; Under supervision of Dr. Sahar Mohamed Khairat, Dr. Mona Moheyeldin Abdel Halim
246	1	5	_aتقييم طريقة تشخيص سريعة و دقيقة للتعرف على الكائنات الحية الدقيقة مباشرة من زجاجات مزارع الدم الإيجابية باستخدام جهاز قياس الطيف الكتلي عن طريق تأيين الجزيئات في مصفوفة باستخدام الليزر /
264		0	_c2024.
300			_a83 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
504			_aBibliography: pages 66-83.
520			_aFor patients with sepsis, rapid and accurate pathogen identification is critical and has a major effect on sepsis-related mortality and morbidity rates. This study evaluated the performance of a simple, rapid, and inexpensive method for processing positive blood cultures for immediate identification of microorganisms using matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). This study was performed on 125 positive blood culture bottles collected from April 2022 to September 2023. We compared using MALDI-TOF for the identification of microorganisms isolated from positive blood culture bottles on routine culture media versus the identification of microorganisms directly from positive blood culture bottles without previous isolation on routine culture media. The total number of microorganisms isolated by routine subculture methods was 128 as three bottles had two types of organisms. Out of the 128 organisms isolated by routine subculture method, 97 (75.8%) organisms were identified to species level using the direct detection method from blood culture bottles by MALDI TOF. 4 (3.1%) organisms were identified to genus level only while 3 (2.3%) were wrongly identified. 24 (18.8%) organisms could not be identified by this direct method. Conclusion: This method showed great accuracy for the identification of Gram-negative bacteria, directly from positive blood culture bottles, followed by Gram-positive bacteria, and very low accuracy for yeasts
520			_aيعد التعرف السريع والدقيق على الكائنات الحية الدقيقة المسببة لتسمم الدم أمرًا بالغ الأهمية وله تأثير كبير على معدلات الوفيات بالنسبة للمرضى الذين يعانون من الإنتان. في الطريقة التقليدية لمعالجة عينات مزارع الدم يجب عزل الكائنات الحية الدقيقة من زجاجة مزارع الدم الإيجابية قبل التعرف عليها. ذلك يحتاج الى فترة زمنية تتراوح من ٢٤ إلى ٤٨ ساعة للتعرف على الكائنات الحية الدقيقة المسببة لتسمم الدم. الهدف من هذه الدراسة تقييم أداء طريقة بسيطة وسريعة وغير مكلفة لمعالجة مزارع الدم الإيجابية للتعرف الفوري على الكائنات الحية الدقيقة باستخدام جهاز قياس الطيف الكتلي عن طريق تأيين الجزيئات في مصفوفة باستخدام الليزر (MALDI-TOF MS). في هذه الدراسة قمنا بجمع ١٢٥ زجاجة من مزارع الدم الإيجابية في الفترة من أبريل ٢٠٢٢ إلى سبتمبر ٢٠٢٣. وقمنا بمقارنة نتائج التعرف على الكائنات الحية باستخدام MALDI-TOF MS مباشرة من زجاجات مزارع الدم الإيجابية مقابل زرع العينات باستخدام الطريقة الروتينية. بلغ العدد الإجمالي للكائنات الحية الدقيقة المعزولة بطرق الزرع الروتينية ١٢٨ حيث احتوت ثلاث عينات على نوعين من الكائنات الحية. من بين ١٢٨ كائنًا حيا معزولًا بطريقة الزرع الروتيني، تم التعرف على ۹۷ (۷٥,٨٪) كائنًا حيًا على مستوى الأنواع الفرعية باستخدام طريقة الكشف المباشر من زجاجات زرع الدم بواسطة MALDI TOF. تم تحديد نوع ٤ (٣,١٪) من الكائنات الحية على مستوى الصنف فقط بينما تم التعرف على ٣ (٢,٣٪) بشكل خاطئ. لم يتم التعرف على ٢٤ كائنًا حيًا (١٨,٨٪) بالطريقة المباشرة. أظهرت هذه الطريقة دقة كبيرة في التعرف على البكتيريا سالبة الجرام (۹٠٪)، مباشرة من زجاجات مزارع الدم الإيجابية، تليها البكتيريا موجبة الجرام (٦۹٪)، ودقة منخفضة جدًا بالنسبة للخمائر (٣٣,٣٪). في هذه الدراسة، خلصنا إلى أنه يمكن استخدام MALDI-TOF MS للتعرف السريع على الكائنات الحية سالبة الجرام وإيجابية الجرام مباشرة من زجاجات مزارع الدم الإيجابية مقارنة بالطرق التقليدية حتى يمكن اتخاذ الإجراءات العلاجية اللازمة مبكراࣧ.
530			_aIssued also as CD
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		7	_apathology _2qrmak
653		0	_ablood culture _adirect identification _aMALDI-TOF _asepsis
700	0		_aSahar Mohamed Khairat _ethesis advisor.
700	0		_aMona Moheyeldin Abdel Halim _ethesis advisor.
900			_b01-01-2024 _cMona Moheyeldin Abdel Halim _cSahar Mohamed Khairat _UCairo University _FFaculty of Medicine _DDepartment of Clinical and Chemical pathology
905			_aNourhan _eEman Ghareb
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c171992