Advanced Bacteriological and Molecular Studies on Some Multi-drug Resistant Bacteria / Remainder of title /
Engy Mamdouh Mahmoud El Genedy,
Advanced Bacteriological and Molecular Studies on Some Multi-drug Resistant Bacteria / Remainder of title / دراسات بكتريولوجيه متقدمه علي بعض الميكروبات المقاومة للمضادات الحيوية المتعددة / By Engy Mamdouh Mahmoud El Genedy; Under Supervision of Prof. Dr. Ahmed Samir M. Shehata, Prof. Dr. Khaled A. Abdel-Moein. - 135 pages : illustrations ; 25 cm. + CD.
Thesis (M.Sc.)-Cairo University, 2024.
Bibliography: pages 101-133.
In the current study, 100 nasal swabs and 126 rectal swabs were collected
from respiratory ill and diarrheic pets in Egypt to be screened for carbapenem-
resistant organisms (CROs). According to the antibiotic sensitivity assays, 6
and 25 CRO isolates were recovered from the nasal and rectal swabs with
prevalence rates of 6% and 19.8%, respectively. The CRO isolates recovered
from the nasal swabs were identified as E. coli, Klebsiella pneumoniae,
Pseudomonas aerguinosa, and Enterobacter cloacae with prevalence rates of
3%, 1%, 1%, and 1%, respectively. However, isolates from the rectal swabs
were E. coli (13.5%), Klebsiella pneumonaie, Klebsiella oxytoca,
Enterobacter cloacae (1.6% each), Pseudomonas aeruginosa, and Citrobacter
freundii (0.8% each).
Molecular characterization of the isolates targeting carbapenemase genes
(blaNDM, blaKPC, blaOXA-48, blaVIM, and blaIMP) revealed that blaNDM
gene was detected in two cat respiratory isolates.Nevertheless, blaNDM was the
most detected carbapenemase gene in the rectal isolates followed by blaOXA-48
and blaKPC. Three isolates were identified: Two E. coli isolates and one
K.oxytoca isolate were identified as XDR according to the antibiotic
sensitivity test.
The findings of this study threw a spot of light on the potentially hazardous
impact of pet animals as carriers of CROs with their possible dissemination to
human partnerships and the environment. في هذه الدراسة تم تجميع 100 مسحة تنفسية و126 مسحة شرجية من كلاب و قطط منزلية بمصر ذات أعراض تنفسية أو إسهال على التوالي وذلك للتحري عن احتمالية احتواء تلك العينات على بكتيريا مقاومة للكاربابينيم (CROs) .
بناءاً على اختبار الحساسية، فإنه تم تعريف 6 عزلات و 25 عزلة على أنها CROs بنسب 6% و 19.8% على التوالي. وحسب الطرق البكتريولوجية التقليدية فقد عرفت العزلات التنفسية على أنها إيشريشيا كولاي، كليبسيللا نيموني، سودوموناس إيروجينوزا و إنتيروباكتر كلواكي بنسب 3%، 1%، 1% و 1% على التوالي.
وفي المقابل فإنه تم تعريف العزلات البرازية على أنها إي كولاي (13.5%)، كليبسيللا نيموني (1.6%)، كليبسيللا أوكسيتوكا (1.6%)، سودوموناس إيروجينوزا (0.8%) و إنتيروباكتر فرونداي (0.8%(
وعلى المستوى الجيني، فقد دل التوصيف الجزيئي باستهداف جينات الكاربامينيديز ((blaNDM blaKPC, blaOXA-48, blaVIM, blaIMP) فقد تبين وجود الجين blaNDM في عزلتين من القطط. وبخصوص عزلات البراز، فكان جين blaNDM الأكثر شيوعاً بين العزلات متبوعاً بالجينين blaOXA-48 و blaKPC. إضافة إلى ذلك، فإن عزلتي إيشريشيا كولاي و عزلة كليبسيللا أوكسيتوكا كانت مفرطة المقاومة للمضادات الحيوية (XDRs) حسب اختبار الحساسية.
وتسلط نتائج هذه الدراسة على الدور الخطير للحيوانات المنزلية كعوائل حاملة لعترات بكتيرية مقاومة للكاربابيميدين و احتمالية انتقالها للآدميين المخالطين والبيئة.
Text in English and abstract in Arabic & English.
Microbiology
Pets Carbapenem Rectal XDR bla genes
579
Advanced Bacteriological and Molecular Studies on Some Multi-drug Resistant Bacteria / Remainder of title / دراسات بكتريولوجيه متقدمه علي بعض الميكروبات المقاومة للمضادات الحيوية المتعددة / By Engy Mamdouh Mahmoud El Genedy; Under Supervision of Prof. Dr. Ahmed Samir M. Shehata, Prof. Dr. Khaled A. Abdel-Moein. - 135 pages : illustrations ; 25 cm. + CD.
Thesis (M.Sc.)-Cairo University, 2024.
Bibliography: pages 101-133.
In the current study, 100 nasal swabs and 126 rectal swabs were collected
from respiratory ill and diarrheic pets in Egypt to be screened for carbapenem-
resistant organisms (CROs). According to the antibiotic sensitivity assays, 6
and 25 CRO isolates were recovered from the nasal and rectal swabs with
prevalence rates of 6% and 19.8%, respectively. The CRO isolates recovered
from the nasal swabs were identified as E. coli, Klebsiella pneumoniae,
Pseudomonas aerguinosa, and Enterobacter cloacae with prevalence rates of
3%, 1%, 1%, and 1%, respectively. However, isolates from the rectal swabs
were E. coli (13.5%), Klebsiella pneumonaie, Klebsiella oxytoca,
Enterobacter cloacae (1.6% each), Pseudomonas aeruginosa, and Citrobacter
freundii (0.8% each).
Molecular characterization of the isolates targeting carbapenemase genes
(blaNDM, blaKPC, blaOXA-48, blaVIM, and blaIMP) revealed that blaNDM
gene was detected in two cat respiratory isolates.Nevertheless, blaNDM was the
most detected carbapenemase gene in the rectal isolates followed by blaOXA-48
and blaKPC. Three isolates were identified: Two E. coli isolates and one
K.oxytoca isolate were identified as XDR according to the antibiotic
sensitivity test.
The findings of this study threw a spot of light on the potentially hazardous
impact of pet animals as carriers of CROs with their possible dissemination to
human partnerships and the environment. في هذه الدراسة تم تجميع 100 مسحة تنفسية و126 مسحة شرجية من كلاب و قطط منزلية بمصر ذات أعراض تنفسية أو إسهال على التوالي وذلك للتحري عن احتمالية احتواء تلك العينات على بكتيريا مقاومة للكاربابينيم (CROs) .
بناءاً على اختبار الحساسية، فإنه تم تعريف 6 عزلات و 25 عزلة على أنها CROs بنسب 6% و 19.8% على التوالي. وحسب الطرق البكتريولوجية التقليدية فقد عرفت العزلات التنفسية على أنها إيشريشيا كولاي، كليبسيللا نيموني، سودوموناس إيروجينوزا و إنتيروباكتر كلواكي بنسب 3%، 1%، 1% و 1% على التوالي.
وفي المقابل فإنه تم تعريف العزلات البرازية على أنها إي كولاي (13.5%)، كليبسيللا نيموني (1.6%)، كليبسيللا أوكسيتوكا (1.6%)، سودوموناس إيروجينوزا (0.8%) و إنتيروباكتر فرونداي (0.8%(
وعلى المستوى الجيني، فقد دل التوصيف الجزيئي باستهداف جينات الكاربامينيديز ((blaNDM blaKPC, blaOXA-48, blaVIM, blaIMP) فقد تبين وجود الجين blaNDM في عزلتين من القطط. وبخصوص عزلات البراز، فكان جين blaNDM الأكثر شيوعاً بين العزلات متبوعاً بالجينين blaOXA-48 و blaKPC. إضافة إلى ذلك، فإن عزلتي إيشريشيا كولاي و عزلة كليبسيللا أوكسيتوكا كانت مفرطة المقاومة للمضادات الحيوية (XDRs) حسب اختبار الحساسية.
وتسلط نتائج هذه الدراسة على الدور الخطير للحيوانات المنزلية كعوائل حاملة لعترات بكتيرية مقاومة للكاربابيميدين و احتمالية انتقالها للآدميين المخالطين والبيئة.
Text in English and abstract in Arabic & English.
Microbiology
Pets Carbapenem Rectal XDR bla genes
579