header

Molecular marker development and characterization in egyptian clover (Trifolium alexandrinum L.) / (Record no. 172486)

MARC details
000 -LEADER
fixed length control field 07466namaa22004331i 4500
003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER
control field OSt
005 - أخر تعامل مع التسجيلة
control field 20250610135810.0
008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION
fixed length control field 250610s2024 ua a|||frm||| 000 0 eng d
040 ## - CATALOGING SOURCE
Original cataloguing agency EG-GICUC
Language of cataloging eng
Transcribing agency EG-GICUC
Modifying agency EG-GICUC
Description conventions rda
041 0# - LANGUAGE CODE
Language code of text/sound track or separate title eng
Language code of summary or abstract eng
-- ara
049 ## - Acquisition Source
Acquisition Source Deposit
082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER
Classification number 633.32
092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC)
Classification number 633.32
Edition number 21
097 ## - Degree
Degree Ph.D
099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC)
Local Call Number Cai01.07.10.Ph.D.2024.Ha.M
100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME
Authority record control number or standard number Hagar Mostafa Mohamed Mohamed,
Preparation preparation.
245 10 - TITLE STATEMENT
Title Molecular marker development and characterization in egyptian clover (Trifolium alexandrinum L.) /
Statement of responsibility, etc. by Hagar Mostafa Mohamed Mohamed ; Supervisors Dr. Salah El-Din Sayed Mohamed El-Assal, Dr. Abdel-Kader Youssef Gamal El-Din, Dr. Dina Aziz El-Khishin.
246 15 - VARYING FORM OF TITLE
Title proper/short title تطوير وتوصيف الكواشف الجزيئيه في البرسيم المصرى (Trifolium alexandrinum L.) /
264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE
Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice 2024.
300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION
Extent 139 pages :
Other physical details illustrations ;
Dimensions 25 cm. +
Accompanying material CD.
336 ## - CONTENT TYPE
Content type term text
Source rda content
337 ## - MEDIA TYPE
Media type term Unmediated
Source rdamedia
338 ## - CARRIER TYPE
Carrier type term volume
Source rdacarrier
502 ## - DISSERTATION NOTE
Dissertation note Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE
Bibliography, etc. note Bibliography: pages 122-139.
520 ## - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. Egyptian clover (Trifolium alexandrinum) has received limited attention regarding its genetic diversity, rendering it susceptible to climate change. Exploring its genetic resources is vital for enhancing the diversity within its germplasm to develop resilient Berseem varieties, thereby optimizing breeding programs. Twenty-four Berseem accessions were examined, using three different molecular marker types i.e, Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) (10 primers), Start Codon Targeted polymorphism (SCoT) (22 primers) and Sequence-Related Amplified Polymorphism (SRAP) (17 primer combinations) revealed a high genetic variability. ISSR markers had the highest polymorphism rate (82.2%) compared to SCoT (69.6%) and SRAP (65.2%). Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) clustering analysis divided the studied accessions into two major groups that supported by STRUCTURE analysis, which split samples into two subpopulations (∆K = 2). Additionally, this classification was verified by both principal component analysis (PCA) and a heat map. The study underscores the importance of Berseem's genetic diversity in crop development and breeding, with ISSR markers offering valuable insights due to their high polymorphism. Despite the diverse geographic origins of the accessions, the lack of geographic clustering implies significant genetic mixing, possibly because of high outcrossing facilitated by insect pollination or self-incompatibility. The combined use of multiple markers deepens our understanding of Berseem's genetics by providing more detailed and comprehensive coverage of the clover genome, allowing for increased resolution, validation of results and a holistic perspective on the genomic landscape furthermore, identifying and recommending specific Berseem accessions (NGB-43724, NGB-19680, Gemeiza1, and Giza6) as prospective candidates for future breeding programs in Egypt.was taken into consideration utilizing DNA barcoding, our study thoroughly examines the genetic makeup of Fahl (ARC) and Meskawi (acc. 43724) populations, contributing crucial data for conservation and breeding endeavors. The study also explored gene expression responses of Trifolium alexandrinum under varied drought durations, revealing consistent patterns with known stress responses. Key genes, including 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase, and senescence-associated protein (putative). showed notable expression changes, laying the groundwork for understanding drought resilience mechanisms in this crop
520 ## - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. بدأت الدراسة بفحص تنوع البرسيم المصري (Trifolium alexandrinum L.) والذى حظى باهتماممحدود من خلال تقييم موارده الوراثية لتعزيز تطوير أصناف متينة. استخدمت الدراسة ثلاثة أنواع من المعلمات الجزيئية: متكررة تكرار التسلسل البسيط (ISSR) باستخدام 10 برايمرات، المعلم المستهدف لكودون البدء (SCoT) باستخدام 22 برايمر، وتكرار التسلسل المرتبط بالتضاعف باستخدام 17 مجموعة برايمرات، وكشفت هذه العلامات عن تباين وراثي عالٍ. سجلت المعلمات ISSR أعلى معدل للتعدد الظاهري (82.2٪) مقارنة بالـ (69.6٪) SCoT و (65.2٪). SRAP<br/>قسّم تحليل تجميع الأزواج غير الموزونة بالمتوسط الحسابي (UPGMA) العينات إلى مجموعتين رئيسيتين، ولقد دعم تحليل STRUCTURE والذي قد قسم العينات إلى مجموعتين فرعيتين (∆K = 2) تم التحقق من هذا التصنيف باستخدام تحليل المكونات الرئيسية (PCA) وخريطة الحرارة، مما سلط الضوء على أهمية التنوع الوراثي في تطوير المحاصيل.<br/>أثبتت الدراسة أن المعلمات ISSR توفر تحقيقات قيمة بفضل تعدد ظواهرها الوراثية العالية. على الرغم من التنوع الجغرافي للعينات لم يظهر التجميع الجغرافي مما قد يعني وجود مزيج جيني هام ربما نتيجة للتلقيح الحشري أو عدم التوافق الذاتي. عمّق استخدام العلامات المتعددة فهمنا للجينات في البرسيم من خلال توفير تغطية أكثر تفصيلًا وشمولية للجينوم.<br/>حددت الدراسة عينات محددة من البرسيم NGB-43724و NGB-19680 و Gemeiza1، وGiza6 كمرشحين محتملين لبرامج التربية المستقبلية في مصر. من خلال استخدام ترميز الحمض النووي barcoding ، فحصت الدراسة الخلفية الجينية لسلالات الفحل (ARC) والمسقاوي (acc. 43724) ، مما ساهم ببيانات حيوية لجهود الحفظ والتربية.<br/>أظهرت استجابات تعبير الجينات لـ Trifolium alexandrinum تحت ظروف الجفاف المتغيرة أنماطًا ثابتة مع استجابات إجهاد معروفة. سجلت الجينات الرئيسية مثل الديوكسيجينيز والفينول البيرفيرات و وكربوكسيليز الريبولوز-1و5-ثنائي الفوسفات/ الأكسجيناز. وبروتين مرتبط بالشيخوخة (افتراضي) تغييرات
530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE
Issues CD Issues also as CD.
546 ## - LANGUAGE NOTE
Text Language Text in English and abstract in Arabic & English.
650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element clover
Source of heading or term qrmak
653 #0 - INDEX TERM--UNCONTROLLED
Uncontrolled term Trifolium
-- Berseem
-- ISSR
-- SCoT
-- SRAP
-- Genetic diversity
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Salah El-Din Sayed Mohamed El-Assal
Relator term thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Abdel-Kader Youssef Gamal El-Din
Relator term thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Dina Aziz El-Khishin
Relator term thesis advisor.
900 ## - Thesis Information
Grant date 01-01-2024
Supervisory body Salah El-Din Sayed Mohamed El-Assal
-- Abdel-Kader Youssef Gamal El-Din
-- Dina Aziz El-Khishin
Discussion body Mohamed Abd-Elsallam Rashed
-- Mohamed Abd-Elhamid Elawady
Universities Cairo University
Faculties Faculty of Agriculture
Department Department of Genetics
905 ## - Cataloger and Reviser Names
Cataloger Name Shimaa
942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA)
Source of classification or shelving scheme Dewey Decimal Classification
Koha item type Thesis
Edition 21
Suppress in OPAC No
Holdings
Source of classification or shelving scheme Home library Current library Date acquired Inventory number Full call number Barcode Date last seen Effective from Koha item type
Dewey Decimal Classification المكتبة المركزبة الجديدة - جامعة القاهرة قاعة الرسائل الجامعية - الدور الاول 10.06.2025 91373 Cai01.07.10.Ph.D.2024.Ha.M 01010110091373000 10.06.2025 10.06.2025 Thesis
Under the supervision of New Central Library Manager

Implemented and Customized by: Eng.M.Mohamady
Contact:   info@cl.cu.edu.eg

© All rights reserved  New Central Library