Proteomic profiling of circulating extracellular vesicles as novel non-invasive biomarkers for lymph node metastasis in breast cancer / (Record no. 172766)
[ view plain ]
| 000 -LEADER | |
|---|---|
| fixed length control field | 08350namaa22004331i 4500 |
| 003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER | |
| control field | OSt |
| 005 - أخر تعامل مع التسجيلة | |
| control field | 20250628142649.0 |
| 008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION | |
| fixed length control field | 250628s2024 ua a|||frm||| 000 0 eng d |
| 040 ## - CATALOGING SOURCE | |
| Original cataloguing agency | EG-GICUC |
| Language of cataloging | eng |
| Transcribing agency | EG-GICUC |
| Modifying agency | EG-GICUC |
| Description conventions | rda |
| 041 0# - LANGUAGE CODE | |
| Language code of text/sound track or separate title | eng |
| Language code of summary or abstract | eng |
| -- | ara |
| 049 ## - Acquisition Source | |
| Acquisition Source | Deposit |
| 082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER | |
| Classification number | 611.0181 |
| 092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC) | |
| Classification number | 611.0181 |
| Edition number | 21 |
| 097 ## - Degree | |
| Degree | M.Sc |
| 099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC) | |
| Local Call Number | Cai01.12.21.M.Sc.2024.La.P |
| 100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Authority record control number or standard number | Liali Yousef Talat Yousef, |
| Preparation | preparation. |
| 245 10 - TITLE STATEMENT | |
| Title | Proteomic profiling of circulating extracellular vesicles as novel non-invasive biomarkers for lymph node metastasis in breast cancer / |
| Statement of responsibility, etc. | by Liali Yousef Talat Yousef ; Supervisor Prof. Dr. Sherif Abdelaziz Ibrahim, Dr. Maher Hassan Ibraheem, Dr. Ghada Mohamed Abdel Salam Ahmed. |
| 246 15 - VARYING FORM OF TITLE | |
| Title proper/short title | التوصيف البروتيومي للحويصلات التي تدور خارج الخلية كمؤشرات حيوية جديدة غير توغلية لانتشار سرطان الثدي في العقدة اللمفاوية / |
| 264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE | |
| Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice | 2024. |
| 300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION | |
| Extent | 159 pages : |
| Other physical details | illustrations ; |
| Dimensions | 25 cm. + |
| Accompanying material | CD. |
| 336 ## - CONTENT TYPE | |
| Content type term | text |
| Source | rda content |
| 337 ## - MEDIA TYPE | |
| Media type term | Unmediated |
| Source | rdamedia |
| 338 ## - CARRIER TYPE | |
| Carrier type term | volume |
| Source | rdacarrier |
| 502 ## - DISSERTATION NOTE | |
| Dissertation note | Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2024. |
| 504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE | |
| Bibliography, etc. note | Bibliography: pages 101-156. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. | |
| Summary, etc. | Breast cancer, the most frequent cancer in women, has survival rates depending on tumor features, treatment, and socioeconomic factors. Obesity affects breast cancer outcomes by hastening disease progression, increasing metastasis risk, and decreasing the efficacy of systemic treatments. The early diagnosis of lymph node metastasis (LNM), a major prognostic indication, remains difficult, emphasizing the need for novel diagnostic approaches. Extracellular vesicles (EVs), including exosomes, microvesicles (MVs) and apoptotic bodies, are circulating in blood and their cargo represents promising diagnostic markers. We aimed in this study to explore the potential of plasma-derived MVs as non-invasive biomarkers for LNM in obese breast cancer patients by profiling their proteomic content. We used differential centrifugation to isolate MVs from the plasma of 39 obese breast cancer patients with negative LNM (nLNM; n=19) and positive LNM (pLNM; n=20), and then performed a proteome study using liquid chromatography–mass spectrometry (LC-MS) and a proteases array to identify the MVs’ proteomic and proteases content. Our proteomic study demonstrated that MVs from pLNM patients contained more proteins than those from nLNM patients, including Fibronectin (FN). We further verified by Western blot and ELISA significantly higher FN levels in pLNM patients relative to nLNM patients. After establishing the link between FN and the syndecan family by STRING protein network analysis, our western blot analysis showed that only SDC2 was notably enriched in MVs from pLNM patients compared to those with nLNM. Various bioinformatics tools revealed the expression patterns and prognostic significance of SDC2, highlighting its link to LNM and breast cancer staging. Additionally, we utilized unbiased Proteome Profiler Human Protease Array to analyze proteases in MVs from obese breast cancer patients with nLNM and pLNM. Our findings reveal a decrease in several proteases in pLNM compared to nLNM, with matrix metalloproteinase-8 (MMP-8) being the only protease significantly increased by 2.2-fold. These results indicate that circulating MV-derived FN, SDC2, and MMP-8 may have a potential as non-invasive biomarkers for detecting LNM in breast cancer, offering new possibilities for managing metastatic disease. However, additional research is required to confirm their diagnostic value in a larger group of breast cancer patients. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. | |
| Summary, etc. | سرطان الثدي، وهو أكثر أنواع السرطان شيوعًا بين النساء، لديه معدلات بقاء على قيد الحياة تعتمد على خصائص الورم، العلاج، والعوامل الاجتماعية الاقتصادية. تؤثر السمنة على نتائج سرطان الثدي من خلال تسريع تقدم المرض، زيادة خطر الانتشار، وتقليل فعالية العلاجات النظامية. يظل التشخيص المبكر لانتشار السرطان في العقد اللمفاوية(LNM) ، وهو مؤشر تنبؤي رئيسي، صعبًا، مما يبرز الحاجة إلى أساليب تشخيص جديدة. في عينات الدم، تشمل الحويصلات التي تدور خارج الخلية (EVs) على الإكسوسومات، الحويصلات الدقيقة(MVs) وجسيمات الموت المبرمج .تبحث هذه الدراسة في إمكانية استخدام MVs من البلازما كمؤشرات حيوية غير توغلية لـ LNM في مريضات سرطان الثدي البدينات من خلال تحليل محتواها الجزيئي. لقد استخدمنا الطرد المركزي التفاضلي لعزل MVs من بلازما 39 مريضة بسرطان الثدي البدينات، وقسمناهم إلى مجموعتين: أولئك الذين لديهم نتائج سلبية للعقد اللمفاويةnLNM) ، عدد =19 (وأولئك الذين لديهم نتائج إيجابية للعقد اللمفاويةpLNM) ، عدد =20)، ثم أجرينا دراسة بروتومية باستخدام LC-MS وشبكة أنزيمات البروتينات لتحديد بروتينات MV و أنزيمات البروتينات. أظهرت دراستنا البروتومية أن MVs من مرضى pLNM تحتوي على عدد أكبر من البروتينات المحددة مقارنة بتلك التي من مرضى nLNM ومن ضمنهم الفايبرونيكتين (FN) المتواجد في كلا المجموعتين. أظهرت وسائل التحقق باستخدام الواسترن بلوت وELISA أن مستويات FN كانت مرتفعة بشكل ملحوظ في مرضى pLNM مقارنةً بالذين يعانون من .nLNM بعد إثبات الصلة بين FN وعائلة السندكان من خلال تحليل شبكة البروتين STRING، أظهر تحليلنا الخاصة بالواسترن بلوت أن SDC2 فقط كان غنيًا بشكل ملحوظ في MVs من مرضى pLNM مقارنةً بتلك من مرضى .nLNM كشفت أدوات المعلوماتية الحيوية المختلفة عن أنماط التعبير الجيني والأهمية التنبؤية لـSDC2، مما يبرز ارتباطه بـ LNMومراحل سرطان الثدي. بالإضافة إلى ذلك، استخدمنا Proteome Profiler Human Protease Array Kit لتقييم أنزيمات البروتينات في MVs من مريضات سرطان الثدي البدينات مع nLNM و .pLNMتكشف نتائجنا عن انخفاض في العديد من أنزيمات البروتينات في pLNM مقارنةً بـ nLNM، مع زيادة أنزيم البروتين واحد فقط بشكل كبير بمقدار 2.2 ضعف وهو ميتالوبروتيناز-8 .(MMP-8) تشير هذه النتائج إلى أن FN و SDC2وMMP-8 المشتقين من MVs الدوارة لديهم إمكانية كمؤشرات حيوية غير جراحية لاكتشاف LNM في سرطان الثدي، مما يوفر إمكانيات جديدة للتعامل مع المرض الانتشاري. ومع ذلك، هناك حاجة إلى مزيد من البحث لتأكيد قيمتها التشخيصية في مجموعة أكبر من مرضى سرطان الثدي. |
| 530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE | |
| Issues CD | Issues also as CD. |
| 546 ## - LANGUAGE NOTE | |
| Text Language | Text in English and abstract in Arabic & English. |
| 650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM | |
| Topical term or geographic name entry element | Cell biology |
| Source of heading or term | qrmak |
| 653 #0 - INDEX TERM--UNCONTROLLED | |
| Uncontrolled term | Breast cancer |
| -- | Obesity |
| -- | Extracellular vesicles |
| -- | Lymph node metastasis |
| -- | Fibronectin |
| -- | Syndecan-2 |
| -- | Liquid biopsy |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Sherif Abdelaziz Ibrahim |
| Relator term | thesis advisor. |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Maher Hassan Ibraheem |
| Relator term | thesis advisor. |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Ghada Mohamed Abdel Salam Ahmed |
| Relator term | thesis advisor. |
| 900 ## - Thesis Information | |
| Grant date | 01-01-2024 |
| Supervisory body | Sherif Abdelaziz Ibrahim |
| -- | Maher Hassan Ibraheem |
| -- | Ghada Mohamed Abdel Salam Ahmed |
| Universities | Cairo University |
| Faculties | Faculty of Science |
| Department | Department of Zoology |
| 905 ## - Cataloger and Reviser Names | |
| Cataloger Name | Shimaa |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) | |
| Source of classification or shelving scheme | Dewey Decimal Classification |
| Koha item type | Thesis |
| Edition | 21 |
| Suppress in OPAC | No |
| Source of classification or shelving scheme | Home library | Current library | Date acquired | Inventory number | Full call number | Barcode | Date last seen | Effective from | Koha item type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Dewey Decimal Classification | المكتبة المركزبة الجديدة - جامعة القاهرة | قاعة الرسائل الجامعية - الدور الاول | 28.06.2025 | 91692 | Cai01.12.21.M.Sc.2024.La.P | 01010110091692000 | 28.06.2025 | 28.06.2025 | Thesis |