Normal view MARC view ISBD view

The role of RNA in diagnosis of severe acute syndrome coronavirus 2 / (Record no. 178267)

MARC details
000 -LEADER
fixed length control field	08827namaa22004571i 4500
003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER
control field	EG-GICUC
005 - أخر تعامل مع التسجيلة
control field	20260216102449.0
008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION
fixed length control field	260208s2025 ua a\|\|\|frm\|\|\| 000 0 eng d
040 ## - CATALOGING SOURCE
Original cataloguing agency	EG-GICUC
Language of cataloging	eng
Transcribing agency	EG-GICUC
Modifying agency	EG-GICUC
Description conventions	rda
041 0# - LANGUAGE CODE
Language code of text/sound track or separate title	eng
Language code of summary or abstract	eng
--	ara
049 ## - Acquisition Source
Acquisition Source	Deposit
082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER
Classification number	579.25
092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC)
Classification number	579.25
Edition number	21
097 ## - Degree
Degree	Ph.D
099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC)
Local Call Number	Cai01.12.21.Ph.D.2025.Ay.R
100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME
Authority record control number or standard number	Aya Ahmed Saeed Mohamed Soliman,
Preparation	preparation.
245 14 - TITLE STATEMENT
Title	The role of RNA in diagnosis of severe acute syndrome coronavirus 2 /
Statement of responsibility, etc.	by Aya Ahmed Saeed Mohamed Soliman ; Supervisors Prof. Dr. Abeer Mahmoud Badr, Prof. Dr. Emad Mahmoud Ibrahim El-Zayat, Prof.Dr. Abdelrahman Nabwi Zekri, Prof. Dr. Ola Sayed Ahmed.
246 15 - VARYING FORM OF TITLE
Title proper/short title	دور الحمض النووي الريبوزي فيتشخيص متلازمة الإلتهاب التنفسي الحاد الشديد فيروس كورونا 2
264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE
Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice	2025.
300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION
Extent	96 pages :
Other physical details	illustrations ;
Dimensions	25 cm. +
Accompanying material	CD.
336 ## - CONTENT TYPE
Content type term	text
Source	rda content
337 ## - MEDIA TYPE
Media type term	Unmediated
Source	rdamedia
338 ## - CARRIER TYPE
Carrier type term	volume
Source	rdacarrier
502 ## - DISSERTATION NOTE
Dissertation note	Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2025.
504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE
Bibliography, etc. note	Bibliography: pages 75-92.
520 #3 - SUMMARY, ETC.
Summary, etc.	Background: Rapid pulmonary replication of SARS-CoV-2 can potentially trigger a strong <br/>immune response. Viral infections activate both the innate and adaptive immune systems, with <br/>cellular immune response particularly the role of T lymphocytes being crucial for actual antiviral <br/>defense beside COVID-19. Among the variants of SARS-CoV-2, the D614G mutation in the spike <br/>protein has become the furthermost widespread strain globally during the pandemic. This mutation <br/>is linked with increased infectivity and transmissibility and has been identified as the most frequent <br/>mutation reported in Egypt. Vector detection has been the subject of the development of numerous <br/>diagnostic assays, including point-of-care medical diagnostic systems and real-time polymerase <br/>chain reaction (RT-PCR). For rapid, naked-eye molecular diagnosis of COVID-19, we present a <br/>step-by-step protocol for an RNA-extraction-free, nano-amplified colorimetric assay. Plasmonic <br/>gold nanoparticles encapsulated with antisense oligonucleotides (ASOs) serve as the colorimetric <br/>reporter in our nano-amplified, RNA-extraction-free colorimetric assay. Results: The rate of <br/>CD3+CD8+ T-cells was significantly increased (P < 0.001) in ICU-admitted patients compared to <br/>both healthy people and patients with mild symptoms, while frequency of CD3+CD4+ T-cells was <br/>significantly decreased (P < 0.001) in ICU patients relative to the other groups. The CD4+/CD8+ <br/>ratio demonstrated 100% sensitivity and specificity for predicting disease severity. T-cell immune <br/>responses subsequent infection with the D614G-mutated SARS-CoV-2 strain, showing an increase <br/>in CD8+ T-cell frequency from day 6 to day 17 post-infection. Additionally, specific HLA-A <br/>alleles, including HLA-A24:02 and HLA-A02:01, were associated with the evaluation of specific <br/>peptides .By using RNA-extraction-free nanoamplified colorimetric test with clinical samples, the <br/>sensitivity and specificity were found to be >96.6% and 100%, respectively. Conclusion: The <br/>CD4+/CD8+ ratio may serve as a valuable prognostic marker for disease severity in COVID-19 <br/>patients. Monitoring CD8+ T-cell levels could help identify patients with mild symptoms who are <br/>at threat of requiring ICU admission. Furthermore, the SARS-CoV-2 D614G mutation is <br/>associated with an increased frequency of CD3+CD8+ T cells in Egyptian patients.The RNA-<br/>extraction-free nanoamplified colorimetric test can be customized for assessing different viral <br/>infections simply through minor modifications to the ASOs and primer sequences.
520 #3 - SUMMARY, ETC.
Summary, etc.	الخلفية: يمكن أن يؤدي التكاثر السريع لفيروس SARS-CoV-2 في الرئة إلى تحفيز استجابة مناعية قوية. تقوم العدوى الفيروسية بتنشيط كل من الجهاز المناعي الفطري والتكيفي، حيث تلعب الاستجابة المناعية الخلوية، وخاصة دور الخلايا اللمفاوية التائية، دورًا حاسمًا في الدفاع الفعلي ضد الفيروسات، بما في ذلك COVID-19. من بين المتحورات المختلفة لفيروس SARS-CoV-2، أصبحت طفرة D614G في بروتين السنبلة السلالة الأكثر انتشارًا عالميًا خلال الجائحة. ترتبط هذه الطفرة بزيادة العدوى وقابلية الانتقال، وقد تم تحديدها على أنها الطفرة الأكثر شيوعًا في مصر.<br/>كان الكشف عن المتجهات موضوعًا لتطوير العديد من الفحوصات التشخيصية، بما في ذلك أنظمة التشخيص الطبي عند نقطة الرعاية وتفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي (RT-PCR). من أجل التشخيص الجزيئي السريع لفيروس COVID-19 بالعين المجردة، نقدم بروتوكولًا خطوة بخطوة لفحص لوني نانوي مضخم خالٍ من استخلاص الحمض النووي الريبي (RNA). يتم تغليف جسيمات الذهب النانوية البلازمونية مع قليل النيوكليوتيدات المضادة للحس (ASOs) لتعمل كمراسل لوني في اختبارنا اللوني النانوي المضخم والخالي من استخلاص الحمض النووي الريبي.<br/>النتائج: ارتفع معدل الخلايا التائية CD3+CD8+ بشكل ملحوظ (P < 0.001) لدى المرضى في وحدة العناية المركزة مقارنة بكل من الأشخاص الأصحاء والمرضى الذين يعانون من أعراض خفيفة، بينما انخفض معدل الخلايا التائية CD3+CD4+ بشكل ملحوظ (P < 0.001) لدى مرضى العناية المركزة مقارنة بالمجموعات الأخرى. أظهر معدل CD4+/CD8+ حساسية ونوعية بنسبة 100٪ في التنبؤ بشدة المرض. كما أظهرت الاستجابات المناعية للخلايا التائية بعد الإصابة بسلالة SARS-CoV-2 ذات الطفرة D614G زيادة في تكرار الخلايا التائية CD8+ من اليوم السادس إلى اليوم السابع عشر بعد الإصابة. بالإضافة إلى ذلك، ارتبطت أليلات HLA-A محددة، بما في ذلك HLA-A24:02 و HLA-A02:01، بتقييم ببتيدات معينة. عند استخدام الاختبار اللوني النانوي المضخم الخالي من استخلاص الحمض النووي الريبي مع العينات السريرية، وُجدت الحساسية والنوعية بنسبة >96.6٪و100٪ على التوالي.<br/>الاستنتاج: قد يكون معدل CD4+/CD8+ بمثابة علامة تنبؤية قيّمة لشدة المرض لدى مرضى COVID-19. يمكن أن يساعد رصد مستويات الخلايا التائية CD8+ في تحديد المرضى ذوي الأعراض الخفيفة المعرضين لخطر الحاجة إلى دخول العناية المركزة. علاوة على ذلك، ترتبط طفرة SARS-CoV-2 D614G بزيادة معدل الخلايا التائية CD3+CD8+ لدى المرضى المصريين. يمكن تخصيص الاختبار اللوني النانوي المضخم الخالي من استخلاص الحمض النووي الريبي لتقييم مختلف الإصابات الفيروسية من خلال تعديلات طفيفة على تسلسلات قليل النيوكليوتيدات المضادة للحس (ASOs) والبادئات.
530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE
Issues CD	Issues also as CD.
546 ## - LANGUAGE NOTE
Text Language	Text in English and abstract in Arabic & English.
650 #0 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element	Coronavirus
650 #0 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element	فيروس كورونا
653 #1 - INDEX TERM--UNCONTROLLED
Uncontrolled term	COVID-19
--	CD4+/CD8+ T-cells
--	D614G mutated SARS-CoV-2
--	Immuno-simulation
--	T cell propensity
--	Plasmonic gold nanoparticles
--	RNA-extraction
--	free nano
--	amplified colorimetric test
--	CD4+/CD8+الخلايا التائية
--	كوفيد-19
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name	Abeer Mahmoud Badr
Relator term	thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name	Emad Mahmoud Ibrahim El-Zayat
Relator term	thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name	Abdelrahman Nabwi Zekri
Relator term	thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name	Ola Sayed Ahmed
Relator term	thesis advisor.
900 ## - Thesis Information
Grant date	01-01-2025
Supervisory body	Abeer Mahmoud Badr
--	Emad Mahmoud Ibrahim El-Zayat
--	Abdelrahman Nabwi Zekri
--	Ola Sayed Ahmed
Universities	Cairo University
Faculties	Faculty of Science
Department	Department of Zoology
905 ## - Cataloger and Reviser Names
Cataloger Name	Shimaa
Reviser Names	Eman Ghareb
942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA)
Source of classification or shelving scheme	Dewey Decimal Classification
Koha item type	Thesis
Edition	21
Suppress in OPAC	No

Holdings
Source of classification or shelving scheme	Home library	Current library	Date acquired	Inventory number	Full call number	Barcode	Date last seen	Effective from	Koha item type
Dewey Decimal Classification	المكتبة المركزبة الجديدة - جامعة القاهرة	قاعة الرسائل الجامعية - الدور الاول	08.02.2026	93316	Cai01.12.21.Ph.D.2025.Ay.R	01010110093316000	08.02.2026	08.02.2026	Thesis

جامعة القاهرة

المكتبة المركزية الجديدة

مكتبة جامعة القاهرة الأهلية

The role of RNA in diagnosis of severe acute syndrome coronavirus 2 / (Record no. 178267)