MARC details
| 000 -LEADER |
|---|
| fixed length control field |
06356namaa22004331i 4500 |
| 003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER |
|---|
| control field |
EG-GICUC |
| 005 - أخر تعامل مع التسجيلة |
|---|
| control field |
20260312112220.0 |
| 008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION |
|---|
| fixed length control field |
260307s2024 ua a|||frm||| 000 0 eng d |
| 040 ## - CATALOGING SOURCE |
|---|
| Original cataloguing agency |
EG-GICUC |
| Language of cataloging |
eng |
| Transcribing agency |
EG-GICUC |
| Modifying agency |
EG-GICUC |
| Description conventions |
rda |
| 041 0# - LANGUAGE CODE |
|---|
| Language code of text/sound track or separate title |
eng |
| Language code of summary or abstract |
eng |
| -- |
ara |
| 049 ## - Acquisition Source |
|---|
| Acquisition Source |
Deposit |
| 082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER |
|---|
| Classification number |
571.4 |
| 092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC) |
|---|
| Classification number |
571.4 |
| Edition number |
21 |
| 097 ## - Degree |
|---|
| Degree |
M.Sc |
| 099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC) |
|---|
| Local Call Number |
Cai01.12.04.M.Sc.2024.Ha.C |
| 100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Authority record control number or standard number |
Hazem Reda Mohamed Awad Saied, |
| Preparation |
preparation. |
| 245 10 - TITLE STATEMENT |
|---|
| Title |
Computational study on high risk human papilloma virus HPV / |
| Statement of responsibility, etc. |
by Hazem Reda Mohamed Awad Saied ; Supervisors Prof. Dr. Maha Anwar Ali, Prof. Dr. Abdo A. Elfiky. |
| 246 15 - VARYING FORM OF TITLE |
|---|
| Title proper/short title |
دراسة حسابية على فيروس الورم الحليمي عالي الخطورة |
| 264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE |
|---|
| Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice |
2025. |
| 300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION |
|---|
| Extent |
98 pages : |
| Other physical details |
illustrations ; |
| Dimensions |
25 cm. + |
| Accompanying material |
CD. |
| 336 ## - CONTENT TYPE |
|---|
| Content type term |
text |
| Source |
rda content |
| 337 ## - MEDIA TYPE |
|---|
| Media type term |
Unmediated |
| Source |
rdamedia |
| 338 ## - CARRIER TYPE |
|---|
| Carrier type term |
volume |
| Source |
rdacarrier |
| 502 ## - DISSERTATION NOTE |
|---|
| Dissertation note |
Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2025. |
| 504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE |
|---|
| Bibliography, etc. note |
Bibliography: pages 89-98. |
| 520 #3 - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
Background: Human papillomavirus (HPV) is a well-established etiologic agent for various cancers, particularly cervical cancer. Its oncoprotein, E6, disrupts cellular processes by targeting key proteins like p53 and E6AP. Recent research suggests that the host cell chaperone, glucose-regulated protein 78 (GRP78), plays a critical role in HPV infectivity through its interaction with the viral E6 and E7 proteins.<br/>Aim: This study aimed to identify small molecule inhibitors that could disrupt the interaction between E6 and cellular factors like E6AP, GRP78, and p53.<br/>Methods: A molecular docking protocol was employed to screen 115 small molecule compounds against three binding sites on HPV E6 responsible for interactions with the host cell proteins: E6AP, p53, and GRP78. Subsequently, molecular dynamics simulations and free energy calculations were performed on the top three complexes identified through docking.<br/>Results: The docking analysis revealed 18 compounds with promising binding affinities towards different binding sites on HPV E6, exhibiting lower free energies compared to the positive control, paclitaxel. Two<br/>compounds, hypericin and anabsinthin, emerged as the most effective candidates, demonstrating stable binding to HPV E6 throughout a 100 ns molecular dynamics simulation. The calculated average free energies for hypericin and anabsinthin were -18.76 kcal/mol and -14.40 kcal/mol, respectively. Both compounds formed stable complexes with the three binding sites primarily through hydrophobic interactions. Key residues responsible for stabilizing these ligands within the binding pockets of HPV E6 were identified as V31, Y32, V62, and Y70 (E6AP binding site), P13, C16, T22, I23, and A46 (p53 binding site), and M1, V31, L50, L67, and Q107 (GRP78 binding site). |
| 520 #3 - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
فيروس الورم الحليمي البشري هو عامل مسبب لأنواع مختلفة من السرطان، وخاصة<br/>سرطان عنق الرحم. يقوم البروتين الورمي إي 6 بتعطيل العمليات الخلوية عن طريق<br/>استهداف البروتينات الرئيسية مثل بروتين إي 6 المرتبط ، بي .53 وتشير الأبحاث الحديثة<br/>إلى أن مرافق الخلية المضيفة، البروتين المنظم للجلوكوز جي أر بي 78 ، يلعب دورًا حاسمًا<br/>في عدوى فيروس الورم الحليمي البشري من خلال تفاعله مع البروتينات الفيروسية إي .6<br/>تهدف هذه الدراسة إلى تحديد مثبطات من جزيئات صغيرة التي يمكن أن تعطل التفاعل بين<br/>تم استخدام<br/> مثل )بروتين إي 6 المرتبط ، بي 53، جي أر بي 78 .(<br/> إي 6 والعوامل الخلوية<br/> <br/><br/>بروتوكول الالتحام الجزيئي لفحص 115 مركبًا جزيئيًا صغيرًا مقابل ثلاثة مواقع ربط على<br/>فيروس الورم الحليمي البشري إي 6 المسؤول عن التفاعلات مع بروتينات )بروتين إي 6<br/>المرتبط ، بي 53، جي أر بي 78 ( وفي وقت لاحق، تم إجراء محاكاة الديناميكيات الجزيئية<br/>وحسابات الطاقة الحرة على المجمعات الثلاثة الأولى التي تم تحديدها من خلال الالتحام.<br/>كشف تحليل الالتحام عن 18 مركبًا ذات ارتباطات ربط واعدة تجاه مواقع ربط مختلفة على<br/><br/>فيروس الورم الحليمي البشري إي 6، مما يُظهر طاقات حرة أقل مقارنةً بالتحكم الإيجابي،<br/><br/>باكليتاكسيل. ظهر مركبان، هيبرسين و أنابسنثين ، كأكثر المرشحين فعالية، مما يدل على<br/>الارتباط المستقر لفيروس الورم الحليمي البشري إي 6 خلال محاكاة للديناميكيات الجزيئية<br/>سعرة<br/>-18.76<br/> تبلغ 100 نانوثانية. كان متوسط الطاقات الحرة المحسوبة لكل من هيبرسين<br/>حرارية/مول، وفي حالة أنابسنثين 14.40- سعرة حرارية/مول، على التوالي. وقد شكل كلا<br/>المركبين روابط مستقرة مع مواقع الارتباط الثلاثة بشكل أساسي من خلال التفاعلات الكارهة<br/>للماء. و قد تم تحديد الأحماض الامينية المسئولة والمشاركة في هذا الإرتباط في كل موقع<br/>إرتباط. |
| 530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE |
|---|
| Issues CD |
Issues also as CD. |
| 546 ## - LANGUAGE NOTE |
|---|
| Text Language |
Text in English and abstract in Arabic & English. |
| 650 #0 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Topical term or geographic name entry element |
Molecular Biophysics |
| 650 #0 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Topical term or geographic name entry element |
الفيزياء الحيوية |
| 653 #1 - INDEX TERM--UNCONTROLLED |
|---|
| Uncontrolled term |
Human Papilloma Virus |
| -- |
E6 |
| -- |
E6AP |
| -- |
P53 |
| -- |
GRP78 |
| -- |
Computational Biophysics |
| -- |
فيروس الورم الحليمي |
| -- |
الإرساء الجزيئي للمركبات |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Maha Anwar Ali |
| Relator term |
thesis advisor. |
| 700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Abdo A. Elfiky |
| Relator term |
thesis advisor. |
| 900 ## - Thesis Information |
|---|
| Grant date |
01-01-2025 |
| Supervisory body |
Maha Anwar Ali |
| -- |
Abdo A. Elfiky |
| Universities |
Cairo University |
| Faculties |
Faculty of Science |
| Department |
Department of Biophysics |
| 905 ## - Cataloger and Reviser Names |
|---|
| Cataloger Name |
Shimaa |
| Reviser Names |
Eman Ghareb |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) |
|---|
| Source of classification or shelving scheme |
Dewey Decimal Classification |
| Koha item type |
Thesis |
| Edition |
21 |
| Suppress in OPAC |
No |