Multi-omics characterization of childhood Rhabdomyosarcoma / (Record no. 179745)

MARC details
000 -LEADER
fixed length control field 06757namaa22004331i 4500
003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER
control field EG-GICUC
005 - أخر تعامل مع التسجيلة
control field 20260601131933.0
008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION
fixed length control field 260426s2025 ua a|||frm||| 000 0 eng d
040 ## - CATALOGING SOURCE
Original cataloguing agency EG-GICUC
Language of cataloging eng
Transcribing agency EG-GICUC
Modifying agency EG-GICUC
Description conventions rda
041 0# - LANGUAGE CODE
Language code of text/sound track or separate title eng
Language code of summary or abstract eng
-- ara
049 ## - Acquisition Source
Acquisition Source Deposit
082 04 - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER
Classification number 618.9299473
092 ## - LOCALLY ASSIGNED DEWEY CALL NUMBER (OCLC)
Classification number 618.9299473
Edition number 21
097 ## - Degree
Degree M.Sc
099 ## - LOCAL FREE-TEXT CALL NUMBER (OCLC)
Local Call Number Cai01.12.25.Ph.D.2025.Ay.M
100 0# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME
Authority record control number or standard number Aya Osama Fekry Ibrahim Khamis,
Preparation preparation.
245 10 - TITLE STATEMENT
Title Multi-omics characterization of childhood Rhabdomyosarcoma /
Statement of responsibility, etc. by Aya Osama Fekry Ibrahim Khamis ; Supervisors Prof. Dr. Emad El-Zayat, Prof. Dr. Sameh Magdeldin Mohamed.
246 15 - VARYING FORM OF TITLE
Title proper/short title توصيف الاوميكس المتعدد للساركوما العضلية المخططة في مرحله الطفوله
264 #0 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE
Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice 2025.
300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION
Extent 106 Leaves :
Other physical details illustrations ;
Dimensions 30 cm. +
Accompanying material CD.
336 ## - CONTENT TYPE
Content type term text
Source rda content
337 ## - MEDIA TYPE
Media type term Unmediated
Source rdamedia
338 ## - CARRIER TYPE
Carrier type term volume
Source rdacarrier
502 ## - DISSERTATION NOTE
Dissertation note Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2025.
504 ## - BIBLIOGRAPHY, ETC. NOTE
Bibliography, etc. note Bibliography: pages 90-100.
520 #3 - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. Rhabdomyosarcoma (RMS) is the most common pediatric soft tissue sarcoma, <br/>arising from skeletal muscle progenitor cells that fail to complete differentiation. It is <br/>classified into two primary subtypes, embryonal (ERMS) and alveolar (ARMS), which <br/>differ in histopathological features, molecular drivers, clinical progression, and treatment <br/>response. Given the disease’s heterogeneity and the scarcity of targeted therapies, a <br/>comprehensive molecular approach is crucial for advancing disease understanding and <br/>therapeutic development. In this study, we applied integrative multi-omics profiling, <br/>including transcriptomics, proteomics, and metabolomics, on plasma samples from <br/>children with ERMS (n=18), ARMS (n=17), and matched healthy controls (n=18). <br/>Transcriptomic analysis revealed subtype-specific microRNA (miRNA) signatures with <br/>therapeutic potential, including the upregulation of hsa-miR-483-3p in ERMS and hsa-<br/>miR-16-5p in ARMS. Proteomic profiling identified elevated oncogenic and stemness-<br/>associated proteins in ARMS, such as cyclin E1, FAP, and myotrophin, while ERMS <br/>showed enrichment of immune-related and myogenic proteins including myosin-9, SAA2, <br/>and S100A11. Metabolomic analysis revealed dysregulated lipid transport, fatty acid <br/>metabolism, and polyamine biosynthesis in ARMS, whereas ERMS exhibited alterations <br/>in glutamate/glycine metabolism and redox balance. Functional enrichment analyses (GO, <br/>KEGG, RaMP-DB), co-expression network modeling (WGCNA/WMCNA), and multi-<br/>omics integration using DIABLO and MOFA uncovered coordinated protein–metabolite–<br/>miRNA modules that distinguished each subtype and correlated with clinical features such <br/>as disease stage, lymph node involvement, and age. These findings provide a <br/>comprehensive molecular landscape of RMS subtypes, highlight candidate biomarkers and <br/>regulatory miRNAs, and propose new opportunities for precision diagnostics and targeted <br/>therapy in pediatric RMS.
520 #3 - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. سرطان العضلات المخططة (RMS) هو أكثر أنواع الساركوما شيوعًا لدى الأطفال، وينشأ من الخلايا السلفية للعضلات الهيكلية التي تفشل في إكمال عملية التمايز. يُصنَّف هذا السرطان إلى نوعين رئيسيين: النوع الجنيني (ERMS) والنوع السنخي (ARMS)، ويختلفان في الخصائص النسيجية المرضية، والمحفزات الجزيئية، والتطور السريري، والاستجابة للعلاج. نظرًا لتغايرية المرض وندرة العلاجات الموجهة، فإن اتباع نهج جزيئي شامل يعد أمرًا ضروريًا لتعزيز فهم المرض وتطوير العلاجات. في هذه الدراسة، أجرينا تحليلًا تكامليًا متعدد الأوميكس، شمل علم النسخ (Transcriptomics)، وعلم البروتينات (Proteomics)، وعلم الميتابولوميات (Metabolomics)، على عينات بلازما مأخوذة من أطفال مصابين بـ ERMS (عدد = 18) وARMS (عدد = 17) ومجموعة ضابطة من الأصحاء المتطابقين في العمر والجنس (عدد = 18). أظهر تحليل النسخ الجيني أنماطًا مميزة من الميكروRNA (miRNA) ذات إمكانات علاجية، بما في ذلك زيادة تنظيم hsa-miR-483-3p في ARMS وhsa-miR-16-5p في ERMS. كشف تحليل البروتيوميات عن ارتفاع بروتينات مرتبطة بالأورام وخواص الخلايا الجذعية في ARMS، مثل cyclin E1 وFAP وmyotrophin، بينما أظهر ERMS إثراءً في بروتينات مناعية وعضلية مثل myosin-9 وSAA2 وS100A11. أما تحليل الميتابولوميات فقد أظهر خللًا في نقل الدهون، واستقلاب الأحماض الدهنية، وتخليق البولي أمين في ARMS، في حين أظهر ERMS تغيرات في استقلاب الجلوتامات/الجلايسين والتوازن التأكسدي. كشفت تحليلات الإثراء الوظيفي (GO، KEGG، RaMP-DB)، ونمذجة شبكات التعبير المشترك (WGCNA/WMCNA)، والتكامل متعدد الأوميكس باستخدام DIABLO وMOFA عن وحدات متكاملة من البروتينات-المستقلبات-الميكروRNA تميز كل نمط فرعي، وترتبط بالخصائص السريرية مثل مرحلة المرض، وتورط العقد اللمفاوية، والعمر. توفر هذه النتائج خريطة جزيئية شاملة لأنماط RMS الفرعية، وتسلط الضوء على مؤشرات حيوية مرشحة وميكروRNAs تنظيمية، وتقترح فرصًا جديدة للتشخيص الدقيق والعلاج الموجه في RMS لدى الأطفال.
530 ## - ADDITIONAL PHYSICAL FORM AVAILABLE NOTE
Issues CD Issues also as CD.
546 ## - LANGUAGE NOTE
Text Language Text in English and abstract in Arabic & English.
650 #0 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element Rhabdomyosarcoma
650 #0 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element سرطان العضلات المخططة
653 #1 - INDEX TERM--UNCONTROLLED
Uncontrolled term Rhabdomyosarcoma
-- transcriptomics
-- proteomics and metabolomics
-- سرطان العضلات المخططة
-- علم النسخ
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Emad El-Zayat
Relator term thesis advisor.
700 0# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Sameh Magdeldin Mohamed
Relator term thesis advisor.
900 ## - Thesis Information
Grant date 01-01-2025
Supervisory body Emad El-Zayat
-- Sameh Magdeldin Mohamed
Universities Cairo University
Faculties Faculty of Science
Department Department of Biotechnology
905 ## - Cataloger and Reviser Names
Cataloger Name Shimaa
Reviser Names Eman Ghareb
942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA)
Source of classification or shelving scheme Dewey Decimal Classification
Koha item type Thesis
Edition 21
Suppress in OPAC No
Holdings
Source of classification or shelving scheme Home library Current library Date acquired Inventory number Full call number Barcode Date last seen Effective from Koha item type
Dewey Decimal Classification المكتبة المركزبة الجديدة - جامعة القاهرة قاعة الرسائل الجامعية - الدور الاول 26.04.2026 93876 Cai01.12.25.Ph.D.2025.Ay.M 01010110093876000 26.04.2026 26.04.2026 Thesis
Cairo University Libraries Portal Implemented & Customized by: Eng. M. Mohamady Contacts: new-lib@cl.cu.edu.eg | cnul@cl.cu.edu.eg
CUCL logo CNUL logo
© All rights reserved — Cairo University Libraries
CUCL logo
Implemented & Customized by: Eng. M. Mohamady Contact: new-lib@cl.cu.edu.eg © All rights reserved — New Central Library
CNUL logo
Implemented & Customized by: Eng. M. Mohamady Contact: cnul@cl.cu.edu.eg © All rights reserved — Cairo National University Library