Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2024.

Bibliography: pages 130-156.

The Deeba Triangle and the coasts of the Suez Canal represent vital areas for marine fish farming in Egypt. This study investigated parasitic and bacterial co-infections causing significant morbidity and mortality in farmed thin-lipped grey mullet (Liza ramada) and keeled mullet (L. carinata) as well as European seabass (Dicentrarchus labrax) and flathead grey mullet (Mugil cephalus) at private fish farms located on the Suez canal coast and Deeba Triangle region respectively. Parasitic Examination revealed heavy infestations of the copepod parasite Caligus clemensi in the buccal cavity, gills, and skin. The genetic and phylogenetic analysis of the 18S rRNA and COI genes confirmed the identification. The results revealed the highest prevalence of sea lice in seabass during winter (75%) with a gradual decrease in subsequent seasons, while grey mullet exhibited similar trends, with the highest infestation rates observed in winter (70%) and spring (80%). The affected fish displayed diffuse skin lesions and ulcerations with excessive mucus production. Clinically, lethargy, slow surface swimming, hemorrhagic gills, detached scales, and ascites were also noted within species. Severe seabass specimens exhibited extensive cutaneous hemorrhage, deep ulcers, pale enlarged liver, and internal organ haemorrhage. The histopathology showed severe destruction of gill tissues along with hepatocellular degeneration and steatosis in the liver, providing initial insights into this outbreak. Upregulation of the inflammatory marker IL-1β in gill and skin tissues of infected seabass and grey mullets indicated a robust cell-mediated immune response against the pathogens. Secondary bacterial infections were identified as Vibrio parahaemolyticus and V. alginolyticus, which exhibited high rates of antibiotic resistance. Water quality analysis showed elevated levels of total suspended solids, total dissolved solids, total solids, sulfates, chlorides, and conductivity, exceeding recommended limits. A therapeutic regimen of prolonged baths with the disinfectant Virocid® followed by probiotic treatment with Sanolife Pro-W® effectively cleared the parasite infections and controlled the secondary bacterial infections in keeled mullets and thin-lipped grey mullets. An integrated approach comprising prolonged hydrogen peroxide immersion baths, followed by the application of the nature-identical plant-based compound Lice-less® and probiotic Sanolife Pro-W® supplementation was implemented, effectively eliminating the C. clemensi infestations and controlling the bacterial co-infections in seabass and grey mullets. The study highlights the detrimental impacts of Caligid infestations and antibiotic-resistant Vibrio infections on farmed marine fish, while demonstrating the benefits of integrated management strategies to address these challenges and support sustainable aquaculture.

يُعدّ كلًا من مثلث الديبة وسواحل قناة السويس من أهم المناطق بالنسبة لمزارع الأسماك البحرية في مصر. تناولت هذه الدراسة العدوي الطفيلية والبكتيرية المشتركة التي تُعدّ السبب الرئيسي في الإصابة والنفوق بين الأسماك البحرية المُرباة في مصر، والتي تشمل اسماك القاروص والبوري الحر والبوري رقيقة الشفة واسماك السهلية والتي يتم تربيتها في مزارع خاصة تقع على ساحل قناة السويس ومنطقة مثلث الديبة. كشف الفحص عن إصابة شديدة بقملة البحر (الكيليسيدات) من نوع "كاليجوس كليمنسي" في تجويف الفم والخياشيم والجلد للأسماك المصابة. وأُجري تحليل جيني وتطوري لتسلسل جيني rRNA 18S و COI لتأكيد تشخيص الإصابة. وأظهرت النتائج أعلى معدل انتشار لقمل البحر في القاروص خلال فصل الشتاء (75٪) مع انخفاض تدريجي في المواسم اللاحقة. وأظهر البوري الحر اتجاهات مماثلة، حيث لوحظت أعلى معدلات الإصابة في الشتاء (70٪) والربيع (80٪).
أظهرت الأسماك المصابة تقرحات جلدية منتشرة مع إفراز مخاطي زائد. كما لوحظ الخمول والسباحة البطيئة بالقرب من السطح، والتهاب الخياشيم النزفي، وتساقط القشور، والاستسقاء البطني (تراكم السوائل في التجويف البطني) لدى جميع أنواع الأسماك. أما عينات القاروص المصابة بشدة، فقد أظهرت نزيفًا جلديًا واسعًا وقرحًا عميقة وكبدًا شاحبًا ومتضخمًا ونزيفًا داخليًا في الأعضاء. كشف الفحص النسيجي عن تدمير شديد لأنسجة الخياشيم إلى جانب التنكس الدهني وتدهور الخلايا الكبدية في الكبد، مما يوفر رؤى أولية حول هذا التفشي. أشار ارتفاع مستوى الالتهاب IL-1β في أنسجة الخياشيم والجلد من القاروص والبوري الحر المصابة إلى استجابة مناعية خلوية قوية ضد مسببات الأمراض.
تم تحديد العدوى البكتيري الثانوي على أنه بكتيريا "فيبريو باراهيموليتيكوس" (Vibrio parahaemolyticus) و "فيبريو ألجينوليتيكوس" (Vibrio alginolyticus)، والتي أظهرت معدلات عالية من مقاومة المضادات الحيوية. أظهر تحليل جودة المياه ارتفاعًا في مستويات المواد الصلبة العالقة الكلية، والمواد الصلبة المذابة الكلية، والمواد الصلبة الكلية، والكبريتات، والكلوريدات، والموصلية، وهو ما يتجاوز الحدود الموصى بها.
أدي نظام علاجي بالاستحمام المطول باستخدام مطهر Virocid® يليها المعالجة بالبروبيوتيك Sanolife Pro-W® الي القضاء على إصابات الطفيليات والسيطرة على الالتهابات البكتيرية الثانوية في البوري رقيقة الشفة واسماك السهلية. تم تنفيذ نهج متكامل يشمل حمامات غمر طويلة بماء الاوكسجين، يليها تطبيق النباتي الطبيعي المطابق للطبيعة Lice-less® واستكمال البروبيوتيك Sanolife Pro-W® ، مما أدى إلى القضاء الفعال على إصابة "كاليجوس كليمنسي" والسيطرة على الالتهابات البكتيرية المصاحبة في القاروص والبوري الحر.
تسلط الدراسة الضوء على الآثار الضارة لإصابات قمل البحر والعدوى البكتيري البكتيريا "فيبريو" المقاومة للمضادات الحيوية على الأسماك البحرية التي يتم تربيتها في الأحواض، مع إثبات فوائد استراتيجيات الإدارة المتكاملة لمواجهة هذه التحديات ودعم تربية الأحياء المائية المستدامة.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.