Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2025.

Bibliography: pages 80-107.

MicroRNAs (miRNAs) are evolutionarily conserved RNAs that play a crucial
role in the apoptotic process in insects. In this study, the transcriptional regulation of
eight apoptotic-related genes (Fas1, Fas2, Caspase-8, Caspase-5, COX1, Apaf1,
Dronc, and Effector Caspase-1) in Spodoptera littoralis was analyzed. Using in silico
prediction tools, 43 novel miRNAs were predicted to be encoded by Spodoptera
littoralis nucleopolyhedrovirus (SpliMNPV). Of these, seven putative SpliMNPV
miRNAs targeting the detected apoptotic genes were validated by quantitative real-
time PCR (qPCR) after S. littoralis infection with SpliMNPV at different time points:
24, 48, and 72 hours post-infection (hpi). Four miRNAs (miR1402, miR94, miR638,
and miR749) were found to be unique to SpliMNPV. Gene expression analysis
revealed that most of the S. littoralis apoptotic target genes were downregulated by
viral miRNAs during SpliMNPV infection. The Dronc gene exhibited the highest
level of downregulation at 72 hpi. In contrast, COX1 gene expression was upregulated
at 48 and 72 hpi, respectively. Additionally, Apaf1 gene expression showed a positive
correlation with most apoptotic target genes, whereas COX1 expression exhibited a
negative correlation with Dronc, Effector Caspase-1, Fas1, and Fas2 gene
expression. These findings suggest that the identified SpliMNPV miRNAs
significantly influence the transcriptional regulation of S. littoralis apoptotic-related
genes in response to viral infection.

الـ miRNA هي RNAs محفوظة تطوريًا وقد تلعب دورا مهما في عملية الموت الخلوي في الحشرات. في هذه الدراسة، تم تحليل التنظيم النسخي لثمانية جينات مرتبطة بالموت الخلوي (Fas1, Fas2, Caspase-8, Caspase-5, COX1, Apaf1, Dronc، وEffector Caspase-1) والـ miRNA المرتبطة بها في دودة القطن. باستخدام طرق التنبؤ الحاسوبي، تم تحديد 43 miRNA جديدة مشفرة من دودة القطن عند الإصابة بفيروس Spodopteralittoralismultiplenucleopolyhedrovirus (SpliMNPV). من بين هذه الـ 43miRNA، تم تأكيد اثني عشرmiRNAمرتبط بالموت الخلوي والمحتمل بفيروس SpliMNPVبواسطة تقنية PCR الكمي في الوقت الحقيقي (q-PCR) باستخدام فترات زمنية مختلفة للإصابة الفيروسية عند 24 و48 و72 ساعة بعد الإصابة (hpi). وقد تبين أن سبعة من هذه الـ miRNA تستهدف الجينات الثمانية المرتبطة بالموت الخلوي في دودة القطن عند الإصابة الفيروسية. وأظهرت أربعة miRNA (miR1402, miR94,miR638 وmiR749) أنها فريدة من نوعها لفيروس.SpliMNPV أظهر تحليل التعبير الجيني انخفاضًا في التعبير لمعظم الجينات المستهدفة المرتبطة بالموت الخلوي عند الإصابة بـ SpliMNPVعبرmiRNAالفيروسية. وقد أظهر جين Droncأنه الأكثر انخفاضًا في التعبير عند 72hpi. ومع ذلك، أظهر تعبير جين COX1أنه الأكثر زيادة في التعبير عند 48 و72hpiعلى التوالي. علاوة على ذلك، أظهر تعبير جين Apaf1ارتباطًا إيجابيًا مع معظم الجينات المستهدفة المرتبطة بالموت الخلوي. ومع ذلك، أظهر تعبير جين COX1ارتباطًا سلبيًا مع تعبير الجيناتDronc, EffectorCaspase-1, Fas1 و .Fas2كشفت النتائج أن الـmiRNAالمكتشفة من SpliMNPVتؤثر بشكل كبير على تنظيم النسخ لجينات الموت الخلوي في دودة القطن كرد فعل على الإصابة بـ SpliMNPV. على حد علمنا، هذه هي الدراسة الأولى التي أجريت للكشف عن تأثيرmiRNAلـ SpliMNPVعلى مسار الموت الخلوي في دودة القطن عند الإصابة الفيروسية.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.