Challenges of using proteomics mass spectrometry for bladder cancer prognostic biomarkers /
استخدام البروتيوميات و قياس الكتلة الطيفي كتحديات للتشخيص الحيوي لسرطان المثانة
by Margrit Saad Nessim Gendi ; Supervisors Prof.Dr. Ahmed Elsherif, Dr.Heba Mohamed Kamal, Dr. Ola Sayeed Ahmed.
- 91 pages : illustrations ; 25 cm. + CD.
Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2024.
Bibliography: pages 70-90.
Aim To discover biomarkers for bladder cancer in specimens of blood and tissue. Using proteomics platforms, such as high throughput mass spectrometry. Several proteins in the tissue and plasma were assessed using bioinformatics analysis of the data. Subject our study consisted of 40 specimens divided into three groups: BCT (15 fresh-frozen tissue samples), BCP (15 plasma samples from bladder cancer patients), and CTRL (10 plasma samples from healthy individuals). Results: Six candidate biomarkers were detected in BC patients: gelsolin, haptoglobin, SERPINA1, A2M, and delta and beta globulin proteins in both tissue and plasma specimens. Conclusion: In plasma cancer Egyptian patients: A2M and SERPINA1 can be used as a potential biomarkers for bladder cancer. While GSN and HP biomarkers harbored for tissue bladder cancer samples. الهدف اكتشاف المؤشرات الحيوية لسرطان المثانة في عينات الدم والأنسجة. استخدام منصات البروتينات، مثل قياس الطيف الكتلي عالي الإنتاجية. تم تقييم العديد من البروتينات في الأنسجة والبلازما باستخدام تحليل المعلوماتية الحيوية للبيانات. يتكون موضوع دراستنا من 40 عينة مقسمة إلى ثلاث مجموعات:ادوات ، BCP ، (15 عينة بلازما من مرضى سرطان المثانة)BCT (15 عينة أنسجة مجمدة طازجة) CTRL (10 عينات بلازما من أفراد أصحاء)و النتائج: تم الكشف عن ستة مؤشرات حيوية مرشحة في مرضى كولومبيا البريطانية: جلسولين، هابتوغلوبين، SERPINA1، A2M، وبروتينات دلتا وبيتا الجلوبيولين في عينات الأنسجة والبلازما الاستنتاج:في مرضى سرطان المثانه في البلازما للمصريين: يمكن استخدام كمؤشرات حيوية محتملة لسرطان المثانه .A2Mو SERPINA1 كانت المؤشرات الحيوية لعينات سرطان المثانة في الأنسجة.HP و GSNبينما
Text in English and abstract in Arabic & English.
Bladder Cancer سرطان المثانة
Proteomic biomarker bladder cancer bioinformatics analysis mass spectrometry tissue plasma سرطان المثانة العلامات الحيوية البروتينية