Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2025.

Bibliography: pages 125-149.

Background: Pulmonary fungal infection has high morbidity and mortality in Intensive Care Unit (ICU). There is inadequacy of investigations regarding clinical, laboratory, risk factors and prognostic data on pulmonary fungal infection in respiratory ICU.
Aim and objectives: The aim of this study was to determine incidence and risk factors of pulmonary fungal infection and colonization among critically ill patients admitted to respiratory ICU.
Subjects and methods: A cross-sectional analysis of 170 critically ill patients in a respiratory ICU was conducted. All patients underwent clinical and radiological assessments, plus mycological analysis of respiratory samples (sputum and endotracheal aspirate (ETA)) for fungal culture. Species identification used conventional methods and the VITEK 2 system. Data on demographics, comorbidities, clinical parameters, medications, and outcomes were collected and analyzed.
Result: The incidence of pulmonary fungal colonization was high (64.1%, n=109), while fungal infection (aspergilloma) was less common (3.5%, n=6). Candida non-albicans was the predominant isolate (41.2%), followed by Candida albicans (26.5%). Significant risk factors for fungal colonization included diabetes mellitus (p=0.007), history of ICU admission (p=0.000), recent antibiotic (p=0.000) and corticosteroid use (p=0.013), higher APACHE II scores (p=0.000), and central venous catheterization (p=0.044). Colonized patients had significantly longer durations of broad-spectrum antibiotic (p=0.049) and systemic corticosteroid therapy (p=0.020), longer ICU stays (p=0.048), and higher rates of sepsis (p=0.028) and candiduria (p=0.022). However, survival analysis showed no significant difference in mortality between colonized and non-colonized groups or between different Candida species.
Conclusion: This study highlights a high incidence of pulmonary fungal colonization, predominantly with Candida non-albicans, in a respiratory ICU population. Key modifiable risk factors include diabetes, ICU admission history, and exposure to antibiotics and corticosteroids. These findings underscore the necessity for vigilant surveillance, rational antimicrobial stewardship, and early, species-directed antifungal therapy in high-risk critically ill patients to improve outcomes.

شهدت العدوى الفطرية ارتفاعًا ملحوظًا في بيئة الرعاية الحرجة. وعلى الرغم من أن هذه العدوى أقل شيوعًا من العدوى البكتيرية، إلا أن معدل الوفيات المرتبط بها أعلى، ويُعزى هذا الاتجاه جزئيًا إلى الزيادة في عدد المرضى المثبطين مناعيًا الذين يتم إدخالهم إلى وحدات العناية المركزة.
يُعد الفشل التنفسي الحاد السبب الرئيسي لدخول المرضى المثبطين مناعيًا إلى وحدات العناية المركزة، وتُعزى الغالبية العظمى من هذه الحالات إلى العدوى التنفسية. ففي دراسة متعددة المراكز شملت 1611 مريضًا مثبطًا مناعيًا أُدخلوا العناية المركزة بسبب الفشل التنفسي الحاد ، تبيّن أن العدوى الفطرية كانت السبب في 261 حالة (14%).
تُعد أمراض الرئة الفطرية طيفًا واسعًا من الكائنات الحية والحالات السريرية المرتبطة بها، وتمثل تحديًا صحيًا عالميًا كبيرًا. ويُحدد نوع وشدة المرض حسب مناعة العائل والسلالة الفطرية المسببة.
تشمل أهم مسببات الأمراض الفطرية الرئوية:
Aspergillus وهي الرشاشية، و Candida وهي المبيضّة، و Cryptococcus وهي المستخفيات، و Pneumocystis هي المكار وهي قادرة على التسبب في أمراض غازية تهدد الحياة، وتمثل تحديات في التشخيص والعلاج نظرًا لتنوع مظاهرها السريرية وتشابهها مع حالات الاستعمار غير المرضي.
في أوساط المرضى المنومين، تصل معدلات عزل الـكانديدا (الفطريات المبيضة) عبر الفحوصات الاستقصائية النشطة إلى نحو 15%، بينما ترتفع هذه النسبة في مرضى الحالات الحرجة لتصل إلى 25%. وعلى الرغم من أن الاستعمار الميكروبي يلعب دورًا مهمًا في العدوى الثانوية، إلا أن ذات الرئة الناتجة عن الكانديدا نادرًا ما يتم توثيقها حتى في وحدة العناية المركزة.
كما يمكن لأنواع الفطريات الرشاشية أن تستعمر وتغزو رئات المرضى في العناية المركزة من غير المصابين بندرة الخلايا الدموية البيضاء المتعادلة. وتشير البيانات إلى أن الفطريات الخيطية تمثل نحو 1.4% من عدوى وحدة العناية المركزة، إلا أن داء الرشاشيات الغازي قد يكون غير مكتشف بدرجة كبيرة، حيث تصل معدلات الاكتشاف بعد الوفاة إلى 2.8%. وتشمل عوامل الخطورة: مرض الانسداد الرئوي المزمن ، العلاج بالكورتيكوستيرويدات، التليف الكبدي، والالتهاب الرئوي الفيروسي الشديد (مثل الإنفلونزا و كوفيد-19).

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.