Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2024.

Bibliography: pages 71-91.

Novel reliable biomarkers of inflammatory bowel disease (IBD) are clinically imperative due to potential limitations of endoscopic techniques. MicroRNAs (miRNAs) have emerged as non-invasive biomarkers of IBD; however, the full disease-specific miRNAs signature for IBD subtypes remains elusive. The presented study evaluated the diagnostic role of circulating miR-486 and miR-25 in IBD patients and their potential ability to discriminate IBD subtypes; Ulcerative Colitis (UC) and Crohn’s disease (CD). Sixty UC patients, 60 CD patients, and 60 healthy controls were recruited. Serum miRNA expression was determined using RT-qPCR. Bioinformatics was employed for target gene and protein-protein interaction network analysis. Serum miR-486 was upregulated in CD patients but didn’t change in UC patients compared to controls. Conversely, serum miR-25 was decreased in both CD and UC patients compared to controls. Only miR-486 was differentially expressed between UC and CD patients. ROC analysis revealed that serum miR-486 was superior in CD diagnosis (AUC=0.945) and significantly distinguished CD and UC patients, whereas miR-25 showed discriminative potential for both UC and CD from controls. In the multivariate logistic analysis only miR-486 was associated with the risk of CD diagnosis. Serum miR-486 was correlated with CD activity index and location of disease in CD patients, whereas miR-25 was correlated with the type/extent of UC. Protein-protein interaction (PPI) network analysis revealed common target genes and signaling pathways for both miRNAs. Conclusively, serum miR-486 and miR-25 might serve as new biomarkers of IBD, with serum miR-486 could be employed in risk stratification of IBD subtypes and has the ground for clinical utility in CD diagnosis, whereas miR-25 has potential for UC and CD diagnosis.

تعد المؤشرات الحيوية الجديدة الموثوقة لمرض الأمعاء الالتهابي (IBD) ضرورة إكليتيكية وذلك بسبب القيود المحتملة لتقنيات التنظير الداخلي. وقد ظهرت الاحماض النوويه الريبوزيه متناهيه الصغر (miRNAs)ا كدلالات حيوية غير غازية لإلتهاب القولون ؛ ومع ذلك، فإن التعبير الكامل للاحماض النوويه الريبوزيه متناهيه الصغر الخاصة بالأنواع الفرعية من إلتهاب الأمعاء لا يزال غير معروف. وفي هذه الدراسة تم تقييم الدور التشخيصي لكل من miR-486 و miR-25 في مرضى إلتهاب الأمعاء وقدرتهم المحتملة على التمييز بين الأنواع الفرعية مثل ؛ إاتهاب القولون التقرحي ومرض كرون (CD).حيث تم تضمين ستين مريضا من مرض إلتهاب القولون التقرحي ، و60 مريضا من مرض الكرون، و60 من الأشخاص الاصحاء كمجموعة ضابطة. تم تحديد تعبير miRNAs في الدم باستخدام RT-qPCR., وتم تحليل شبكة التفاعل بين الجينات والبروتين المستهدف بأستخدام المعلوماتية الحيوية. وقد وجد زيادة في تعبير miR-486 في مصل الدم لدى مرضى كرون ولكنه لم يتغير لدى مرضى التهاب القولون التقرحي مقارنةً بالمجموعة الضابطة. على العكس من ذلك، انخفض تعبير miR-25 في مصل الدم في كل من مرضى الكرون والتهاب القولون التقرحي و مقارنة بالمجموعة الضابطة . تم التعبير عن miR-486 فقط بشكل تفاضلي بين مرضى الكرون والتهاب القولون التقرحي . وكشف التحليل الإحصائي أن مستوي miR-486 في المصل كان متفوقًا في تشخيص مرض كرون (AUC = 0.945) وميز بشكل كبيربين مرضى كرون و التهاب القولون التقرحي وبإستخدام التحليل اللوجستي متعدد المتغيرات ، ارتبط miR-486 فقط بخطر تشخيص مرض كرون . وقد ارتبط مستوي miR-486 بمؤشر نشاط كرون وموقع المرض في مرضى كرون ، بينما ارتبط miR-25 بنوع و مدى الاتهاب القولون التقرحي . كشف تحليل شبكة تفاعل البروتينات عن الجينات المستهدفة المشتركة ومسارات الإشارات لكل من miRNAs. و قد تم استنتاج انه بشكل قاطع ، قد يكون miR-486 و miR-25 بمثابة مؤشرات حيوية جديدة لمرض التهاب الأمعاء ، مع إمكانية استخدام miR-486 في التقسيم الطبقي للمخاطر للأنواع الفرعية لمرض التهاب الأمعاء ولديه الامكانات الأكلينيكية في تشخيص مرض كرون بينما miR-25 كلا من كرون والتهاب القولون التقرحي.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.