Thesis (M.Sc)-Cairo University, 2025.

Bibliography: pages 80-91.

Sustainable animal agriculture necessitates the development of efficient approaches for evaluating livestock. Goats, are known for their remarkable ability to thrive and adapt to harsh environments, making them a key species in global meat production systems in developing countries. Traditional carcass evaluation techniques rely on animal slaughter, which is not only costly but also wasteful of valuable genetic resources from superior animals. The current thesis includes two studies to evaluate growth and carcass cuts in goats using two different methods. The first study used linear body measurements and real-time ultrasound as non-invasive techniques. Thirteen male Damascus kids aged 12 months were included in the study, rib-eye muscle measurements (including depth, area, and width) were taken using real-time ultrasound (7.5 MHz) between the 12th and 13th thoracic vertebrae on the left side. Furthermore, the association of linear body measurements, the presence of horns, and birth type (single or twin) with carcass characteristics were studied. The result showed, birth type has no significant effect on carcass characteristics. Body length, heart girth and chest width were shown to be highly linked with carcass cuts. Horned kids recorded significantly better performance than hornless in almost all traits. Ultrasound measurements of rib-eye muscle in live kids accurately predicted the weights of various carcass components, including hot carcass, leg, flank, and neck. The prediction equations for muscle width, depth, and area showed significant accuracy with ultrasound depth and area contributing 51% and 61% to the total variation in real muscle depth and area, respectively. The second study aimed to detect single nucleotide polymorphisms in growth hormone gene in Damascus and Black Bengal male goats, which could be used as tool for animal evaluation and selection. The whole growth hormone gene of twenty two kids were amplified by nested PCR technique and performed paired-end sequencing. The results unveiled 25 SNPs with different frequencies within the two breeds. Eighteen SNPs were identified in non-coding regions, while seven were detected in coding regions. From the seven SNPs, four were identified as synonymous variants (719 C→T, 731 G→A, 1610 C→T and 1625 C→T) and three as non-synonymous variants (1112 G→A, 1459 C→T and 1470 C→T) which led to amino acid substitutions. The SNP 1112 G→A caused substitution of Glutamic acid with Lysine (E/K) at amino acid position 137 with prediction to affect protein structure and function negatively. Otherwise, SNPs 914 G→A and 1112 G→A were positively and significantly associated with pre-slaughter weight and carcass cuts in Damascus goats. Suggesting their potential to serve as genetic markers in breeding programs aimed at enhancing meat production.

تتطلب نُهج الزراعة الحيوانية المستدامة تطوير أساليب فعّالة لتقييم الماشية. يُعَدّ الماعز معروف بقدرته على التكيف مع البيئات القاسية، وذو أهمية في أنظمة إنتاج اللحوم عالميًا. تعتمد التقنيات التقليدية لتقييم الذبائح على ذبح الحيوانات، وهو أمر مكلف ويهدر الموارد الوراثية القيمة للحيوانات المتفوقة. تضمنت هذه الدراسة تجربتين لتقييم قطعيات الذبائح. استخدمت الدراسة الأولى تقنيات مثل القياسات الخطية للجسم والموجات فوق الصوتية. أُجريت القياسات للعضلة العينة (و التى تشمل العمق والمساحة والعرض) باستخدام الموجات فوق الصوتية (7.5 ميجاهرتز) بين الفقرات الصدرية الثانية عشرة والثالثة عشرة على الجانب الأيسر لثلاثة عشر من ذكور الماعز الدمشقي بعمر 12 شهرًا. إضافةً إلى ذلك، تم دراسة العلاقة بين القياسات الخطية للجسم و وجود القرون ونوع الولادة (فردية أو توأمية) مع خصائص الذبيحة. أظهرت النتائج أن نوع الولادة لم يكن له تأثير معنوي على خصائص الذبيحة، بينما ارتبط طول الجسم ومحيط الصدر وعرض الصدر بوضوح مع قطعيات الذبيحة. كانت الذكور ذات القرون أعلى معنوياً من الذكور عديمة القرون في معظم صفات الذبيحة. كما أن قياسات الموجات فوق الصوتية للعضلة العينية في الحيوانات الحية توقعت بدقة أوزان مكونات الذبيحة المختلفة، و المشتملة على وزن الذبيحة والساق والخاصرة والعنق. وأظهرت معادلات التنبؤ لعرض العضلة وعمقها ومساحتها دقة كبيرة، حيث ساهم كل من عمق العضلة ومساحتها بنسبة 51% و61% في التباين الكلي في العمق والمساحة الحقيقية للعضلة على التوالي.
أما في الدراسة الثانية، فقد تم الكشف عن تعدد أشكال النوكليوتيدات الأحادي في جين هرمون النمو في ذكور الماعز الدمشقي وماعز البلاك بينجال. تم إنتاج نسخ عالية الجودة من جين هرمون النمو لاثنين وعشرون من صغار الماعز باستخدام تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعاقب (Nested PCR) وإجراء تسلسل مزدوج الاتجاه. وكشفت النتائج عن وجود 25 SNPs بنسب تكرارت مختلفة بين السلالتين، حيث تم تحديد 18 تعددًا في المناطق غير المشفرة، بينما تم تحديد سبعة في المناطق المشفرة. تضمنت هذه الأخيرة أربعة متغيرات مترادفة 719 C→T و 731 G→Aو 1610 C→T و1625 C→T وثلاثة متغيرات غير مترادفة 1112 G→Aو 1459 C→Tو 1470 C→T أدت المتغيرات غير المترادفة إلى استبدال الأحماض الأمينية، وكان SNP رقم 1112 G→A، الذي استبدل حمض الجلوتاميك باللايسين (E/K) عند الموضع 137 في الأحماض الأمينية، متوقعًا أن يؤثر سلبًا على بنية البروتين ووظيفته. وقد وجد أن SNPs 914 G→A و1112 G→A ارتبطت بشكل معنوياً وموجباً مع الوزن قبل الذبح وقطعيات الذبيحة في الماعز الدمشقي، مما يشير إلى إمكانية استخدامها كعلامات وراثية في برامج التربية لتحسين إنتاج اللحوم.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.