Thesis (Ph.D.) - Cairo University - Faculty of Medicine - Department of Diagnostic and Interventional Radiology

Bibliography: p. 208-235.

the primary goal of this study is to evaluate the precision, time effectiveness and reproducibility of open source automated MRI brain volumetric measurement platforms as compared to the semi-automated methods. The secondary goal of the study is to create age-stratified database of MRI brain volumetric measures of healthy Egyptian adults. Patients and methods: in this single armed prospective study, 524 participant were recruited, 61 were excluded due to variable neurological and systemic complaints and 12 failed to complete MRI exam. 451 completed the MRI examination and the scanned images were subjected to qualitative revision by two independent radiologists and quantitative assessment of image quality and another 56 participants were excluded. A Final number of 395 high quality MRI scans were submitted to automated volumetric analysis by FSL-FAST, FreeSurfer and SPM-CAT12 then generated masks were manually reviewed for need of semi-automated modification. Several in-house codes were developed to auto-run the analysis process and extract the targeted numeric volumetric data. FSL-FAST were considered the most efficient program to run global volumetric analysis, unless, concurrent advanced volumetric analysis is needed or gray matter volume is the main objective of the volumetric analysis, then FreesSurfer is considered the most efficient volumetric software.

التطور الحالى فى مجال تشخيص وعلاج الامراض العصبية استوجب حدوث تطور موازي فى طرق ودلالات التشخيص بالاشعة بغرض الاكتشاف المبكر لهذه الامراض والتقييم الدقيق لاستجابتها للعلاج.
يعد التحليل الكمى للمخ احد اهم دلالات تشخيص ومتابعة الامراض العصبية.توجد العديد من البرامج التى يمكنها اجراء التحليل الكمى للمخ ولكن لا توجد دراسات كافية تقارن كفاءةهذه البرامج من حيث الوقت المطلوب لاجراء التحليل و نتائج كلا من هذه البرامج ومدى احتياجها للتعديل اليدوى علي نتائجها.
فى هذه الدراسة تمت مقارنة نتائج التحليل الكمى العام للمخ (الحجم الكلى للمادة الرمادية, المادة البيضاء, السائل الشوكى وحجم التجويف الداخلى للجمجمة من الداخل) فى 395 مصريا ومصرية اصحاء والذين تم اجراء فحوصات رنين عالية الجودة تم مراجعتها بواسطة اثنان من خبراء اشعة المخ و الاعصاب كما تم الاستيثاق من جودتها نوعيا باستخدام كات12 –اس. بى.ام. كما تم كتابة عدة اكواد برمجة لادارة عملية التحليل الحجمى للمخ فى هذا العدد الهائل من الحالات و استخراج النتائج من ثلاثة البرامج: الفري سيرفر, كات12 –اس. بى.ام و فاست-اف.اس.ال ثم تم حساب متوسطات هذه الارقام للمصريين الاصحاء لتكوين قاعدة بيانات مرجعية -الاولى من نوعها- للمصريين الاصحاء.

Issued also as CD

Text in English and abstract in Arabic & English.