000			09642namaa22004331i 4500
003			OSt
005			20250223033227.0
008			240304s2022 |||a|||f |m|| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _dara
049			_aDeposit
082	0	4	_a616.014
092			_a616.014 _221
097			_aM.Sc
099			_aCai01.12.05.Ma.S.2022.Ma.S
100	0		_aMariam Abdel-Rahman Zahran Mohammad, _epreparation.
245	1	0	_aStudy of Some Fungal Extracts Activity Against Multi-Drug Resistant Gram Negative Bacteria / _cby Mariam Abdel-Rahman Zahran Mohammad; Under supervision of Prof. Mohamed Hani Moubasher, Dr. Sherif Elnagdy,Prof. Amani El Kholy.
246	1	5	_aدراسه النشاط المضاد للبكتيريا السالبه لصبغه جرام المقاومه للادويه المتعدده باستخدام بعض المستخلصات الفطريه
264		0	_c2022.
300			_a45 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (M.Sc.)-Cairo University, 2022.
504			_aBibliography: pages 34-45.
520			_aThe aim of this study is to search for compounds with antibacterial effect against Multi-drug resistant Gram negative bacteria. It was proven by several studies that the interactions between bacteria and fungi can potentially induce the secretion of secondary metabolites, the bacterial fungal interaction was utilized in vitro using co-culturing through the following steps: • Isolation of carbapenem resistant Klebsiella pneumoniae from ICU patients with confirmed blood stream infection. • Isolation of different fungal species from multiple localities Ex: soil, hospital environment. • Co-culturing of K. pneumoniae with the fungi at different temperatures (26℃ & 37℃) then selecting the fungal species that showed most inhibition of bacterial growth. • Sub-culturing K. pneumoniae from the less dense zone after co-culture with fungi at 37℃. • Phenotypic comparison was performed using antibiotic susceptibility testing of K. pneumoniae by disc diffusion method and the results showed that 2 K. pneumoniae isolates with sequence type ST101 tested sensitive to carbapenem antibiotic while the other 3 isolates remained carbapenem resistant. • Next generation sequencing was done to compare resistance genes and virulence genes of K. pneumoniae before and after co-culture. • The results of NGS showed loss of resistance genes blaOXA-48 and blaCTX-M-14b were lost from 2 K. pneumoniae isolates with sequence type ST101, while the other 3 K. pneumoniae isolates with sequence type ST383, ST147 didn’t show any change in resistance genes. • One K. pneumoniae isolate ST383 showed loss in virulence genes fyuA gene and ybtA, ybtE, ybtP, ybtQ, ybtS, ybtT, ybtU, ybtX set of genes that code for different constituents of the bacterial siderophore systems. • The fungi Scopulariopsis brevicaulis that showed maximum inhibition of the bacterial growth in co-culture was grown on liquid media (peptone sucrose broth) for 3 days then bacterial inoculum of K. pneumoniae MDR 100 μl 0.5 Mcfarland standard was added and incubated for additional 10 days. • After incubation the media was filtered and centrifuged then the filtrate was partitioned using solvents with different polarities, chloroform and ethyl acetate. • Concentration of co-culture extract of each solvent using rotary evaporator and the extracts were tested against K. pneumoniae using disc diffusi • The total extract was tested against K. pneumoniae using disc diffusion method and the ethyl acetate extract showed inhibition of the bacterial growth. • Chromatographic techniques were performed for ethyl acetate extract to separate compounds that showed antibacterial effect. • 7 fractions were collected from liquid chromatography and they were tested against K. pneumoniae using well diffusion method. • GC-MS was performed for structure elucidation and characterization for the fraction that showed inhibition of K. pneumoniae growth. • The purified compounds were identified as 11-Octadecenoic acid, 2,4-Di-tert- butylphenol, 2,3-Butanediol and 9-Octadecenamide.
520			_aالهدف من هذه الدراسة هو البحث عن مركب له خصائص مضادة للبكتيريا السالبة لصبغة جرام المقاومة للمضادات الحيوية المتعددة. ثبت من خلال العديد من الدراسات أن التفاعلات بين البكتيريا والفطريات يمكن أن تحفز إفراز مركبات لم تكن لتفرزفي حالة نمو الفطر في الظروف العادية، وقد تم تحقيق التفاعل الفطري البكتيري في المختبر باستخدام الزراعة المشتركة و تمت الدراسة من خلال الخطوات التالية:  عزل الكلبسيلة الرئوية المقاومة للكاربابينيمات من مرضى وحدة العناية المركزة المصابين بعدوي مجري الدم.  عزل أنواع فطريات مختلفة من مواقع متعددة مثل التربة وبيئة المستشفى .  الاستزراع المشترك للفطريات التي تم عزلها مع الكلبسيلة الرئوية عند درجات حرارة مختلفة ) 26 ℃ و 37 )℃ ثم اختيار الأنواع الفطرية التي أظهرت أكثر تثبيط لنمو البكتيريا .  عزل الكلبسيلة الرئوية بعد فترة الحضانة مع الفطريات  تم إجراء مقارنة النمط الظاهري للكلبسيلة الرئوية قبل و بعد الالتفاعل الفطري باستخدام اختبار الحساسية للمضادات الحيوية و تبين ان اثنين من عزلات البكتيريا حدث لهم تغير في مقاوتهم للمضادات الحيوية حيث اصبحوا حساسين لكربامينيمات بعد ان كانوا مقاومين لهم, بينما الثلاث عزلات البكتيريت الأخري لم يشهدوا نفس التغيير.  عمل تسلسل الجيل التالي لمقارنة جينات المقاومة للمضادات الحيوية وجينات عوامل الضراوة للكلبسيلة الرئوية الرئوية قبل وبعد التفاعل الفطري و تبين ان اثنين من عزلات البكتيريا ST101 خسروا blaOXA-48 و blaCTX-M-14b و الثلاث عزلات الأخري ST383, ST147 لم يخسروا جينات مسؤولة عن المقاومة للمضادات الحيوية.  تم ملاحظة ان عزلة البكتيريا الكلبسيلة الرئوية ST147 خسرت مجموعة من الجينات fyuA و ybtA, ybtE, ybtP, ybtQ, ybtS, ybtT, ybtU, ybtX مسؤولة عن مجموعة مختلفة من انظمة السيدرفور البكتيري.  تحضير مستخلص التفاعل بين البكتيريا و الفطريات لعزل المركب المضاد للبكتيريا الكلبسيلة الرئوية عن طريق زراعة الفطر الذي حقق اكبر نسبة تثبيط للنمو البكتيري و هو فطر Scopulariopsis brevicaulis الفطريات لمدة 3 أيام ثم تمت إضافة اللقاح البكتيري بتركيز 0.5 مكفرلند و استكمال فترة الحضانة لمدة 10 ايام اخري.  بعد فترة الحضانة يتم ترشيح الميديا بإستخدام ورق ترشيح ثم يضاف المذيب العضوي و الغير عضوي الي المرشح اولا يضاف الكلوروفورم و يرج جيدا في قمع الفصل ثم يتم تجميع الكلوروفورم و تتم اعادة نفس العملية بإستخدام الاثيل اسيتات.  تم اختبار تركيز المستخلص الفطري في كل مذيب باستخدام مبخر دوار وتم اختبار المستخلص ضد الكلبسيلة الرئوية لمعرفة ايهم له خصائص مضادة للبكتيريا  ثم يتم عمل فصل للمركب و تنقيته باستخدام الكروماتوجرافيا. الملخص العربي 45  تم فصل المستخلص الي 7 اجزاء عن طريق استشراب العمود و تم اختبار السبع اجزاء ضد الكلبسياة الرئوية لتحديد الجزء صاحب الخصائص المضادة للبكتيريا.  تم عمل GCMS للجزء صاحب التأثير المضاد للبكتيريا لتحديد المركب او مجموعة المركبات المسؤولة عن هذة الخصائص و تبين ان هذه المركبات هي 11-Octadecenoic acid, 2,4-Di-tert-butylphenol, 2,3-Butanediol and 9-Octadecenamide
530			_aIssued also as CD
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		0	_amicrobiology
653		0	_avirulence factors _aco-culture _amutation _agene deletion _abacterial–fungal interaction
700	0		_aMohamed Hani Moubasher _ethesis advisor.
700	0		_aSherif Elnagdy _ethesis advisor.
700	0		_aAmani El Kholy _ethesis advisor.
900			_b01-01-2023 _cMohamed Hani Moubasher _cSherif Elnagdy _cAmani El Kholy _dMariam Abdelrahman Zahran Mohammad _UCairo University _FFaculty of Science _DDepartment of Microbiology,
905			_aHuda
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c166382