000			11952namaa22004331i 4500
003			OSt
005			20250223033316.0
008			241022s2023 |||a|||f m||| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _bara
049			_aDeposite
082	0	4	_a571.999
092			_a571.999 _221
097			_aPh.D
099			_aCai01.10.19.Ph.D.2023.Na.R
100	0		_aNada Mahmoud Mohamed Ali El-Kabany, _epreparation.
245	1	0	_aRole of fish parasites in the persistence of other fish pathogens in water in egypt / _cby Nada Mahmoud Mohamed Ali El-Kabany ; Supervision of Prof. Dr. Mohga Fouad Mahmoud Badawy, Dr.Tamer Fawzy Ismail , Samah El said El sayed Laban.
246	1	5	_a/ دور طفيليات الأسماك في استمرارية تواجد الميكروبات السمكية الأخرى في المياه في مصر
264		0	_c2023.
300			_a124 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2023.
504			_aBibliography: pages 101-124.
520			_aIn recent years, fish mortality rates have increased suddenly due to mixed and multiple infections. The following study was designed to examine the co-infections between bacteria and parasites in some fish species from different aquatic environments in Egypt and the probability that parasites can transmit bacteria. The study shedded the light on the interaction of these pathogens and the stress induced by climatic change and deteriorating water quality parameters. The work was carried out first by conducting a survey of concurrent natural parasite-bacteria infections in fish was conducted in 2019 on 379 moribund and recently dead fresh- and marine water fishes of various body weights, collected seasonally from the River Nile at Giza, from Deeba triangle, Manzla lake and from Qaroun Lake in the Fayoum province. Fish were examined for parasites and bacteria and identified to the genus level. Clinostomum and/or Euclinostomum spp. as well as Pseudomonas were found in freshwater fish while Isopod, and Vibrio, Pseudomonas and Aeromonas were isolated in marine water fish. The prevalences of overall infestation and concurrent infections were recorded and discussed in relation to seasonality. Investigation of the phenotypic and genotypic characterization of Vibrio alginolyticus recovered from freshly dead or moribund fish and isopod was carried out to implicate isopod in the transmission of V. alginolyticus. Biochemical, antibiogram, species-specific PCR and phylogenetic analysis of 16S rRNA gene were done. In addition, physicochemical analysis of water and identification of isopod were performed. Results revealed deteriorated water quality, identical antimicrobial susceptibility profiles of V. alginolyticus strains from fish, isopods, and water. They were susceptible to erythromycin, imipenem, and trimethoprim/sulphamethoxazole, but resistant to ampicillin, lincomycin, colistin, and penicillin. In the species-specific PCR using the collagenase gene, all tested isolates showed the characteristic V. alginolyticus amplicon of 737 bp. The phylogenetic analysis of partial 16S rRNA gene sequence revealed that V. alginolyticus strains from fish and isopod showed 100% similarity with each other and 99.23% similarity with water strain, suggesting that the isopod was the likely source of infections. A similar study was attempted to investigate the correlation between Clinostomum infestation and transmission of Ps. Putida in Oreochromis niloticus and Tilapia zilli fish in River Nile at Bahr El-azam, Giza. Isolates from freshly dead or moribund fish, metacercarias and water samples were retrieved during spring and summer seasons. Isolates were subjected to bacteriological examination, biochemical tests, antibiogram, PCR, sequencing and phylogenetic tree analysis. Water samples were analyzed for physicochemical parameters using standard methods. Results indicated that water quality was deteriorated, Ps. Putida strains from fish, clinostomum and water samples showed the exact antimicrobial susceptibility profile where they were found to be highly resistant to ceftriaxone, ampicillin, ceftazidime, cefoxitin and cefazolin and ciprofloxacin. On the other hand, they were highly sensitive to Tobramycin, Amikacin, Imipenem, gentamicin, levofloxacin and norfloxacin. In PCR, targeting the 16s rRNA gene, all tested isolates showed the characteristic amplicon of 380 bp. Sequencing and phylogenetic analysis of Ps. Putida strains confirmed the identity of these isolates, indicating that the clinostomum was probably the source of infection. In conclusion, the study showed that the magnitude of clinostomum infestations and the high prevalence of isopods were linked to deteriorated water quality combined with high levels of pollution. It is suggested that the parasites investigated in this study could be a potential vector in the transmission of bacteria in fish.
520			_aارتفعت معدلات نفوق الأسماك في السنوات الأخيرة فجأة بسبب مسببات العدوى المختلطة والمتعددة.لذلك تم تصميم الدراسة التالية لفحص العدوى المشتركة بين البكتيريا والطفيليات في بعض أنواع الأسماك من بيئات مائية مختلفة في مصر واحتمالية أن الطفيليات يمكن أن تنقل البكتيريا. وقد سلطت الدراسة الضوء على تفاعل العوامل الممرضة والاجهاد الناجم عن التغيرات المناخية وتدهور معايير جودة المياه. تم عمل الدراسة عن طريق: اولاً: إجراء مسح للعدوى الطفيلية والبكتيرية الطبيعية المتزامنة في الأسماك في عام 2019 على 379 سمكة محتضرة او حديثة النفوق من أسماك المياه العذبة والبحرية ذات أوزان مختلفة ، تم جمعها موسمياً من نهر النيل بالجيزة ومن مثلث ديبا وبحيرة المنزلة ومن بحيرة قارون في محافظة الفيوم. تم فحص الأسماك للتعرف علي الطفيليات وعزل البكتيريا وتصنيفهما وتحديد جنسهما. وقد اسفرت النتائج عن وجود طفيل Clinostomum و / أو Euclinostomum spp. وكما تم العثور على ميكروب Pseudomonas في أسماك المياه العذبة بينما تم عزل طفيل Isopod وميكروبات Vibrio و Pseudomonas و Aeromonas من الأسماك البحرية. وتم تسجيل نسب انتشار الإصابة الشاملة بها والعدوي المتزامنة ومناقشة ارتباطها بالموسمية. أجريت الدراسة الثانية لمعرفة الخصائص المظهرية والوراثية لـميكروب Vibrio alginolyticus المعزولة من أسماك نافقة حديثا أو تحتضر وكذلك من طفيل isopod لإثبات تورطه في انتقال عدوي V. alginolyticus عن طريق إجراء تحليل كيميائي وحيوي واختبار حساسية المضاد الحيوي و PCR الخاص بالنوع وتحليل النشوء والتطور لجين 16S rRNA. بالإضافة إلى ذلك ، تم إجراء التحليل الفيزيائي الكيميائي للماء وتصنيف Isopod. كشفت النتائج عن تدهور جودة المياه، وكانت خصائص الحساسية لمضادات الميكروبات متطابقة لسلالات V. alginolyticus و Isopod التي تم الحصول عليها من الأسماك، والمياه فيما يخص الإريثروميسين والإيميبينيم وتريميثوبريم / سلفاميثوكسازول بينما كانت مقاومة للأمبيسيلين واللينكومايسين والكوليستين والبنسلين و قد أظهرت جميع العزلات المختبرة انها موجبة عند 737 زوج قاعدي و أظهر التحليل الوراثي لتسلسل الجين16S rRNA الجزئي أن V. alginolyticus المعزول من الأسماك و Isopod أظهر تشابهًا بنسبة 100٪ مع بعضهما البعض و نسبة 99.23% مع الماء ، مما يشير إلى أن Isopod كان على الأرجح مصدر العدوى. أما الدراسة الثالثة فقد أجريت لمعرفة العلاقة بين الإصابة بعدوى Clinostomum وانتقال Ps. Putida في أسماك Oreochromis niloticus و Tilapia zilli في منطقة البحر الأعظم بالجيزة. تم الحصول علي العزلات من الأسماك النافقة حديثا أو المحتضرة وكذلك من metacercarias خلال مواسم الشتاء والربيع والصيف والخريف ومن عينات المياه خلال فصلي الربيع والصيف. تم إخضاع العزلات للفحص الجرثومي والاختبارات البيوكيميائية وحساسية المضادات الحيوية و PCR والتسلسل وتحليل شجرة النشوء والتطور كما تم تحليل عينات المياه للخواص الفيزيائية والكيميائية باستخدام الطرق القياسية. أشارت النتائج إلى تدهور جودة المياه كما أظهرت تطابق دقيق لعزلات Ps. Putida المعزولة من عينات الأسماك وعينات Clinostomum والماء لحساسية المضادات الميكروبية حيث وجد أنها شديدة المقاومة للسيفترياكسون ، والأمبيسيلين ، والسيفتازيديم ، والسيفوكسيتين ، والسيفازولين و للسيبروفلوكساسين. ومن ناحية أخرى ، كانت شديدة الحساسية لتوبراميسين ، أميكاسين ، إيميبينيم ، جنتاميسين ، ليفوفلوكساسين ونورفلوكساسين. و أظهر التحليل الوراثي لتسلسل الجين 16S rRNA الجزئي أن P. putida المعزول من الأسماك و Clinostomum والماء أظهر تشابهًا بنسبة 100٪ مع بعضهما البعض، مما يشير إلى أن Clinostomum كان على الأرجح مصدر العدوى و في تفاعلPCR المتسلسل ، باستهداف جين 16S rRNA ، أظهرت جميع العزلات المختبرة انها موجبة عند 380 زوج قاعدي. تم الاستنتاج من الدراسة أن حجم الإصابة بالعدوى والانتشار المرتفع لـ Clinostomum و Isopods مرتبطان بتدهور جودة المياه المصحوب بمستويات عالية من التلوث. والدراسة تشير الي أن الطفيليات التي تم فحصها يمكن أن تكون ناقل محتمل للبكتيريا في الأسماك.
530			_aIssues also as CD.
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		7	_aParasites _2qrmak
653		0	_a Clinostomum _aIsopod _aVibrio-Pseudomonas _aInfestaion _aCo-infection _aTilapia zilli _aSolea aegyptica _aVector _a V. alginolyticus _aPseudomonas Putida
700	0		_aMohga Fouad Mahmoud Badawy _ethesis advisor.
700	0		_aTamer Fawzy Ismail _ethesis advisor.
700	0		_aSamah El said El sayed Laban _ethesis advisor.
900			_b01-01-2023 _cMohga Fouad Mahmoud Badawy _cTamer Fawzy Ismail _cSamah El said El sayed Laban _UCairo University _FFaculty of Veterinary Medicine _DDepartment of Veterinary Hygiene and Management
905			_aShimaa _eHuda
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c168513