000 05412namaa22004331i 4500
003 OSt
005 20250406131435.0
008 250227s2024 |||a|||frm||| 000 0 eng d
040 _aEG-GICUC
_beng
_cEG-GICUC
_dEG-GICUC
_erda
041 0 _aeng
_beng
_bara
043 _af-ua---
049 _aDeposit
082 0 4 _a632.8
092 _a632.8
_221
097 _aM.Sc
099 _aCai01.10.17.M.Sc.2024.Mo.M.
100 0 _aMohab Moamen Adly Ahmed Lotfy,
_epreparation.
245 1 0 _aMolecular characterization and phylogenetic analysis of canine parvovirus type 2 circulating in Egypt /
_cBy Mohab Moamen Adly Ahmed Lotfy; Under The Supervision of Prof. Dr. Mohamed Abd El-Hameed Shalaby, Prof. Dr. Haitham Mohamed Amer.
246 1 5 _aالتوصيف الجزيئي و دراسة ديناميكية المرض لفيروس بارفو الكلاب من النوع 2 المنتشر في مصر /
264 0 _c2024.
300 _a118 pages :
_billustrations ;
_c25 cm. +
_eCD.
336 _atext
_2rda content
337 _aUnmediated
_2rdamedia
338 _avolume
_2rdacarrier
502 _aThesis (M.Sc.)-Cairo University, 2024.
504 _aBibliography: pages 84-108.
520 _aCanine parvovirus type 2 (CPV-2) is a highly evolved DNA virus, and its evolution patterns frequently tend to be positive, producing distinct strains which vary geographically and temporally. Few researches of CPV-2 strains have been conducted in Egypt. We attempted to study a several evolution patterns of CPV-2. Many CPV-2 sequences from Egypt were analyzed for mutational events, then phylogenetically compared to worldwide strains. By the sequence analysis; the prevalence of CPV-2 subtypes in Egypt varied on time basis, hence the dominant subtype was first CPV2b in 2019, then CPV2a in 2020, and finally CPV2c in 2021. Among the isolated subtypes, the worldwide mutations T440A, Q370R, and F267Y are common in our strains in addition to the unique substations in residues G36R and V38E were repeated in some of our strains which might affect the flexibility of the cylinder at the fivefold axis, and also unique mutation at the critical residue N323H which control transferrin attachment of canine cell. The mutations A5G, Q370R, F267Y and Y324I were found together in most of our CPV-2c strains for the first time in Egypt, which resemble recently Asian strains. The phylogenetic analysis showed great similarity between our studied strains and strains belong to China, Vietnam and South Korea. Our study provided an updated molecular analysis of CPV-2 subtypes in Egypt and gave broader understanding of the new mutations introduced in our Egyptian strains.
520 _aفيروس بارفو المجرد هو فيروس DNA متطور للغاية ، وتميل أنماط تطوره في كثير من الأحيان إلى أن تكون إيجابية ، وتنتج سلالات متميزة تختلف جغرافيا وزمنيا. تم إجراء عدد قليل من الأبحاث حول سلالات CPV-2 في مصر. حاولنا دراسة العديد من أنماط تطور CPV-2. يتم تحليل العديد من تسلسلات CPV-2 من مصر بحثا عن أحداث طفرية ، ثم تتم مقارنتها من الناحية التطورية مع السلالات العالمية. اختلف انتشار الأنواع الفرعية CPV-2 في مصر على أساس زمني ، وبالتالي كان النوع الفرعي السائد هو CPV2b أولا في عام 2019 ، ثم CPV2a في عام 2020 ، وأخيرا CPV2c في عام 2021. من بين الأنواع الفرعية المعزولة ، الطفرات العالمية T440A و Q370R و F267Y شائعة في سلالاتنا بالإضافة إلى المحطات الفرعية الفريدة في المخلفات G36R ، تم تكرار V38E في بعض سلالاتنا التي قد تؤثر على مرونة الأسطوانة عند المحور الخماسي ، وكذلك طفرة فريدة في البقايا الحرجة N323H التي تتحكم في ارتباط الترانسفيرين بخلية. تم العثور على الطفرات A5G و Q370R و F267Y و Y324I معا في معظ سلالات CPV-2C لأول مرة في مصر ، والتي تشبه السلالات الآسيوية الحديثة. أظهر تحليل النشوء والتطور تطابقا كبيرا بين سلالاتنا المدروسة والسلالات التي تنتمي إلى الصين وفيتنام وكوريا الجنوبية. قدمت دراستنا تحليلا جزيئيا محدثا للأنواع الفرعية CPV-2 الموجودة في مصر ، وتوضح النتائج التي توصلنا إليها الاختلافات الجينية بين سلالات CPV-2 المصرية.
530 _aIssued also as CD
546 _aText in English and abstract in English.
650 7 _aViral diseases
_2qrmak
653 0 _aCanine parvovirus
_asubtypes
_amutation
_amolecular
700 0 _aMohamed Abd El-Hameed Shalaby
_ethesis advisor.
700 0 _aHaitham Mohamed Amer
_ethesis advisor.
900 _b01-01-2024
_cMohamed Abd El-Hameed Shalaby
_cHaitham Mohamed Amer
_UCairo University
_FFaculty of Veterinary Medicine
_DDepartment of Virology
905 _aSara
_eEman Ghareb
942 _2ddc
_cTH
_e21
_n0
999 _c171033