000			05937namaa22004211i 4500
003			OSt
005			20250427111539.0
008			250409s2024 ua a|||frm||| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _bara
049			_aDeposit
082	0	4	_a636.089
092			_a636.089 _221
097			_aPh.D
099			_aCai01.10.10.Ph.D.2024.No.E
100	0		_aNourhan Youssef Mahmoud Youssef, _epreparation.
245	1	0	_aEvaluation of the Gene-Xpert MTB/RIF assay for detection of Mycobacterium Tuberculosis Complex / _cby Nourhan Youssef Mahmoud Youssef ; Supervision Prof. Dr. Khaled Farouk El-Amry, Prof. Dr. Mahmoud Dardeery El-Hariry.
246	1	5	_aتقييم طقم Gene-Xpert MTB/RIF للكشف عن المايكوبكتريوم تيوبركلوزيس كمبلكس /
264		0	_c2024.
300			_a121 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
504			_aBibliography: pages 85-121.
520			_aThis study aimed to evaluate the sensitivity and specificity of the so-called GeneXpert MTB/RIF assay in detecting M. bovis in samples collected from cattle suspects to have tuberculosis. A retrospective study was conducted, including 50 dairy cows with a history of bTB. The GeneXpert technique, direct microscopy, and sample cultivation were carried out in parallel on all the samples to evaluate the diagnostic accuracy of each. GeneXpert showed higher positivity rates compared to the culture. Out of the examined 50 cattle lymph nodes from different slaughtered animals, 38 were GeneXpert-positive, and culture-positive, while 12 were GeneXpert-negative, and culture-negative. The performance of GeneXpert on animal lymph node samples demonstrated reliable detection capabilities. The study highlights the diagnostic potential of GeneXpert in detecting M. bovis infection, and its usefulness in diagnosing and monitoring infections in animal populations. GeneXpert offers improved sensitivity compared to conventional methods, and can aid in the accurate detection of M. bovis infection in clinical samples. In addition, a hundred human suspects were subjected to the routine clinical examination, chest X-ray, staining of sputum with the Ziehl-Neelsen method, skin tuberculin test, cultivation method, and finally, GeneXpert-MTB assay. Out of the hundred patients, 78 were confirmed using GeneXpert, while 63 were positive for the organism isolation. These results were evaluated across different age and gender factors. When evaluated against the isolation rate as the gold standard, the GeneXpert-assay expressed a fast and heartening results, with sensitivity (95.23 %), and specificity (59.3%) when dealing with 3 PCR negative cases of the 63 cases compared. GeneXpert-assay can be of value to keep positive cases hospitalized until confirmation with isolation of the slow growing causative bacterium. This will lead to better control on the disease dissemination in the community. However, in setups with moderate to low TB incidence, there is a necessity for further GeneXpert assessment studies.
520			_aإستهدفت هذه الدراسة تقييم حساسية طقم تشخيصي يعتمد على اختبار Real time PCR ويعرف ب GeneXpert MTB/RIF في الكشف عن عصيات السل البقري في عينات مأخوذة من أبقار متوقع إصابتها. و تم اختبار الطقم على 50 عينة بالتوازي مع العزل و الصبغ المباشر و اختبار التيوبركلين للمقارنة. وقد أظهر طقم GeneXpert MTB/RIF حساسية و نوعية عالية حيث كانت 38 عينة من 50 إيجابية لبكتيريا السل و قد أكد ذلك العزل البكتيري. إضافة فإن الطقم يظهر أيضاً مدى مقاومة البكتيريا للريفامبسين و الذي تم تطبيقه في هذه الدراسة على العينات الإيجابية. وفي هذه الدراسة أيضا تم اختبار طقم GeneXpert MTB/RIF على 100 عينة آدمية مأخوذة من حالات تم فحصها إكلينيكياً و معملياً للإصابة بالسل. حيث تم اختبار المرضى بالتصوير الإشعاعي و اختبار الجلد و صبغ عينات بصاق و كذلك زرعها للعزل البكتيري. كذلك تم فحص المرضى للتحري عن الإصابة بالإيدز من عدمه. وقد أظهرت 78 عينة إيجابية للسل (78%) بينما كان فقط 63 عينة إيجابية مع العزل البكتيري (63%) .وقد تم تسجيل أعمار و أجناس المرضى ولم يوجد أي ارتباط مع الجنس بينما كانت النسب أعلى في الأعمار الكبيرة. وبمقارنته بنتائج العزل، أظهر GeneXpert MTB/RIF حساسية ونوعية 95.23 % و 59.4% على التوالي. وعليه فإن استعمال طقم GeneXpert MTB/RIF مفيد جداً للسيطرة على انتشار مرض السل بين الآدميين وكذلك الحيوانات المزرعية.
530			_aIssues also as CD.
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		7	_aVeterinary Sciences _2qrmak
653		0	_aCattle _aMycobacterium bovis GeneXpert _aHIV _apulmonary tuberculosis _atuberculin-skin-test _aX-ray
700	0		_aKhaled Farouk El-Amry _ethesis advisor.
700	0		_aMahmoud Dardeery El-Hariry _ethesis advisor.
900			_b01-01-2024 _cKhaled Farouk El-Amry _cMahmoud Dardeery El-Hariry _UCairo University _FFaculty of Veterinary Medicine _DDepartment of Microbiology
905			_aShimaa _eEman Ghareb
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c171393