000			07466namaa22004331i 4500
003			OSt
005			20250610135810.0
008			250610s2024 ua a|||frm||| 000 0 eng d
040			_aEG-GICUC _beng _cEG-GICUC _dEG-GICUC _erda
041	0		_aeng _beng _bara
049			_aDeposit
082	0	4	_a633.32
092			_a633.32 _221
097			_aPh.D
099			_aCai01.07.10.Ph.D.2024.Ha.M
100	0		_aHagar Mostafa Mohamed Mohamed, _epreparation.
245	1	0	_aMolecular marker development and characterization in egyptian clover (Trifolium alexandrinum L.) / _cby Hagar Mostafa Mohamed Mohamed ; Supervisors Dr. Salah El-Din Sayed Mohamed El-Assal, Dr. Abdel-Kader Youssef Gamal El-Din, Dr. Dina Aziz El-Khishin.
246	1	5	_aتطوير وتوصيف الكواشف الجزيئيه في البرسيم المصرى (Trifolium alexandrinum L.) /
264		0	_c2024.
300			_a139 pages : _billustrations ; _c25 cm. + _eCD.
336			_atext _2rda content
337			_aUnmediated _2rdamedia
338			_avolume _2rdacarrier
502			_aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
504			_aBibliography: pages 122-139.
520			_aEgyptian clover (Trifolium alexandrinum) has received limited attention regarding its genetic diversity, rendering it susceptible to climate change. Exploring its genetic resources is vital for enhancing the diversity within its germplasm to develop resilient Berseem varieties, thereby optimizing breeding programs. Twenty-four Berseem accessions were examined, using three different molecular marker types i.e, Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) (10 primers), Start Codon Targeted polymorphism (SCoT) (22 primers) and Sequence-Related Amplified Polymorphism (SRAP) (17 primer combinations) revealed a high genetic variability. ISSR markers had the highest polymorphism rate (82.2%) compared to SCoT (69.6%) and SRAP (65.2%). Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) clustering analysis divided the studied accessions into two major groups that supported by STRUCTURE analysis, which split samples into two subpopulations (∆K = 2). Additionally, this classification was verified by both principal component analysis (PCA) and a heat map. The study underscores the importance of Berseem's genetic diversity in crop development and breeding, with ISSR markers offering valuable insights due to their high polymorphism. Despite the diverse geographic origins of the accessions, the lack of geographic clustering implies significant genetic mixing, possibly because of high outcrossing facilitated by insect pollination or self-incompatibility. The combined use of multiple markers deepens our understanding of Berseem's genetics by providing more detailed and comprehensive coverage of the clover genome, allowing for increased resolution, validation of results and a holistic perspective on the genomic landscape furthermore, identifying and recommending specific Berseem accessions (NGB-43724, NGB-19680, Gemeiza1, and Giza6) as prospective candidates for future breeding programs in Egypt.was taken into consideration utilizing DNA barcoding, our study thoroughly examines the genetic makeup of Fahl (ARC) and Meskawi (acc. 43724) populations, contributing crucial data for conservation and breeding endeavors. The study also explored gene expression responses of Trifolium alexandrinum under varied drought durations, revealing consistent patterns with known stress responses. Key genes, including 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase, and senescence-associated protein (putative). showed notable expression changes, laying the groundwork for understanding drought resilience mechanisms in this crop
520			_aبدأت الدراسة بفحص تنوع البرسيم المصري (Trifolium alexandrinum L.) والذى حظى باهتماممحدود من خلال تقييم موارده الوراثية لتعزيز تطوير أصناف متينة. استخدمت الدراسة ثلاثة أنواع من المعلمات الجزيئية: متكررة تكرار التسلسل البسيط (ISSR) باستخدام 10 برايمرات، المعلم المستهدف لكودون البدء (SCoT) باستخدام 22 برايمر، وتكرار التسلسل المرتبط بالتضاعف باستخدام 17 مجموعة برايمرات، وكشفت هذه العلامات عن تباين وراثي عالٍ. سجلت المعلمات ISSR أعلى معدل للتعدد الظاهري (82.2٪) مقارنة بالـ (69.6٪) SCoT و (65.2٪). SRAP قسّم تحليل تجميع الأزواج غير الموزونة بالمتوسط الحسابي (UPGMA) العينات إلى مجموعتين رئيسيتين، ولقد دعم تحليل STRUCTURE والذي قد قسم العينات إلى مجموعتين فرعيتين (∆K = 2) تم التحقق من هذا التصنيف باستخدام تحليل المكونات الرئيسية (PCA) وخريطة الحرارة، مما سلط الضوء على أهمية التنوع الوراثي في تطوير المحاصيل. أثبتت الدراسة أن المعلمات ISSR توفر تحقيقات قيمة بفضل تعدد ظواهرها الوراثية العالية. على الرغم من التنوع الجغرافي للعينات لم يظهر التجميع الجغرافي مما قد يعني وجود مزيج جيني هام ربما نتيجة للتلقيح الحشري أو عدم التوافق الذاتي. عمّق استخدام العلامات المتعددة فهمنا للجينات في البرسيم من خلال توفير تغطية أكثر تفصيلًا وشمولية للجينوم. حددت الدراسة عينات محددة من البرسيم NGB-43724و NGB-19680 و Gemeiza1، وGiza6 كمرشحين محتملين لبرامج التربية المستقبلية في مصر. من خلال استخدام ترميز الحمض النووي barcoding ، فحصت الدراسة الخلفية الجينية لسلالات الفحل (ARC) والمسقاوي (acc. 43724) ، مما ساهم ببيانات حيوية لجهود الحفظ والتربية. أظهرت استجابات تعبير الجينات لـ Trifolium alexandrinum تحت ظروف الجفاف المتغيرة أنماطًا ثابتة مع استجابات إجهاد معروفة. سجلت الجينات الرئيسية مثل الديوكسيجينيز والفينول البيرفيرات و وكربوكسيليز الريبولوز-1و5-ثنائي الفوسفات/ الأكسجيناز. وبروتين مرتبط بالشيخوخة (افتراضي) تغييرات
530			_aIssues also as CD.
546			_aText in English and abstract in Arabic & English.
650		7	_aclover _2qrmak
653		0	_aTrifolium _aBerseem _aISSR _aSCoT _aSRAP _aGenetic diversity
700	0		_aSalah El-Din Sayed Mohamed El-Assal _ethesis advisor.
700	0		_aAbdel-Kader Youssef Gamal El-Din _ethesis advisor.
700	0		_aDina Aziz El-Khishin _ethesis advisor.
900			_b01-01-2024 _cSalah El-Din Sayed Mohamed El-Assal _cAbdel-Kader Youssef Gamal El-Din _cDina Aziz El-Khishin _dMohamed Abd-Elsallam Rashed _dMohamed Abd-Elhamid Elawady _UCairo University _FFaculty of Agriculture _DDepartment of Genetics
905			_aShimaa
942			_2ddc _cTH _e21 _n0
999			_c172486