000 09003namaa22004451i 4500
003 OSt
005 20250918132555.0
008 250818s2024 ua a|||frm||| 000 0 eng d
040 _aEG-GICUC
_beng
_cEG-GICUC
_dEG-GICUC
_erda
041 0 _aeng
_beng
_bara
049 _aDeposit
082 0 4 _a572
092 _a572
_221
097 _aPh.D
099 _aCai01.12.02.Ph.D.2024.Ka.S
100 0 _aKarim Barakat Abdelfattah Barakat,
_epreparation.
245 1 0 _aSynthesis, molecular docking, biological activities and molecular studies of some novel unsaturated carbonyl derivatives /
_cby Karim Barakat Abdelfattah Barakat ; Supervisors Prof.Dr. Amr Mohamed Abdelmoniem Hassan, Dr. Mohamed Attia Ragheb 3. Dr. Marwa Hasan Soliman, Dr. Marwa Mohamed Mohamed Ahmed Sharaky.
246 1 5 _aالتحضير والتنميط الجزيئي والنشاطات البيولوجية والدراسات الجزيئية لبعض مشتقات الكربونيل غير المشبعة الجديدة
264 0 _c2024.
300 _a127 pages :
_billustrations ;
_c25 cm. +
_eCD.
336 _atext
_2rda content
337 _aUnmediated
_2rdamedia
338 _avolume
_2rdacarrier
502 _aThesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
504 _aBibliography: pages 97-125.
520 3 _aThe thesis is composed of two parts: Part 1: A novel series of 2-cyano-3-(pyrazol-4-yl)-N-(thiazol-2-yl)acrylamide derivatives (3a–f) were synthesized using Knoevenagel condensation and characterized using various spectral tools. The weak nuclease activity of compounds (3a–f) against pBR322 plasmid DNA was greatly enhanced by irradiation at 365 nm. Compounds 3b and 3c, incorporating thienyl and pyridyl moieties, respectively, exhibited the utmost nuclease activity in degrading pBR322 plasmid DNA through singlet oxygen and superoxide free radicals’ species. Furthermore, compounds 3b and 3c affinities towards calf thymus DNA (CT-DNA) and bovine serum albumin (BSA) were investigated using UV–Vis and fluorescence spectroscopic analysis. They revealed good binding characteristics towards CT-DNA with Kb values of 6.68 × 10 M-1 and 1.19 × 10 M-1 for 3b and 3c, respectively. In addition, compounds 3b and 3c ability to release free radicals on radiation were targeted to be used as cytotoxic compounds in vitro for colon (HCT116) and breast cancer (MDA-MB-231) cells. A significant reduction in the cell viability on illumination at 365 nm was observed, with IC50 values of 23 and 25 µM against HCT116 cells, and 30 and 9 µM against MDA-MB-231 cells for compounds 3b and 3c, respectively. In conclusion, compounds 3b and 3c exhibited remarkable DNA cleavage and cytotoxic activity on illumination at 365 nm which might be associated with free radicals’ production in addition to having a good affinity for interacting with CT-DNA and BSA. Part 2: A novel series of ethyl (2-cyanoacrylamido)-1,3-diphenyl-1H-pyrazole-4-carboxylate (3a-d) derivatives were synthesized using Knoevenagel condensation and characterized using various spectral tools. The cytotoxic effect of compounds (3a-d) against HCT116 and PC3 cell lines was investigated. Compound 3d bearing indole moiety exhibited the greatest activity against both cell lines with IC50 values 6.1 and 30.5 µg/ml for HCT116 and PC3 Cell lines respectively. Moreover, cell cycle flow cytometric analysis revealed G0/G1 cell cycle arrest for HCT116 cells treated with the IC50 value. In addition, ELISA studies showed upregulation of both p53, caspase-3, and E-cadherin proteins, besides downregulation of CDK4 and Cyclin D1 proteins. Furthermore, compound 3d affinity towards calf thymus DNA (SS-DNA) and bovine serum albumin (BSA) was investigated using UV–Vis and fluorescence spectroscopic analysis. It revealed good binding characteristics towards SS-DNA with Kb value of 3 × 105 M-1 and 2.22 × 105 M-1 for SS-DNA and BSA, respectively. In addition, molecular docking studies of compound 3d with various proteins (BCL2, CDK6, CDK4, and cyclin D1), and BSA were performed to confirm our experimental studies.
520 3 _aملخص البحث للجزء الاول : تم تصنيع سلسلة جديدة من مشتقات Cyanoacrylamide (3a-f) بإستخدام تكاثف كنوفيناغل وتم وصفها باستخدام أدوات طيفية مختلفة. تم تعزيز نشاط النوكلياز الضعيف للمركبات (3a-f) ضد pBR322 DNA البلازميدي بشكل كبير عن طريق الإشعاع عند 365 نانومتر. أظهرت المركبات 3bو3c، التي تحتوي على مجموعات ثينيل وبيريديل، على التوالي، أقصى نشاط نوكلياز في تحلل pBR322 DNA البلازميدي من خلال أنواع الأكسجين الأحادي والجذور الحرة فوق الأكسيد. علاوة على ذلك، تم التحقيق في تقارب المركبات 3bو3c تجاه (CT-DNA) وألبومين مصل البقر (BSA) بإستخدام تحليل الأشعة فوق البنفسجية المرئية والتحليل الطيفي الفلوري. وقد أظهرت هذه المركبات خصائص ارتباط جيدة تجاه CT-DNA مع قيم Kb تبلغ M-1 104×6.68 و1M-104×1.19 لـ 3b و3c على التوالي. بالإضافة إلى ذلك، تم استهداف قدرة المركبات 3b و3c على إطلاق الجذور الحرة عند التعرض للإشعاع لاستخدامها كمركبات سامة للخلايا في المختبر لخلايا سرطان القولون (HCT116) وسرطان الثدي (MDA-MB-231) وقد لوحظ إنخفاض كبير في قابلية الخلايا للبقاء عند الإضاءة عند 365 نانومتر، مع قيم IC50 تبلغ 23 و25 ميكرومولر ضد خلايا HCT116، و30 و9 ميكرومولر ضد خلايا MDA-MB-231 للمركبات 3b و 3c على التوالي. وفي الختام، أظهرت المركبات 3b و 3c انقسامًا ملحوظًا للحمض النووي ونشاطًا سامًا للخلايا عند الإضاءة عند 365 نانومتر والذي قد يكون مرتبطًا بإنتاج الجذور الحرة بالإضافة إلى وجود تقارب جيد للتفاعل مع CT-DNA و.BSA الكلمات الدالة: Cyanoacrylamide; انقسام الحمض النووي; ربط DNA/BSA; السمية الخلوية; خلايا ;HCT116 خلايا ;MDA-MB-231 العلاج الضوئي الديناميكي ملخص البحث للجزء الثانى : تم تصنيع سلسلة جديدة من مشتقات Cyanoacrylamide (3a-d) بإستخدام تكثيف كنوفيناغل وتم وصفها باستخدام أدوات طيفية مختلفة. تم التحقيق في التأثير السام للمركبات (3a-d) ضد خطوط خلايا HCT116 وPC3. أظهر مركب 3d التي تحمل مجموعة إندول أكبر نشاط ضد كلا خطوط الخلايا بقيم(IC50) 6.1 و 30.5 ميكروجرام / مل لخطوط خلايا HCT116 وPC3 على التوالي. علاوة على ذلك، كشف تحليل تدفق دورة الخلية عن توقف دورة الخلية G0 / G1 لخلايا HCT116 المعالجة بقيمة الIC50. بالإضافة إلى ذلك، أظهرت دراسات ELISA زيادة تنظيم كل من بروتينات p53 و caspase-3 و E-cadherin، إلى جانب انخفاض تنظيم بروتينات CDK4 و Cyclin D1. علاوة على ذلك، تم التحقيق في تقارب المركب 3d تجاه (SS-DNA) وألبومين مصل البقر (BSA) باستخدام تحليل الأشعة فوق البنفسجية المرئية والتحليل الطيفي الفلوري. وقد كشف عن خصائص ارتباط جيدة (Kb) بقيم 3 × 105 M-1 و2.22× 105 لـ SS-DNA وBSA، على التوالي. بالإضافة إلى ذلك، تم إجراء دراسات الالتحام الجزيئي للمركب 3d مع بروتينات مختلفة (BCL2 وCDK6 وCDK4 وcyclin D1) وBSA لتأكيد دراساتنا التجريبية.
530 _aIssues also as CD.
546 _aText in English and abstract in Arabic & English.
650 0 _aBiochemistry
653 1 _aDNA photocleavage
_a DNA/BSA binding
_aCytotoxicity
_aHCT116 cells
_aMDA-MB-231 cells
_aPhotodynamic therapy
_aMolecular docking
700 0 _aAmr Mohamed Abdelmoniem Hassan
_ethesis advisor.
700 0 _aMohamed Attia Ragheb
_ethesis advisor.
700 0 _aMarwa Hasan Soliman
_ethesis advisor.
700 0 _aMarwa Mohamed Mohamed Ahmed Sharaky
_ethesis advisor.
900 _b01-01-2024
_cAmr Mohamed Abdelmoniem Hassan
_cMohamed Attia Ragheb
_cMarwa Hasan Soliman
_cMarwa Mohamed Mohamed Ahmed Sharaky
_UCairo University
_Faculty of Science
_DDepartment of Chemistry
905 _aShimaa
_eEman Ghareb
942 _2ddc
_cTH
_e21
_n0
999 _c173604