000 06019namaa22004451i 4500
003 EG-GICUC
005 20251111102743.0
008 251110s2025 ua a|||frm||| 000 0 eng d
040 _aEG-GICUC
_beng
_cEG-GICUC
_dEG-GICUC
_erda
041 0 _aeng
_beng
_bara
049 _aDeposit
082 0 4 _a660.62
092 _a660.62
_221
097 _aM.Sc
099 _aCai01.07.06.M.Sc.2025.Na.B
100 0 _aNada Ahmed Moner,
_epreparation.
245 1 0 _aBiodiversity of salt- affected microbiota associated to natural halophytic flora /
_cby Nada Ahmed Moner ; Supervisors Dr.Nabil Abrahim Hegazi, Dr. Mohamed Fayez Fouad, Dr.Tarek Sayed Ragab.
246 1 5 _aالتنوع الحيوي للميكروبات المصاحبة للفلورا الطبيعية في الاوساط الملحية
264 0 _c2025.
300 _a109 pages :
_billustrations ;
_c25 cm. +
_eCD.
336 _atext
_2rda content
337 _aUnmediated
_2rdamedia
338 _avolume
_2rdacarrier
502 _aThesis (M.Sc)-Cairo University, 2025.
504 _aBibliography: pages 93-109.
520 3 _aMicrobiome-mediated strategies for future stressed-agriculture entail exploration of repertoires of halophyte microbiota. Culturomics strategies are advanced to improve culturability and extend diversity of microbiota of Salicornia europaea L. The plant broth-based-seawater-culture medium (PBSW) was advanced for in vitro domestication of microbiota of endo-rhizosphere/endo-phyllosphere of S. europaea. Populations (Colony Forming Units, CFUs) and biomass production (Optical Density, OD) were monitored throughout successive steps of in vitro cultivation/domestication in liquid batch cultures. Culture-dependent methods were applied to cultivate and identify (16S rRNA gene sequencing) representative isolates; and culture-independent analyses, denaturing gradient gel electrophoresis and real time PCR, (DGGE/qPCR) for community composition. PBSW supported higher CFUs counts; and related to 16S rRNA gene copy numbers (qPCR), increased (ca, 44-fold) culturability compared to NaCl-salted-standard culture medium. Successive in vitro domestication/batch cultures boosted bacterial growth, diminished differences among tested culture media and shortened doubling times (DT). PCR-DGGE showed divergence in culturable community composition primarily attributed to culture media. 16S rRNA gene sequencing of representative isolates indicated: a) greater diversity in endo-phyllospherethan endo-rhizosphere; b) abundant phyla were Pseudomonadota / Bacillota /Actinomycetota; c) dominance of Halomonas among 15 genera identified; d) Gracilibacillus, Metabacillus, Mixta, Salinicoccus, Zhihengliuella, Marinobacter, Marinimicrobium and Planomicrobium were first reported/cultivated for S. europaea. In vitro domestication resulted in dominance of genera of Pseudomonadota/Bacillota for endo-phyllosphere and Halomonas sp. of Pseudomonadota for endo-rhizosphere. PBSW created in situ similis milieu for cultivation of halophyte bacteria, and enabled in vitrodomestication for propagating microbiota, instead of laborious construction of consortia of single isolates, for future SynCom applications.
520 3 _aتم تطوير بيئة تعتمد على عصارة النبات ومياه البحر (PBSW) لاستئناس و عزل ميكروبات المناطق الداخلية للجذور والأوراق لنبات الساليكورنيا في المختبر. تمت مراقبة أعداد المستعمرات البكتيرية (CFUs) وإنتاج الكتلة الحيوية (الكثافة الضوئية، OD600)) خلال خطوات متتالية من الزراعة في مزارع بيئية سائلة. استخدمت الطرق المعتمدة على العزل كما استخدمت التحليلات غير المعتمدة على الزراعة (DGGE/qPCR) .دعمت بيئة PBSW أعدادًا أعلى من CFUs؛ وبالنسبة لنسخ جين 16S rRNA (qPCR)، زادت القابلية للعزل بحوالى 40 ضعفًا مقارنة بالبيئة الصناعية المدعمة بـملح NaCl . عززت تقنية الاستئناس المتتالية في المختبر نمو البكتيريا، وقلل الفروقات بين البيئات المختبرة، وقصّر وقت تضاعف خلايا الميكروبات.(DT) أظهرت تقنية PCR-DGGE تباينًا في تركيب المجتمع القابل للعزل حيث يُعزى الاختلاف أساسًا إلى نوع البيئات المستخدمة. أشارت نتائج 16S rRNA للعزلات الممثلة إلى: أ) تنوع أكبر في الميكروبات الداخلية للأوراقendo-phyllosphere مقارنة بالجذورendo-rhizosphere ب) الفصائل البكتيرية الأكثر وفرة هي Pseudomonadota وBacillota وActinomycetota ج) سيطرة جنس Halomonas بين 15 جنسًا محددًا؛ د) تم االعزل لأول مرة عن أجناس Gracilibacillus وMetabacillus وMixta وSalinicoccus وZhihengliuella وMarinobacter وMarinimicrobium و Planomicrobium في نبات الساليكورنيا.
530 _aIssues also as CD.
546 _aText in English and abstract in Arabic & English.
650 0 _aMicrobiology
650 0 _aالميكروبيولوجيا
653 0 _aHalophyte microbiota
_aSalicornia europaea
_a Microbiota in vitro- domestication
_aCulturomics of halophyte microbiota
_aMariout lake-Alexandria-Egypt halophytes
_aBiomass production of halophyte microbiota
700 0 _aNabil Abrahim Hegazi
_ethesis advisor.
700 0 _aMohamed Fayez Fouad
_ethesis advisor.
700 0 _aTarek Sayed Ragab
_ethesis advisor.
900 _b01-01-2025
_cNabil Abrahim Hegazi
_cMohamed Fayez Fouad
_cTarek Sayed Ragab
_UCairo University
_FFaculty of Agricultural
_DDepartment of Agricultural Microbiology
905 _aShimaa
942 _2ddc
_cTH
_e21
_n0
999 _c175733