The nuclear factor kappa b pathway among egyptian patients with behcet’s syndrome and its correlation with the disease activity /
Moustafa Ali Saad Ali Soliman,
The nuclear factor kappa b pathway among egyptian patients with behcet’s syndrome and its correlation with the disease activity / مسار العامل النووي كابا ب بين مرضى متلازمة بهجت المصريين وارتباطه بنشاط المرض / by Moustafa Ali Saad Ali Soliman ; Supervised by Prof. Dr. Hala Ibrahem Elgendy, Prof. Dr. Olfat Gamil Shaker, Dr. Mervat Essam Behiry, Dr. Ahmed Hatem Laymouna. - 95 pages : illustrations ; 25 cm. + CD.
Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
Bibliography: pages 200-250.
Background: Behcet's syndrome (BS) is a variable-vessel vasculitis characterized by
recurrent orogenital ulcerations, ocular inflammation, and other manifestations.
Hyperactive innate immunity plays an integral role in the pathogenesis of BS. The
nuclear factor kappa B (NFKB) pathway family is a family of intracellular
transcriptional factors that operate inside the neutrophils and macrophages upon
stimulation of Toll-Like Receptor 4. It is involved in regulating inflammatory
responses including innate and adaptive immune responses. NFKB pathway has a
prominent role in the pathogenesis of BS. The NFKB1 intronic single nucleotide
polymorphism (SNP) (rs4648068) is an A>G intron SNP in the NFKB1 gene that
is postulated to have a possible role in the pathogenesis of BS. Micro-ribonucleic
acid-9 (miRNA-9) is a miRNA that acts as an important regulator in neoplastic,
neuronal, and autoimmune diseases. miRNA-9 operates as a negative feedback
loop on the NFKB pathway. We aimed to study the association between the
NFKB1 A>G (rs4648068) SNP and BS in Egyptian patients, in comparison to
healthy controls, and to correlate the presence of rs4648068 SNP with the different
activity domains of the disease. Also, we aimed to assess the possible role of
miRNA-9 in BS, in comparison to healthy controls, and different activity domains.
Subjects and Methodology:
After ethical committee approval (Faculty of Medicine, Cairo University,
Egypt, code MD-228-2022), the International Study Group Criteria for Behçet
Disease (ISBD) criteria was used to recruit 60 BS patients, and the activity of the
disease was assessed using Behcet’s Disease Current Activity Form (BDCAF), and
the Behcet Syndrome Activity Score (BSAS). Another 60 matched controls were
recruited. DNA extraction was done followed by PCR amplification to detect the
target SNP. Gene expression of miRNA-9 was assessed using real-time PCR.
Relative quantitation was calculated against internal control specific for miRNA.
Results:
The GG genotype was significantly higher in BS versus controls (21.7% and
5% respectively, p value=0.015). Also, the G allele was significantly higher in BS
versus controls (43.3% and 30% respectively, p value=0.033). Of the whole
2
activity domains, only arthralgia was found to be significantly correlated with
rs4648068 SNP.
Also, our results showed a mean miRNA-9 53.44 fold change among cases
in comparison to control (p-value < 0.001). ROC analysis concluded a cutoff value
of miRNA-9 fold change (FC= 1.035, p-value < 0.001) with 71.7% sensitivity and
100% specificity to differentiate BS cases from controls.
Conclusion:
NFKB1 rs4648068 A>G SNP increases the risk of developing BS. Among
patients with BS, the GG genotype is protective against developing arthralgia.
There is no statistically significant relation between rs4648068 SNP and either
other activity domains of BS or the different activity scores of the disease. Also,
miRNA-9 is a possible diagnostic marker in BS cases and may help in
discriminating BS cases from conditions with similar presentations in case of
diagnostic doubt with a high level of statistical significance. متلازمة بهجت هي التهاب مناعي بالأوعية الدموية يتميز بقرح متكررة بالفم والمنطقة التناسلية مع التهاب بالعين ومظاهر أخرى.
فرط المناعة الفطرية أمر أساسي في التسبب في متلازمة بهجت. عائلة مسار العامل النووي كابا ب هي عائلة من عوامل النسخ داخل الخلايا التي تعمل داخل الخلايا المتعادلة والخلايا الآكلة الكبيرة عند تحفيز مستقبل Toll-Like 4. كما تشارك في تنظيم الاستجابات الالتهابية بما في ذلك الاستجابات المناعية الفطرية والتكيفية. تمت دراسة مسار العامل النووي كابا ب سابقًا في متلازمة بهجت. تم اقتراض أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ذو الرقم المرجعي rs4648068 يمكن أن يكون له دور في نشوء متلازمة بهجت.
الرنا متناهي الصغر 9 هو نوع من الرنا متناهي الصغر والذي يعمل كمنظم مهم في أمراض الأورام والخلايا العصبية والمناعة الذاتية. يعمل الرنا متناهي الصغر9 كحلقة تغذية سلبية لكبح جماح مسار العامل النووي كابا ب.
نهدف من خلال هذه الدراسة إلى دراسة الارتباط بين تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ذو الرقم المرجعي rs4648068 ومتلازمة بهجت في المرضى المصريين، بالمقارنة مع العينات الضابطة، وربطه مع مظاهر النشاط المختلفة للمرض. أيضًا، نحن نهدف إلى تقييم الدور المحتمل لـلرنا متناهي الصغر 9 في متلازمة بهجت، مقارنةً بالعينات الضابطة وأيضا مقارنته مع مظاهر النشاط المختلفة.
بعد موافقة لجنة القيم، تم دراسة 60 مريض بمتلازمة بهجت بالمقارنة مع 60 مشارك سليم صحيا. تم دراسة نشاط المرض بواسطة الاستبيانات المعتمدة لدراسته مثل (BDCAF) و (BSAS) .
تم إجراء استخراج الحمض النووي متبوعًا بتقنية PCR للكشف عن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ذو الرقم المرجعي rs4648068. تم تقييم التعبير الجيني لـلرنا متناهي الصغر 9 باستخدام تقنية PCR أيضا.
Text in English and abstract in Arabic & English.
Internal Medicine
Behcet syndrome SNPs NFKB rs4648068 SNP miRNA-9
616.3
The nuclear factor kappa b pathway among egyptian patients with behcet’s syndrome and its correlation with the disease activity / مسار العامل النووي كابا ب بين مرضى متلازمة بهجت المصريين وارتباطه بنشاط المرض / by Moustafa Ali Saad Ali Soliman ; Supervised by Prof. Dr. Hala Ibrahem Elgendy, Prof. Dr. Olfat Gamil Shaker, Dr. Mervat Essam Behiry, Dr. Ahmed Hatem Laymouna. - 95 pages : illustrations ; 25 cm. + CD.
Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2024.
Bibliography: pages 200-250.
Background: Behcet's syndrome (BS) is a variable-vessel vasculitis characterized by
recurrent orogenital ulcerations, ocular inflammation, and other manifestations.
Hyperactive innate immunity plays an integral role in the pathogenesis of BS. The
nuclear factor kappa B (NFKB) pathway family is a family of intracellular
transcriptional factors that operate inside the neutrophils and macrophages upon
stimulation of Toll-Like Receptor 4. It is involved in regulating inflammatory
responses including innate and adaptive immune responses. NFKB pathway has a
prominent role in the pathogenesis of BS. The NFKB1 intronic single nucleotide
polymorphism (SNP) (rs4648068) is an A>G intron SNP in the NFKB1 gene that
is postulated to have a possible role in the pathogenesis of BS. Micro-ribonucleic
acid-9 (miRNA-9) is a miRNA that acts as an important regulator in neoplastic,
neuronal, and autoimmune diseases. miRNA-9 operates as a negative feedback
loop on the NFKB pathway. We aimed to study the association between the
NFKB1 A>G (rs4648068) SNP and BS in Egyptian patients, in comparison to
healthy controls, and to correlate the presence of rs4648068 SNP with the different
activity domains of the disease. Also, we aimed to assess the possible role of
miRNA-9 in BS, in comparison to healthy controls, and different activity domains.
Subjects and Methodology:
After ethical committee approval (Faculty of Medicine, Cairo University,
Egypt, code MD-228-2022), the International Study Group Criteria for Behçet
Disease (ISBD) criteria was used to recruit 60 BS patients, and the activity of the
disease was assessed using Behcet’s Disease Current Activity Form (BDCAF), and
the Behcet Syndrome Activity Score (BSAS). Another 60 matched controls were
recruited. DNA extraction was done followed by PCR amplification to detect the
target SNP. Gene expression of miRNA-9 was assessed using real-time PCR.
Relative quantitation was calculated against internal control specific for miRNA.
Results:
The GG genotype was significantly higher in BS versus controls (21.7% and
5% respectively, p value=0.015). Also, the G allele was significantly higher in BS
versus controls (43.3% and 30% respectively, p value=0.033). Of the whole
2
activity domains, only arthralgia was found to be significantly correlated with
rs4648068 SNP.
Also, our results showed a mean miRNA-9 53.44 fold change among cases
in comparison to control (p-value < 0.001). ROC analysis concluded a cutoff value
of miRNA-9 fold change (FC= 1.035, p-value < 0.001) with 71.7% sensitivity and
100% specificity to differentiate BS cases from controls.
Conclusion:
NFKB1 rs4648068 A>G SNP increases the risk of developing BS. Among
patients with BS, the GG genotype is protective against developing arthralgia.
There is no statistically significant relation between rs4648068 SNP and either
other activity domains of BS or the different activity scores of the disease. Also,
miRNA-9 is a possible diagnostic marker in BS cases and may help in
discriminating BS cases from conditions with similar presentations in case of
diagnostic doubt with a high level of statistical significance. متلازمة بهجت هي التهاب مناعي بالأوعية الدموية يتميز بقرح متكررة بالفم والمنطقة التناسلية مع التهاب بالعين ومظاهر أخرى.
فرط المناعة الفطرية أمر أساسي في التسبب في متلازمة بهجت. عائلة مسار العامل النووي كابا ب هي عائلة من عوامل النسخ داخل الخلايا التي تعمل داخل الخلايا المتعادلة والخلايا الآكلة الكبيرة عند تحفيز مستقبل Toll-Like 4. كما تشارك في تنظيم الاستجابات الالتهابية بما في ذلك الاستجابات المناعية الفطرية والتكيفية. تمت دراسة مسار العامل النووي كابا ب سابقًا في متلازمة بهجت. تم اقتراض أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ذو الرقم المرجعي rs4648068 يمكن أن يكون له دور في نشوء متلازمة بهجت.
الرنا متناهي الصغر 9 هو نوع من الرنا متناهي الصغر والذي يعمل كمنظم مهم في أمراض الأورام والخلايا العصبية والمناعة الذاتية. يعمل الرنا متناهي الصغر9 كحلقة تغذية سلبية لكبح جماح مسار العامل النووي كابا ب.
نهدف من خلال هذه الدراسة إلى دراسة الارتباط بين تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ذو الرقم المرجعي rs4648068 ومتلازمة بهجت في المرضى المصريين، بالمقارنة مع العينات الضابطة، وربطه مع مظاهر النشاط المختلفة للمرض. أيضًا، نحن نهدف إلى تقييم الدور المحتمل لـلرنا متناهي الصغر 9 في متلازمة بهجت، مقارنةً بالعينات الضابطة وأيضا مقارنته مع مظاهر النشاط المختلفة.
بعد موافقة لجنة القيم، تم دراسة 60 مريض بمتلازمة بهجت بالمقارنة مع 60 مشارك سليم صحيا. تم دراسة نشاط المرض بواسطة الاستبيانات المعتمدة لدراسته مثل (BDCAF) و (BSAS) .
تم إجراء استخراج الحمض النووي متبوعًا بتقنية PCR للكشف عن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ذو الرقم المرجعي rs4648068. تم تقييم التعبير الجيني لـلرنا متناهي الصغر 9 باستخدام تقنية PCR أيضا.
Text in English and abstract in Arabic & English.
Internal Medicine
Behcet syndrome SNPs NFKB rs4648068 SNP miRNA-9
616.3