Image from OpenLibrary

Study Of Serum Albumin Binding Of Sunitinib Analogues Using Molecular Docking, Spectroscopic And Chromatographic Methods / By Sohaila Ahmed Abdelmonem; Supervised By Prof. Dr. Ehab Farouk El-Kady, Dr. Eman Adel Mostaf, Dr. Alshaimaa Mohammed Alyan.

By: Contributor(s): Material type: TextLanguage: English Summary language: English, Arabic Producer: 2024Description: 100 pages : illustrations ; 25 cm. + CDContent type:
  • text
Media type:
  • Unmediated
Carrier type:
  • volume
Other title:
  • دراسة الارتباط الزلالي المصلي لنظائر السونيتينيب باستخدام الارساء الجزيئي و الطرق الطيفية و الكروماتوجرافية [Added title page title]
Subject(s): DDC classification:
  • 615.19
Available additional physical forms:
  • Issued also as CD
Dissertation note: Thesis (M.Sc.)-Cairo University, 2024. Summary: The interaction between any drug molecule and human serum albumin (HSA) may result in the formation of a stable protein-drug complex that influences the pharmacokinetics of the drug. This study was elucidating the binding interaction of a newly synthesized sunitinib analogue (SA); a promising anticancer drug to the main ligand transporter protein in blood plasma; HSA. Binding mechanism of SA to HSA was studied by multi-spectroscopic techniques such as fluorescence, UV absorption, Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FT-IR) along with molecular docking studies. Fluorescence measurements showed that the fluorescence intensity of HSA was quenched significantly by SA. Decrease in the Stern-Volmer quenching constants (Ksv) value with increasing temperature pointed towards SA-induced static quenching mechanism. An intermediate binding affinity stabilized the SA-HSA complex, as suggested by the binding constant (Kb) value. In addition, Competitive displacement experiments using different site markers such as phenylbutazone, ibuprofen and digitoxin disclosed the binding site of SA as Sudlow's site II (also called sub-domain IIIA) in HSA's hydrophobic pocket, which was further confirmed by molecular docking studies. Changes in the microenvironment around tryptophan (Trp) and tyrosine (Tyr) residues of HSA were anticipated upon SA binding to the protein, as manifested from UV-visible measurements and the synchronous fluorescence spectroscopy measurements Further, conformational change in the protein backbone upon the addition of SA was evident from UV absorption, FT-IR and synchronous fluorescence spectral results. In this work, two high-performance liquid chromatography (HPLC) assays were developed and validated for the determination of SA in human plasma, using vilazodone as an internal standard (IS), and in isotonic phosphate-buffered saline (PBS). Equilibrium dialysis was employed to obtain the unbound fraction of SA. Chromatographic separation was achieved on a Kromasil C18 column (250 × 4.6 mm, 5 μm). An isocratic elution of 20 mmol/L potassium phosphate buffer and 0.1% TEA (pH 7.4): acetonitrile (43: 57, v/v) was selected as the mobile phase for the determination of SA. All of the validation parameters including linearity, extraction recovery, precision, accuracy and stability conformed to the requirements. The calculated results revealed that the percentage of SA bound to protein is 94.42% Summary: قد يؤدي التفاعل بين الدواء وبروتين ألبومين المصل البشري (HSA) إلى تكوين مركب بروتين-دوائي مستقر يؤثر على الحركية الدوائية للدواء. هذه الدراسة توضح التفاعل الملزم لنظير سونيتينيب المركب حديثًا (SA)؛ كدواء واعد مضاد للسرطان مع ألبيومين المصل البشري . تمت دراسة آلية ربط SA بـ HSA بواسطة تقنيات متعددة الطيف مثل قياس امتصاص الأشعة فوق البنفسجية ، وقياسات التحليل الطيفي الفلوري ، والتحليل الطيفي الفلوري المتزامن ، وتقنية التحويل الفلوري الطيفي بالأشعة تحت الحمراء (FT-IR) بالإضافة إلى دراسة محاكاة الالتحام الجزيئي. أظهرت قياسات التحليل الطيفي أن شدة الإضاءة للزلال المصلي البشري (HSA) قد تم إخمادها بشكل كبير بواسطة SA و قد حدث انخفاض في قيمة ثوابت التبريد ستيرن-فولمر (Ksv) مع زيادة درجة الحرارة و التي تشير إلى آلية إخماد ثابتة بدلاً من آلية إخماد ديناميكية . قيمة ثابت الربط (Kb) تقترح أن الارتباط بين نظير السونيتينيب و الزلال المصلي البشري هو متوسط الدرجة و الذي يساعد في استقرار المركب المتكون SA-HSA . بالإضافة إلى ذلك، و باستخدام تجارب الإزاحة التنافسية باستخدام ( فينيل بيوتازون و أيبوبروفين و ديجيتوكسين ) كمجسات خاصة بالموقع الأول و الموقع الثاني و الموقع الثالث على الترتيب يمكن استنتاج أن موقع الربط لنظير السونيتينيب موجوداً بشكل أساسي داخل تجاويف كارهة للماء من المجال الفرعي IIIA (الموقع الثاني) من الزلال المصلي البشري و هو ما تم تأكيده أيضا باستخدام دراسة محاكاة الالتحام الجزيئي. كما تم توقع حدوث تغييرات في البيئة الواقعة في محيط التربتوفان (Trp) والتيروزين (Tyr) من HSA عند ربط SA بالبروتين، كما يتجلى من القياسات المرئية للأشعة فوق البنفسجية و التحليل الطيفي الفلوري المتزامن. علاوة على ذلك، كان التغيير المطابق في البنية الثانوية للبروتين عند إضافة SA واضحًا من امتصاص الأشعة فوق البنفسجية وFT-IR والنتائج الطيفية المتزامنة. في هذا العمل، تم تطوير طريقتين كروماتوغرافيا السائل عالية الأداء (HPLC) والتحقق من صحتهما لتعيين SA في البلازما البشرية، باستخدام فيلازودون كمعيار داخلي (IS)، وفي محلول ملحي بالفوسفات (PBS). تم استخدام طريقة غسيل الغشاء المتوازن لتحديد النسبة المئوية المرتبطة من نظير السونيتينيب مع بروتين البلازما. و قد تم تحقيق الفصل الكروماتوجرافي على عمود سيليكا جل كربون ١٨ كروماسيل. جميع عوامل التحقق بما في ذلك الخطية واسترداد الاستخراج والدقة والاستقرار تتوافق مع المتطلبات. كشفت النتيجة المحسوبة أن النسبة المئوية لنظير السونيتينيب المرتبطة بالبروتين هي ٩٤٬٤٢٪ .
Tags from this library: No tags from this library for this title. Log in to add tags.
Star ratings
    Average rating: 0.0 (0 votes)
Holdings
Item type Current library Home library Call number Status Barcode
Thesis قاعة الرسائل الجامعية - الدور الاول المكتبة المركزبة الجديدة - جامعة القاهرة Cai01.08.05.M.Sc.2024.So.S. (Browse shelf(Opens below)) Not for loan 01010110091169000

Thesis (M.Sc.)-Cairo University, 2024.

Bibliography: pages 85-100.

The interaction between any drug molecule and human serum albumin (HSA) may result in the formation of a stable protein-drug complex that influences the pharmacokinetics of the drug. This study was elucidating the binding interaction of a newly synthesized sunitinib analogue (SA); a promising anticancer drug to the main ligand transporter protein in blood plasma; HSA. Binding mechanism of SA to HSA was studied by multi-spectroscopic techniques such as
fluorescence, UV absorption, Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FT-IR) along with molecular docking studies.
Fluorescence measurements showed that the fluorescence intensity of HSA was quenched significantly by SA. Decrease in the Stern-Volmer quenching
constants (Ksv) value with increasing temperature pointed towards SA-induced static quenching mechanism. An intermediate binding affinity stabilized the SA-HSA complex,
as suggested by the binding
constant (Kb) value. In addition,
Competitive displacement
experiments using different site
markers such as phenylbutazone, ibuprofen and digitoxin disclosed the binding
site of SA as Sudlow's site II (also called sub-domain IIIA) in
HSA's hydrophobic pocket, which was further confirmed by
molecular docking studies. Changes in the
microenvironment around tryptophan (Trp) and tyrosine
(Tyr) residues of HSA were anticipated upon SA binding to the protein, as manifested from UV-visible measurements and
the synchronous fluorescence spectroscopy measurements Further, conformational change in the protein backbone upon
the addition of SA was evident from UV absorption, FT-IR and
synchronous fluorescence spectral results. In this work,
two high-performance liquid chromatography (HPLC) assays
were developed and validated for the determination of SA in
human plasma, using vilazodone as an internal
standard (IS), and in isotonic phosphate-buffered saline (PBS). Equilibrium dialysis was
employed to obtain the unbound fraction of SA. Chromatographic
separation was achieved on a Kromasil C18 column (250 × 4.6
mm, 5 μm). An isocratic elution of 20 mmol/L potassium
phosphate buffer and 0.1% TEA (pH 7.4): acetonitrile (43: 57, v/v) was selected as the mobile
phase for the determination of SA. All of the validation
parameters including linearity, extraction recovery, precision,
accuracy and stability conformed to the requirements.
The calculated results revealed that the percentage of SA bound
to protein is 94.42%

قد يؤدي التفاعل بين الدواء وبروتين ألبومين المصل البشري (HSA) إلى تكوين مركب بروتين-دوائي مستقر يؤثر على الحركية الدوائية للدواء. هذه الدراسة توضح التفاعل الملزم لنظير سونيتينيب المركب حديثًا (SA)؛ كدواء واعد مضاد للسرطان مع ألبيومين المصل البشري . تمت دراسة آلية ربط SA بـ HSA بواسطة تقنيات متعددة الطيف مثل قياس امتصاص الأشعة فوق البنفسجية ، وقياسات التحليل الطيفي الفلوري ، والتحليل الطيفي الفلوري المتزامن ، وتقنية التحويل الفلوري الطيفي بالأشعة تحت الحمراء (FT-IR) بالإضافة إلى دراسة محاكاة الالتحام الجزيئي. أظهرت قياسات التحليل الطيفي أن شدة الإضاءة للزلال المصلي البشري (HSA) قد تم إخمادها بشكل كبير بواسطة SA و قد حدث انخفاض في قيمة ثوابت التبريد ستيرن-فولمر (Ksv) مع زيادة درجة الحرارة و التي تشير إلى آلية إخماد ثابتة بدلاً من آلية إخماد ديناميكية . قيمة ثابت الربط (Kb) تقترح أن الارتباط بين نظير السونيتينيب و الزلال المصلي البشري هو متوسط الدرجة و الذي يساعد في استقرار المركب المتكون SA-HSA . بالإضافة إلى ذلك، و باستخدام تجارب الإزاحة التنافسية باستخدام ( فينيل بيوتازون و أيبوبروفين و ديجيتوكسين ) كمجسات خاصة بالموقع الأول و الموقع الثاني و الموقع الثالث على الترتيب يمكن استنتاج أن موقع الربط لنظير السونيتينيب موجوداً بشكل أساسي داخل تجاويف كارهة للماء من المجال الفرعي IIIA (الموقع الثاني) من الزلال المصلي البشري و هو ما تم تأكيده أيضا باستخدام دراسة محاكاة الالتحام الجزيئي. كما تم توقع حدوث تغييرات في البيئة الواقعة في محيط التربتوفان (Trp) والتيروزين (Tyr) من HSA عند ربط SA بالبروتين، كما يتجلى من القياسات المرئية للأشعة فوق البنفسجية و التحليل الطيفي الفلوري المتزامن. علاوة على ذلك، كان التغيير المطابق في البنية الثانوية للبروتين عند إضافة SA واضحًا من امتصاص الأشعة فوق البنفسجية وFT-IR والنتائج الطيفية المتزامنة. في هذا العمل، تم تطوير طريقتين كروماتوغرافيا السائل عالية الأداء (HPLC) والتحقق من صحتهما لتعيين SA في البلازما البشرية، باستخدام فيلازودون كمعيار داخلي (IS)، وفي محلول ملحي بالفوسفات (PBS). تم استخدام طريقة غسيل الغشاء المتوازن لتحديد النسبة المئوية المرتبطة من نظير السونيتينيب مع بروتين البلازما. و قد تم تحقيق الفصل الكروماتوجرافي على عمود سيليكا جل كربون ١٨ كروماسيل. جميع عوامل التحقق بما في ذلك الخطية واسترداد الاستخراج والدقة والاستقرار تتوافق مع المتطلبات. كشفت النتيجة المحسوبة أن النسبة المئوية لنظير السونيتينيب المرتبطة بالبروتين هي ٩٤٬٤٢٪ .

Issued also as CD

Text in English and abstract in Arabic & English.

There are no comments on this title.

to post a comment.
Share
Cairo University Libraries Portal Implemented & Customized by: Eng. M. Mohamady Contacts: new-lib@cl.cu.edu.eg | cnul@cl.cu.edu.eg
CUCL logo CNUL logo
© All rights reserved — Cairo University Libraries
CUCL logo
Implemented & Customized by: Eng. M. Mohamady Contact: new-lib@cl.cu.edu.eg © All rights reserved — New Central Library
CNUL logo
Implemented & Customized by: Eng. M. Mohamady Contact: cnul@cl.cu.edu.eg © All rights reserved — Cairo National University Library