Thesis (M.Sc.) -Cairo University, 2024.

Bibliography: pages114-132.

The genetic and epigenetic architecture of clinical and subclinical hypothyroidism remains unclear. The present study investigated the impact of long noncoding RNA (LncRNA)-PAX8-AS1 and LAIR-2 genetic variants on the susceptibility of clinical and subclinical hypothyroidism, their influence on LncRNA-PAX8-AS1 and LAIR-2 expression and their potential as hypothyroid biomarkers. Hundred clinical hypothyroid patients, 110 subclinical hypothyroid patients, and 95 healthy controls were recruited within study. Gene expression analysis and genotyping were performed by qPCR. LAIR-2 protein, a proinflammatory mediator, was tested by ELISA. Serum expression of LncRNA-PAX8-AS1 was downregulated, whereas LAIR-2 mRNA and protein levels were upregulated in clinical and subclinical hypothyroid patients compared to healthy controls. LncRNA-PAX8-AS1 rs4848320 and rs1110839 were associated with increased risk of clinical hypothyroidism. On the other hand, LAIR-2 rs2287828 was associated with escalated clinical and subclinical hypothyroid risk. Harboring the rs2287828 T allele augmented the LAIR-2 mRNA expression among the clinical hypothyroid patients, while elevated both LAIR-2 mRNA and protein levels in subclinical hypothyroidism patients. Moreover, the rs4848320-rs1110839-rs2287828 TTT, CTT and CGT haplotypes were associated with increased hypothyroid risk. Serum LncRNA-PAX8-AS1 and LAIR-2 mRNA expression demonstrated superior diagnostic accuracy for clinical hypothyroidism and turned out as independent predictors in multivariate analysis. Conclusively, the LncRNA-PAX8-AS1 and LAIR-2 genetic variants are novel genetic biomarkers of hypothyroidism, altering the LncRNA-PAX8-AS1 and LAIR-2 expression, respectively. LncRNA-PAX8-AS1 and LAIR-2 expression profiles have the potential as effective diagnostic and prognostic indicators of hypothyroidism.

يحتاج تعدد الأشكال الجينية والفوق جينية لقصور الغدة الدرقية السريري والتحت السريري المزيد من البحث والدراسة ومنها هذه الدراسة. تهدف الدراسة إلي معرفة تأثير الأشكال الجينية للحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر LncRNA-PAX8-AS1 ومستقبلات شبيهة الجلوبولين المناعي المرتبط بكريات الدم البيضاء LAIR-2 على احتمالية الإصابة بقصور الغدة الدرقية السريري والتحت السريري فضلا عن تأثيرها على مستويات تعبير كلا من LncRNA-PAX8-AS1 وLAIR-2، وإمكانية استخدامها كمؤشرات لقصور الغدة الدرقية.
تم جمع عينات من 100 مريض يعانون من قصور الغدة الدرقية السريري، و110 مريض بقصور الغدة الدرقية التحت السريري، و95 من الأصحاء كمجموعة ضابطة. وتم تحليل تعبير الجين وتحديد تعدد الأشكال الجينية بإستخدام تقنية البلمرة المتسلسلة. تم قياس أيضا بروتين LAIR-2 بإستخدام تقنية ELISA .
وقد أظهرت النتائج إنخفاضاً في مستويات LncRNA-PAX8-AS1 بين المرضى مقارنة بالأشخاص الأصحاء، بينما أرتفعت مستويات كلا من الحمض النووي الريبوزي الرسول وبروتين LAIR-2 . ووجد أن الأشكال الجينية المتعددة rs4848320 وrs1110839 في LncRNA-PAX8-AS1 مرتبطة بزيادة خطر الإصابة بقصور الغدة الدرقية السريري، بينما أرتبطت rs2287828 في LAIR-2 بزيادة خطر الإصابة بالمرض السريري وتحت السريري. كما أتضح أن وجود اللأليل T للجين rs2287828 يزيد في مستوي تعبير mRNA LAIR-2 عند مرضى قصور الغدة الدرقية السريري، ويزيد كذالك مستوي LAIR-2 mRNA وبروتين LAIR-2 عند مرضى قصور الغدة الدرقية التحت السريري. كما أظهرت الأشكال المشتركة TTT، CTT، وCGT زيادة في خطر الإصابة بالمرض. بشكل مفاجئ.
ومن الجدير بالذكر، وجود دقة تشخيصية لكلا من LncRNA-PAX8-AS1 وmRNA LAIR-2 بشكل أعلى في قصور الغدة الدرقية السريري.
بشكل ختامي، يمكن اعتبار الأشكال الجينية المتعددة في LncRNA-PAX8-AS1 وLAIR-2 مؤشرات جينية جديدة لقصور الغدة الدرقية، والتي تؤثر على مستويات التعبير للجينين، على التوالي. كما أبرزت الدراسة امكانية إستخدام مستويات التعبير لـ LncRNA-PAX8-AS1 وLAIR-2 كمؤشرات تشخيصية وتنبؤية فعالة لقصور الغدة

Issued also as CD

Text in English and abstract in Arabic & English.