Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2025.

Bibliography: pages 106-117.

Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) poses a significant threat to tomato production in Egypt. Visual observations, serological, and molecular techniques were employed to detect and quantify the virus in infected plants. Positive samples were categorized based on symptom severity to explore the variable effects of different TYLCV isolates. Disease Severity Index (DSI), incidence, and virus concentration were analyzed to understand the behavior and impact of these isolates. DAS-ELISA, PCR, and multiplex-PCR (mPCR) targeting the partial coat protein (pCP) gene were used for virus detection. Phylogenetic analysis revealed that the isolates were highly related (99%) to the TYLCV-IL group and moderately related (97%) to the TYLCV-mild group. Betasatellite presence and its association with symptom severity were also investigated. To control the TYLCV, two regions from the viral genome located in the overlap regions between C1/C2 (180bp), and V1/V2(240bp) each alone, and the two regions together (C1/C2+V1/V2) were used for studying their efficiency in working as siRNA to target viral DNA accumulation in plant cells. Constructs were prepared by cloning each of the two regions both in the sense/antisense directions in the binary vector pFGC5941 and Agrobacterium LB4404 was used in transient expression employing the Syringe Spotted technique in tomato plants. However, infiltered plants with the construct containing the two regions C1/C2+V1/V2 and the C1/C2 regions proved to be the best region for initiating PTGS as it inhibited the accumulation of the viral genome as well as inhibiting the appearance of viral symptoms in the tested plants than the V1/V2 construct. It can be concluded that this mechanism can result in higher viral resistance in tomatoes against TYLCV. The study highlights the genetic diversity and biological variability of TYLCV isolates in Egypt and posttranscriptional gene silencing as a virus resistance method. Understanding these characteristics is crucial for developing effective strategies to combat the Tomato Yellowing Leaf Curl Virus in tomato plants.

فيروس تجعد وأصفرار أوراق الطماطم (TYLCV) يشكل تهديدًا كبيرًا لإنتاج الطماطم في مصر. تم استخدام الملاحظات البصرية والتقنيات السيرولوجيه والجزيئية للكشف عن الفيروس وتحديد كميته في النباتات المصابة. تم تصنيف العينات المصابه بناءً على شدة الأعراض لاستكشاف التأثيرات المتغيرة لعزلات TYLCV المختلفة. تم تحليل مؤشر شدة المرض، وincidence، وتركيز الفيروس لفهم سلوك وتأثير هذه العزلات. تم استخدام DAS-ELISA وPCR و(mPCR) multiplex-PCR المستهدفة لجين البروتين الجزئي (pCP) للكشف عن الفيروس. كشف التحليل الجيني أن العزلات كانت مرتبطة بشكل كبير ٩٩)٪( بمجموعة TYLCV-IL ومرتبطة بشكل معتدل ٩٧)٪( بمجموعة .TYLCV-mild تمت أيضًا دراسة وجود البيتا ساتلايت وعلاقته بشدة الأعراض. للتحكم في فيروس TYLCV، تم استخدام منطقتين من الجينوم الفيروسي تقعان في المناطق المتداخلة بين C1/C2 (١٨۰bp) و V1/V2 (٢٤۰bp) كل منهما على حدة، والمنطقتين معًا (C1/C2+V1/V2) لدراسة كفاءتهما في العمل كـ siRNA لاستهداف تراكم الحمض النووي الفيروسي في خلايا النبات. تم تحضير الconstructs عن طريق استنساخ كل من المنطقتين في الاتجاهين ال antisense/sense في
المٶقت التعبير في Agrobacterium LB4404 استخدام وتم pFGC5941 binary vector
باستخدام تقنية الحقن بالإبرة (SST) في نباتات الطماطم. ومع ذلك، أثبتت النباتات التي تم حقنها construct الذي يحتوي على المنطقتين C1/C2+V1/V2 ومنطقة C1/C2 أنها أفضل منطقة لبدء PTGS حيث منعت تراكم الجينوم الفيروسي وكذلك منعت ظهور الأعراض الفيروسية في النباتات المختبرة مقارنة ب construct .V1/V2 يمكن الاستنتاج أن هذه الآلية يمكن أن تؤدي إلى مقاومة فيروسية أعلى في الطماطم ضد .TYLCV تسلط الدراسة الضوء على التنوع الجيني والتنوع البيولوجي لعزلات فيروس TYLCV في مصر، وكذلك على silencing gene posttranscriptional كطريقة لمقاومة الفيروس. فهم هذه الخصائص أمر بالغ الأهمية لتطوير استراتيجيات فعالة لمقاومة فيروس تجعد وأصفرارأوراق الطماطم في نباتات الطماطم.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.