Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2025.

Bibliography: pages 68-74.

Introduction: Nowadays, an increase in multidrug-resistant microorganisms (MDR) has become one of the most vital threats to the healthcare sector. The spread of (MDR) bacteria in society has resulted in an increase in morbidity, mortality, healthcare expenditure, and antibiotic use. In most cases, there are enormous difficulties in treating carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) infection; with the last resort toxic drugs such as tigecycline and colistin.
Recent emerging mechanisms of resistance accumulate through the spread of carbapenem – destroying B-lactamases leaving narrow therapeutic options.
New molecules (β-lactam/β-lactamase-inhibitor combinations) have been developed, including (i) ceftazidime-avibactam and (ii) ceftolozane-tazobactam. Offer effective therapeutic alternatives for the treatment of infections caused by carbapenemase producers.
Aim of work: Detection of the major type of carbapenemases in Enterobacteriaceae and Pseudomonas isolates in our hospital, and to correlate between the type of carbapenemase and invitro susceptibility of cetazidime - avibactam. To test the effectiveness of super imposition E- test of aztereonam with amoxicillin-clavulanate in vitro as a new way of treatment of CRE isolates harboring NDM gene.
Materials and methods: Carbapenem- resistant isolates are defined as pathogens that are resistant to imipenem, meropenem, doripenem or ertapenem. All routine samples were submitted for antimicrobial susceptibility testing, and the results were interpretetd based on clinical and laboratory standards institute 2021 guidelines. Carbapenem-resistant (CR) isolates will be subjected to geneXpert to identify genes of resistance. Isolates with NDM were tested for aztreonam and amoxicillin-clavulanate synergy by the E-test superimposition technique.
Results: A total of 330 carbapenem-resistant (CR) isolates were isolated from patients from Cairo University Hospitals in the period between September 2021 to July 2023. GeneXpert detected one gene in 106 (32.1%) of isolates, 211 (63.9%) of isolates have two genes and only in six (1.8%) of isolates three genes were detected. The most common resistance gene was blaNDM 90.3% followed by blaOXA 68.5%. Isolates harboring NDM gene alone (81 isolates) were subjected to E-test superimposition test, 23 (29.9%) of isolates that were resistant to aztreonam became sensitive after applying the superimposition method, showing a statistically significant improvement (p=0.003). Twenty-five isolates (32.5%) didn’t show any change.
Conclusion and recommendation: The spread of (MDR) bacteria in society and there are enormous difficulties for CRE infection the last resort toxic drugs such as tigecycline and colistin, it’s useful to test resistant genes in organism to recognize resistant pattern and choses appropriate antibiotic in each case.
The use of different combinations of antibiotics based on testing of synergy in the laboratory will help the clinician to choose the suitable antibiotic combination that will shorten hospital stay, decrease cost and improve rates of morbidity and mortality

في ظل الوضع الراهن، أصبح تزايد البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية أحد أخطر التهديدات التي تواجه قطاع الرعاية الصحية. لذا، في معظم الحالات، تواجه عدوى البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية صعوبات جمة، باستثناء بعض الأدوية السامة التي تستخدم كملاذ أخير، مثل التيجيسيكلين والكوليستين .
أدى انتشار البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية في المجتمع إلى زيادة معدلات الاعتلال والوفيات، وزيادة نفقات الرعاية الصحية، وزيادة استخدام المضادات الحيوية. وفقا لجمعية الأمراض
المعدية الأمريكية(IDSA) ، يمكن تعريف مقاومة المركبات المضادة للميكروبات بأنها "واحدة من
أكبر التهديدات لصحة الإنسان في جميع أنحاء العالم." الكاربابينيمات هي مضادات ميكروبية قاتلة للبكتيريا من نوع بيتا لاكتام، ولها فعالية مثبتة في العديد من الالتهابات .
وتستخدم الإيميبينيمات والميروبينيم والدوريبينين على وجه الخصوص في جميع أنحاء العالم. تتراكم آليات المقاومة الناشئة حديثا من خلال انتشار الكاربابينيميات، مما يدمر بيتا لاكتام، مما يقلل من الخيارات العلاجية المتاحة. تم تطوير جزيئات جديدة )تركيبات مثبطات بيتا لاكتام/بيتا لاكتاماز(، بما في ذلك (1) سيفنازيديم-أفيباكتام و(2) سيفتولوزان-تازوباكتام. على الرغم من أن سيفتنازيديم-أفيباكتام وسيفتولوزان-تازوباكتام يقدمان بدائل علاجية لعلاج الالتهابات التي تسببها منتجات الكاربابينيمات الا ان هناك انواع من الكاربابينيميات (MBLs) لا تستجيب لها
هدف العمل :
الكشف عن الأنواع الرئيسية من الكاربابينيميات وتصنيفها ودراسة الانواع الغالبة من الجينات في مصر، اختبار فعالية سيفتازيديم-أفيباكتام، واختبار نجاح إضافة أزتيريونام (E-test) مع اموكسيسيللين
كلافيولينات كطريقة لعلاج MBLsكارببنيميات
المواد والطرق:
تم تجميع 330 من العزلات البكتيريا المقاومة للكاربابينيم المقاومة للإيميبينيم، والميروبينيم،
والدوربينيم من العينات الروتينية المقدمة لاختبار حساسية المضادات الحيوية، وتم تفسير النتائج بناء
على إرشادات معهد المعايرة الاكلينيكية والمخبرية (CLSI) لعام .2٠21خضعت العزلات المجمعة
لاختبار جينات المقاومة بالخبير الجينى (genexpert) لتحديد نوع جين المقاومة. خضعت العزلات


التي تحتوي على جين NDM لاختباراضافى لدراسة التغيير والتحسن فى اقل تركيز من الازتيريونام
مطلوب للقضاء على االبكتيريا الحاملة لهذا الجين بعد وضع الاموكسيسيللين كلاقيولانيك لمدة 10 دقائق )بطريقة التراكب(
النتيجة:
فحصنا 33٠ عزلة من بكتيريا CRE؛ وكانت بكتيريا spp .Klebsiella هي الأكثر شيوعا،
تليها بكتيريا spp .Pseudomonas ثم coli .E. اكتشف GeneXpert جينا واحدا في 1٠6 عزلات
(%32.1)، و211 عزلة (%63.9) تحتوي على جينين، وفي ست عزلات فقط (%1.8) تم اكتشاف
ثلاثة جينات. وكان جين blaNDM هو الأكثر شيوعا بنسبة %9٠.3، يليه blaOXA بنسبة .%68.5 خضعت العزلات التي تحتوي على جين NDM وحده 81) عزلة( لاختبار التراكب E-test، وأصبحت 23 عزلة (%29.9) من العزلات المقاومة للأزتريونام حساسة بعد تطبيق طريقة التراكب، مما أظهر تحسنا ذا دلالة إحصائية .(p=0.003) ولم تظهر 25 عزلة (%32.5) أي تغيير في قابلية الأزتريونام.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.