Thesis (Ph.D)-Cairo University, 2025.

Bibliography: pages 108-111.

Background: Cell-free DNA (cfDNA) has the potential to provide non- invasive diagnostic assays and practical biomarkers for predicting the outcome of assisted reproductive technology (ART) procedures. Aim of the study: To investigate the association between cf-DNA concentration in individual follicular fluid and oocyte maturity and embryo quality in patients undergoing Intra Cytoplasmic Sperm injection (ICSI).
Patients and met hods: This prospective observational clinical study was done at Ain Shams University, A maternity hospital (IVF Unit), and a private ICSI center from May 2019 to June 2020. Our study used the ALU- QPCR technique to accurately measure the cell-free DNA (cfDNA) level in 35 follicular fluid samples from 15 patients undergoing ICSI.
Results: Our results displayed the range of cfDNA from 0.24 to 3.89 (ng/ ml), with a mean of 2.06 ± 0.73. The DNA integrity (Q247/Q115) ranged from 0.09 to 0.79, with a mean of 0.44 ± 0.18. Our findings reveal a statistically significant association between the levels of cell-free DNA and patient oocytes to yield an Embryo, top grade Embryos, Fragmentation rate of the embryo, and number of blastomeres (P-values; p=0.037, p<0.001, p<0.001, and p=0.019, respectively ). A statistically negative correlation between cfDNA (ng/ml) and follicle size in mm (p-value < 0.05). However, no significant correlation was observed for the other parameters (basic hormonal profile, AFC number of oocytes, and the number of fertilized oocytes), with a p-value > 0.05. The study found that the levels of cfDNA and 17 -estradiol had a non-significant negative correlation (p-value > 0.05). Our study found that the level of cfDNA in follicular fluid is strongly associated with the quality of embryos on Day 3.
Conclusion: High levels of cfDNA in follicular fluid may indicate poor follicular milieu. Measuring cfDNA can evaluate oocyte and embryo competence. It can be a non-invasive test to assess embryo quality along with morphological criteria.

عرضت نتائجنا نطاق cfDNA من 0.24 إلى 3.89 (نانوغرام/ مل)، بمتوسط 2.06 ± 0.73. تراوحت سلامة الحمض النووي (Q247/Q115) من 0.09 إلى 0.79، بمتوسط 0.44 ± 0.18. تكشف النتائج التي توصلنا إليها عن وجود علاقة ذات دلالة إحصائية بين مستويات الحمض النووي الحر خارج الخلايا (cfDNA) مع بويضات المريضات التى أجنة والأجنة من الدرجة الأولى ومعدل التجزئة الجنين وعدد القسيمات المنقسمة (القيم P؛ p=0.037، p<0.001، ع <0.001، و ع = 0.019، على التوالي). هناك علاقة سلبية إحصائيا بين الحمض النووي الحر خارج الخلايا (cfDNA) (نانوغرام / مل) وحجم الحويصلات بالملليمتر (القيمة p <0.05). ومع ذلك، لم يلاحظ أي ارتباط كبير بالنسبة للمعايير الأخرى (الملف الهرموني الأساسي، وعدد البويضات AFC، وعدد البويضات المخصبة)، مع قيمة p > 0.05. وجدت الدراسة أن مستويات cfDNA و17-استراديول كان لها علاقة سلبية غير هامة (قيمة p > 0.05). وجدت دراستنا أن مستوى cfDNA في السائل الجريبي يرتبط بقوة بجودة الأجنة في اليوم الثالث.

Issues also as CD.

Text in English and abstract in Arabic & English.